RRNA基因

作品数：990被引量：5951H指数：27
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Magnetospira sp. QH-2 MamK蛋白的结构和系统进化分析
《海洋科学》2016年第7期1-7,共7页滕兆洁 张文燕 刘佳 董逸 陈一然 潘红苗 杜海舰 王明玲 徐丛 肖天 
国家自然科学基金(41206150,41276170,41330962)~~
Magnetospira sp.QH-2是一株分离自黄海潮间带的海洋趋磁螺菌,该菌磁小体排列不整齐,并且磁小体链内某些区域排列疏松,推测与其磁小体岛上的mam K编码的Mam K蛋白相关。mam K开放阅读框大小为1086 bp,编码361个氨基酸,Mam K蛋白属于NBD_...
关键词：MamK 系统进化 16S RRNA基因 磁小体岛 结构 
三亚天涯海角潮间带趋磁细菌特性被引量：3
《海洋科学》2016年第7期8-16,共9页徐丛 陈海涛 张文燕 陈一然 董逸 潘红苗 杜海舰 王明玲 刘佳 滕兆洁 肖天 
国家自然科学基金项目(41276170;41206150;41330962);三亚市院地科技合作项目(2014YD02);国家基金委-山东省联合基金项目"海洋生态与环境科学"(U1406403)~~
在三亚天涯海角潮间带沉积物中发现了一定量的海洋趋磁细菌,最大丰度可达100个/cm3。透射电子显微镜（TEM）观察发现该区域趋磁细菌绝大多数为趋磁球菌。磁小体形状单一,皆为棱柱形；磁小体排列方式多样,以链状排列为主,包括单链、双链...
关键词：潮间带 趋磁细菌 多样性 磁小体 16S RRNA基因 
条斑紫菜SSU中内含子分析
《海洋科学》2015年第3期12-18,共7页李星辰 徐佳杰 林中姮 沈颂东 
国家自然科学基金资助项目(41276134)
根据GenBank中已知的条斑紫菜(Porphyra yezoensis)SSU和LSU r RNA基因序列分别设计引物,分别以混合个体和单个个体的基因组DNA以及c DNA为模板进行扩增,测序分析后推测SSU r RNA基因中的内含子转录后加工可能仍被保留,而在LSU r RNA基...
关键词：条斑紫菜(Porphyra yezoensis) RRNA基因 内含子 同质性 系统发育 
基于16s rRNA基因片段的长臂虾科系统发育初步研究被引量：3
《海洋科学》2014年第7期7-13,共7页甘志彬 李新正 
国家自然科学基金面上资助项目(41376163)
长臂虾科(Caridea:Palaemonidae)是真虾类中最大的科级单元之一,为了探索长臂虾科内部的系统演化关系,作者采用从Genbank中下载的长臂虾科两亚科(Palaemoninae,Pontoniinae)14属30种长臂虾的线粒体16s rRNA基因序列片段,以鼓虾科(Alphei...
关键词：长臂虾科(Palaemonidae) 分子系统发育 16s RRNA基因 
海绵和海鞘中可培养放线菌的分离与多样性比较被引量：1
《海洋科学》2013年第7期53-62,共10页杨琪 信艳娟 Christopher FRANCO 柯才焕 张卫 
海洋公益性行业科研专项经费资助项目(No.201305016)
在相同的分离培养条件下,为比较地域差别较大的福建海域海绵动物(山海绵Mycale sp.和网架海绵Stylissa sp.)和海南海域海鞘动物(皱瘤海鞘Styela plicata和乳突皮海鞘Molgula manhattensis)之间可培养放线菌多样性的差异,作者采用5种放...
