SELDI-TOF

作品数：32被引量：134H指数：6
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相关机构：杭州电子科技大学浙江省肿瘤研究所解放军第150医院浙江省肿瘤医院更多>>
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概率主成分分析联合支持向量机的前列腺SELDI-TOF质谱数据分析方法研究
《分析测试学报》2016年第1期91-95,共5页李肃义 嵇梦颖 徐壮 王跃洋 申博文 熊文激 
国家自然科学基金(201101071);吉林省自然科学基金(20140101063JC)
基于前列腺癌检测中获取的表面增强激光解吸/离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)数据,提出一种概率主成分分析(PPCA)联合支持向量机(SVM)的分类方法。对临床322例血清样本的质谱数据进行特征提取,以随机选取训练样本集(225例)构造SVM判...
关键词：前列腺癌 概率主成分分析 支持向量机 SELDI-TOF-MS 
基于SELDI-TOF蛋白质谱的三阴性乳腺癌预后分析
《航天医学与医学工程》2015年第4期275-279,共5页余庆邦 范明 郑智国 许沈华 陈占红 王晓稼 厉力华 
国家自然科学基金资助项目(61271063);国家重点基础研究发展计划资助(2013CB329502);浙江省自然科学基金LQ14F010011);浙江省科技厅项目(2012C13019-1;2013C332-05)
目的使用SELDI-TOF蛋白质质谱,分析和寻找影响三阴性乳腺癌预后的新指标。方法采集浙江省肿瘤医院提供的三阴性乳腺癌样本51例,每例样本均包含病理及质谱数据。将病例数据分为死亡或复发组与无复发组,并统计检验两组间病理因素有无显著...
关键词：蛋白质质谱 三阴性乳腺癌 病理因素 预后因素 
不同培养基对SELDI-TO FMS细菌蛋白指纹图谱的影响
《中国微生态学杂志》2015年第6期672-676,共5页张航烽 杨永长 肖代雯 黄文芳 
目的检测不同培养基对细菌蛋白SELDI-TOF MS指纹图谱的影响。方法 3株参考菌株分别接种在不同培养基中,利用SELDI-TOF MS检测蛋白指纹图谱,分析其异同。结果在所有培养基中参考菌株ATCC 12600、ATCC 25922和ATCC 27853蛋白质谱图恒定表...
关键词：细菌 培养基 SELDI-TOF MS 
基于SELDI-TOF蛋白质谱分析的乳腺癌TNM分期研究被引量：2
《生物医学工程研究》2015年第1期7-10,共4页余庆邦 范明 王晓稼 郑智国 许沈华 陈占红 厉力华 
国家自然科学基金资助项目(61271063);国家重点基础研究发展计划项目(2013CB329502);浙江省自然科学基金资助项目(LQ14F010011);浙江省科技厅项目(2005C30001;2012C13019-1;2013C332-05)
运用浙江省肿瘤医院提供的乳腺癌临床SELDI-TOF质谱数据,依据临床TNM分期,探索肿瘤大小、淋巴结受累情况在蛋白质质谱数据表达中的差异。对预处理后的质谱数据运用近邻传播聚类和零空间LDA算法进行特征选择,再用SVM-RFE算法选择相关生...
关键词：乳腺癌 蛋白质质谱 TNM分期 特征选择 生物标志物 
SELDI-TOF/MS分析原发性肝癌TACE治疗前后血清蛋白质差异表达谱被引量：3
《中国现代医学杂志》2014年第5期51-55,共5页齐义军 马瑾 张天 王明 晁玮霞 朱晗 刘瑞敏 马远方 Philip Johnson 
国家自然科学基金(No:81072039);河南省高等学校青年骨干教师资助计划项目(No:2012-2014)
目的分析原发性肝癌患者经导管肝动脉化疗栓塞（TACE）治疗后血清蛋白质4a．es~图谱的变化。方法应用SELDI—TOF／MS技术和IMAC30蛋白质芯片采集50例肝癌患者TACE治疗前后肝癌患者的血清蛋白质质谱，Biomarkerwizard软件分析差异表达蛋...
关键词：原发性肝癌 SELDI-TOF MS 蛋白质芯片 经导管肝动脉化疗栓塞 
应用SELDI-TOF-MS技术筛选结肠癌术后原位复发患者的血清诊断标志物
《胃肠病学和肝病学杂志》2013年第9期924-926,共3页王志红 漆永平 谢小平 华为民 
目的寻找结肠癌术后原位复发患者的特异性生物标志物。方法采用SELDI-TOF-MS技术(表面增强激光解析电离飞行时间质谱)对比分析30例结肠癌术后原位复发患者和30例结肠癌术后无复发患者的血清蛋白质谱,用Biomarker Wizard软件分析获得的...
关键词：SELDI-TOF—MS技术 结肠癌 血清蛋白质谱 复发 
运用近邻传播聚类分析进行SELDI-TOF蛋白质谱特征选择被引量：5
《中国生物医学工程学报》2013年第1期14-20,共7页杨合龙 祝磊 韩斌 厉力华 郑智国 孟旭莉 
国家自然科学基金(60801054;60801055);国家杰出青年基金(60788101)
针对如何有效分析高通量SELDI-TOF质谱数据以及筛选与肿瘤相关的蛋白质位点,提出一种基于近邻传播聚类分析的特征选择方法。首先利用t-test对SELDI数据进行初筛,然后利用近邻传播聚类分析以及零空间LDA对数据进行降维和去相关处理,最后...
关键词：蛋白质质谱 近邻传播聚类分析 特征选择 生物标志物 
SELDI-TOF质谱技术分析家族性腺瘤性息肉病血清蛋白质谱被引量：1
《河南科技大学学报（医学版）》2012年第4期251-252,共2页蔡丰波 魏东 张长山 
目的研究家族性腺瘤性息肉病患者血清蛋白质的变化,建立灵敏度和特异度高的家族性腺瘤性息肉病诊断模型。方法利用SELDI-TOF-MS技术对18例家族性腺瘤性息肉病患者术前、术后血清蛋白质分别进行检测,IMAC30芯片结合蛋白质后,用蛋白芯片...
关键词：家族性腺瘤性息肉病 生物标记物 蛋白质组学 质谱 表面增强激光解吸离子化时间飞行质谱 
基于QPSO-SVM算法的SELDI-TOF质谱数据分析被引量：1
《计算机应用与软件》2011年第1期57-60,共4页张蓉 冯斌 孙俊 
国家自然科学基金(60474030)
生物信息学领域的微阵列分析、质谱数据分析等大规模机器学习问题的不断涌现,对已有的特征选择算法提出了严峻的挑战,迫切需要研究适应于高维小样本特征的、准确性和运行效率等综合性能较好的、新的特征选择算法。将基于量子粒子群算法(...
关键词：表面增强激光解析电离飞行时间质谱 粒子群优化算法(PSO) 量子粒子群算法(QPSO) 特征选择技术 生物标记物 
SELDI-TOF质谱技术分析乳腺癌血清蛋白质谱的变化被引量：2
《河南科技大学学报（医学版）》2010年第4期253-255,共3页蔡丰波 张长山 魏东 
目的研究乳腺癌患者血清蛋白质的变化,建立灵敏度和特异度高的乳腺癌诊断模型。方法利用SELDI-TOFMS技术对194例乳腺癌患者和60例正常人血清蛋白质分别进行检测,IMAC30芯片结合蛋白质后,用蛋白芯片仪读取数据,分析得到区分乳腺癌患者和...
关键词：乳腺肿瘤 生物标记物 蛋白质组学 质谱 表面增强激光解吸离子化时间飞行质谱 
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