测序方法

作品数:135被引量:410H指数:10
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一种病原宏基因高通量测序方法的开发与性能确认
《临床检验杂志》2025年第1期1-6,共6页柴海云 黄月眉 谭海燕 王威 
佛山市自筹经费类科技计划项目(2020001005263)。
目的建立一种病原宏基因高通量测序方法,并验证其检测性能。方法筛选不同核酸投入量的文库构建条件,分别测试5 ng、50 ng、100 ng 3种核酸投入量,20 min、25 min、30 min 3种片段化时间,7个、5个、3个3种扩增循环数,通过分析文库浓度和...
关键词:病原微生物 高通量测序 性能验证 
质粒DNA Fast NGS测序方法的开发和应用
《生物技术进展》2024年第4期594-600,共7页宋辉 曹文刚 肖晓文 杜军 
鄂州市科学技术局2022年科技计划项目-重点研发专项。
质粒DNA是最常用的基因运载工具,在基因合成技术中扮演着至关重要的角色。如何实现合成质粒DNA的准确且快速检测,是确保基因组完整性和提高基因合成效率的关键。尽管基于一代DNA的测序方法,其准确性已成为行业标准,但在检测通量、检测...
关键词:Fast NGS 质粒DNA 高通量测序 TN5 
基于Sanger测序方法检测赛鸽竞翔相关基因的单核苷酸多态性
《福建农业科技》2024年第7期1-9,共9页杨理程 吴锐琼 李培健 王冰梅 黄镇 
福建省自然科学基金项目(2022J01637)。
大量研究发现赛鸽中LDHA、F-KER、DRD4、MSTN和CRY1这5个基因存在单核苷酸多态性,并与归巢能力相关,成为分子辅助育种的潜在SNP标记。当前的检测方法仍以传统的RFLP为主,尚未报道Sanger测序的应用。通过建立一种基于Sanger测序技术的检...
关键词:赛鸽 Sanger测序法 基因分型 
基因测序方法在ABO血型鉴定中的应用
《重庆医学》2024年第11期1690-1694,共5页刘建成 邵峰 步晓筠 杨洁 毛小尹 海静 
宁夏卫生健康系统科研课题项目(2022-NWKY-040)。
目的 建立一种ABO血型基因测序方法,在DNA水平对突变位点进行分析,以准确鉴定ABO血型。方法 选取20份血液标本,其中18份血清学鉴定为ABO正常血型,2份为ABO亚型。利用序列特异性引物PCR(PCR-SSP)方法,对ABO血型基因第6、7外显子进行扩增...
关键词:ABO血型 基因测序 ABO亚型 ABO基因 外显子 
一种基于多重PCR的基孔肯雅病毒全基因组高通量测序方法的建立
《中华预防医学杂志》2024年第4期489-496,共8页苏文哲 李岩 陆维智 谢华萍 李魁彪 狄飚 聂凯 王环宇 张周斌 许松涛 
广州市医学重点学科(2021-2023-11);广州市科技计划项目(202002030117、2023A03J0447)。
目的:建立基于多重PCR的基孔肯雅病毒全基因组高通量测序方法。方法:通过NCBI网站检索和下载CHIKV的各基因型序列,经序列比对筛选出备选参考序列,使用Primalscheme和Geneious Prime等软件进行引物方案的设计、筛选和人工优化,并使用7份C...
关键词:基孔肯雅病毒 全基因组测序 多重PCR 高通量测序 
基于16S rDNA高通量测序方法检测猪舍环境微生物群落多样性
《畜牧与饲料科学》2023年第6期100-107,共8页樊梅娜 张修 王丽荣 
山东省外专双百计划(WST2020025)。
[目的]研究猪舍环境微生物群落多样性,了解不同类型猪舍环境中细菌群落的结构差异以及潜在的致病菌属。[方法]利用空气沉降法采集规模化猪场妊娠猪舍、保育猪舍、分娩猪舍的环境微生物样本,每种类型猪舍选取3栋猪舍采样,共9个样本。采用...
关键词:16S rDNA高通量测序 猪舍 环境微生物 群落分析 多样性 
基于多重PCR的HAdV-3全基因组高通量测序方法的建立
《中华实验和临床病毒学杂志》2023年第5期530-536,共7页林琦 黄枝妙 翁育伟 何文祥 游丽斌 
福建省卫生健康科研人才培养项目(2022QNA062);福建省卫生健康中青年科研重大项目(2021ZQNZD006)。
目的建立基于多重PCR的人3型腺病毒(human adenovirus 3,HAdV-3)全基因组高通量测序方法,提高HAdV-3全基因组测序效率和成功率。方法设计适用于HAdV-3全基因组扩增的多重PCR引物,通过多重PCR扩增HAdV-3全基因序列,使用琼脂糖凝胶电泳初...
关键词:人3型腺病毒 多重PCR 全基因组序列 高通量测序 
基于综合生物信息学和单细胞测序方法揭示红花-丹参治疗冠心病的生物学和免疫学机制被引量:1
《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》2023年第10期796-812,共17页魏东升 刘孝生 李路珍 齐佳杰 王雨轩 张哲 
National Administration of Traditional Chinese Medicine Supporting Project for Young Qi Huang Scholars (Grant No. 20201A2180)。
本文基于生物信息学、网络药理学与单细胞测序探讨红花-丹参治疗冠心病(CAD)的机制。采用Comparative Toxicogenomics Database、Swiss target prediction、Binding Database Home、TargetNet四个数据库筛选出羟基红花黄色素、丹参酮、...
关键词:红花-丹参 冠状动脉粥样硬化性心脏病 生物信息学 单细胞测序 网络药理学 
m6A-SAC-seq在单核苷酸分辨率水平检测RNAm6A修饰
《复旦学报(医学版)》2023年第3期439-446,共8页孟瀚哲 何维志 胡璐璐 
国家重点研发计划(2021YFA1100400)。
目的建立m6A特异性烯丙基标记测序(m6A-selective allyl chemical labeling and sequencing,m6A-SAC-seq)实验方法体系,在单核苷酸分辨率水平对RNA的N6-甲基腺苷(m6A)修饰进行检测。方法m6A烯丙基标记测序(m6A-SAC-seq)使用特异性甲基...
关键词:RNA甲基化 m6A甲基化 单核苷酸分辨率 m6A-SAC-seq 测序方法 
基于二代测序技术建立覆盖我国主要流行亚型的HIV-1近全长基因组测序方法被引量:2
《中国艾滋病性病》2023年第5期509-516,共8页张瑞凤 刘静 刘佩 张鑫 王宇 丁梦君 丁海锋 姚均 金聪 
国家病原微生物资源库-NPRC-32;北京科委课题(D171100006717001)。
目的 基于二代测序技术建立一种适合我国主要流行亚型的HIV-1近全长基因组扩增和测序方法,并优化建立标准检测流程,为HIV-1的全基因组序列鉴定和相关系统进化分析等应用提供重要技术手段。方法 基于我国HIV-1主要流行亚型设计扩增引物,...
关键词:艾滋病病毒 近全长基因组扩增 二代测序 
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