关键词：山海绵(Mycale SP ) 皱瘤海鞘(Styela plicata) 放线菌 RFLP 16S RRNA基因 
基于16S rRNA部分序列探讨部分鳚亚目鱼类的分子系统进化关系被引量：6
《海洋科学》2012年第9期89-95,共7页张源真 王伟 姜志强 张钊 
辽宁省重大科技公关项目(2008203002);辽宁省教育厅计划项目(2009A175)
通过PCR扩增获得了3科5属6种中国黄渤海海域的鳚亚目(Blennioidei)鱼类的线粒体16S rRNA基因序列片段约669bp碱基,结合来自GenBank的5种鳚亚目其他科鱼类的相应基因片段,并以眼斑雪冰鱼(Chionodraco rastrospinosus)为外群,生成供系统...
关键词：鳚亚目(Blennioidei) 线粒体DNA 16S RRNA基因序列 系统发育 
起始pH值对海洋混合菌群产氢量的影响
《海洋科学》2011年第9期43-48,共6页刘洪艳 王广策 
国家自然科学基金项目(40906074);天津市科技支撑计划重点项目(07ZCGYSH03400);天津市海洋资源与化学重点实验室开放基金项目(200912)
对采自天津潮间带的污泥进行热休克处理,厌氧条件下富集混合菌群进行产氢试验;设置起始pH从4.0到8.0(间隔0.5个单位),比较混合菌群在不同pH培养条件下产氢量;利用变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析不同起始pH培养条件下的混合菌群组成。结果表...
关键词：起始pH 产氢量 变性梯度凝胶电泳 16S RRNA基因 Fe-氢酶基因 
矛尾复虾虎鱼溃疡病病原创伤弧菌的鉴定被引量：7
《海洋科学》2011年第7期20-25,共6页毕可然 张晓君 梁利国 阎斌伦 
江苏省水产三项工程资助项目(PJ2010-58);江苏省自然科学基金资助项目(BK2009163);江苏省生物多样性与生物技术重点实验室开放基金资助项目(164070302104)
2009年8月江苏连云港赣榆县多家虾蟹养殖塘混养的矛尾复虾虎鱼(Synechogobius hasta)大量死亡,从病鱼深层溃烂组织及肝脏中分离出大量优势生长的细菌,人工感染试验证明分离菌对虾虎鱼的半数致死量(LD50)为1.63×106 cfu/g。对分离菌进...
关键词：矛尾复虾虎鱼(Synechogobius hasta) 创伤弧菌(Vibrio vulnificus) 16S RRNA基因 gyrB基因 
中国15种海参的分子系统发育和骨片演化的分析被引量：8
《海洋科学》2011年第5期66-72,共7页文菁 胡超群 范嗣刚 
国家科技支撑计划项目(2009BAB44B02);广东省海洋渔业科技项目(A200899E02,A200901E01);广东省科技计划项目(2007A020300007-15);广东省省院合作计划项目(2009B091300155);广西自治区重点科技项目(桂科攻0815006-2)
基于线粒体16S rRNA基因部分序列,对我国15种海参的分子系统发育进行了分析。结果表明,片段长度约为570bp,A+T的平均含量为54.7%。15种海参的遗传距离在0.041(花刺参与糙刺参)至0.327(红腹海参与花刺参)之间,不同海参种类间的遗传距离...
关键词：海参 16S RRNA基因 系统发育 骨片演化 
从患病黑鲪分离病原菌HV0811的鉴定及其系统发育分析被引量：6
《海洋科学》2010年第5期48-54,共7页孟鹏 战文斌 绳秀珍 
国家高技术研究发展计划(863)项目(2006AA100306);国家自然科学基金项目(30771648)
从症状为渍疡瞎眼的养殖黑鲪（Sebastodes fuscescens）病灶处分离到3株优势菌HV0811、PT0811和JH0811，以肌肉注射人工感染实验证实菌株HV0811为致病菌，其对黑鳕的半致死浓度为7．15×10^5CFu／尾。通过对致病菌的形态学观察、生理生...
关键词：黑鲪(Sebastodes fuscescens) 溃疡 瞎眼 哈维氏弧菌(Vibrio harveyi) 16S RRNA基因 HSP60基因 
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