蛋白质编码基因

作品数：22被引量：34H指数：3
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相关领域：生物学更多>>
相关作者：李春辉何冠华王天宇李永祥张登峰更多>>
相关机构：中国农业大学中国农业科学院作物科学研究所中国科学院遗传与发育生物学研究所中国科学院更多>>
相关期刊：《贵州医科大学学报》《南开大学学报（自然科学版）》《浙江临床医学》《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》更多>>
相关基金：国家自然科学基金中央财政支持地方高校发展专项资金中国博士后科学基金江苏省“青蓝工程”基金更多>>
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基于机器学习分析的浸润性乳腺癌蛋白质编码基因的标志物鉴定被引量：1
《中国医学科学院学报》2024年第2期147-153,共7页武乐 闵开元 柳江枫 梁万丰 杨晔宏 胡刚 杨俊涛 
国家自然科学基金(31970649);中国医学科学院医学与健康科技创新工程(CIFMS2021-I2M-1-057、CIFMS2021-12M-1-001)。
目的应用随机森林(RF)、极限梯度提升算法(XGBoost)、轻量的梯度提升机(LightGBM)、类别型特征提升(CatBoost)4种机器学习算法分析浸润性乳腺癌转录组表达数据,筛选与浸润性乳腺癌预后相关的生物标志物。方法通过癌症基因组图谱公共数...
关键词：浸润性乳腺癌 生物标志物 蛋白质编码基因 UGP2 C3orf80 SPC25 
装饰短蚋线粒体全基因组序列测定与分析
《贵州医科大学学报》2023年第8期881-887,共7页孙谦 杨明 温小军 
国家自然科学基金项目(31860324)。
目的测定和注释装饰短蚋(Simulium ornatum)线粒体全基因组序列,并在线粒体基因组水平上分析短蚋亚属与蚋亚属、纺蚋亚属之间的系统发育关系。方法采用长PCR扩增加引物步移法和总DNA测序法对装饰短蚋线粒体全基因组序列进行扩增测序,应...
关键词：装饰短蚋 线粒体基因组 密码子 蛋白质编码基因 系统发育关系 DNA条码 控制区 
长链非编码RNA共表达基因在卵巢上皮性癌的生物学作用
《浙江临床医学》2023年第4期478-480,484,共4页李耀威 寿坚 陈龙 
杭州市萧山区科技计划资助项目(2020211)。
目的采用生物信息学方法评估与长链非编码RNA共表达相关基因在卵巢上皮性癌(卵巢癌)的生物学作用。方法通过数据库检索、perl语言及R语言平台利用皮尔森相关系数和z-test检验目标lncRNA表达水平与蛋白质编码基因(PCG)之间的相关性;随后...
关键词：卵巢癌 RNA 长链非编码 蛋白质编码基因 生物信息 生存分析 
蝽次目线粒体基因组特征及系统发育关系重建
《太原师范学院学报（自然科学版）》2023年第1期85-92,共8页许乐 陈小艳 孙辰琳 李敏 袁娟娟 杨焕焕 张丹丽 
山西省基础研究计划(202103021223318);山西省高等学校科技创新项目(2019L0810);太原师范学院大学生创新创业训练项目(CXCY2162);山东省自然科学基金青年项目(ZR2021QC229,ZR2020QC054)。
目前GenBank数据库共收录122种蝽次目昆虫全线粒体基因组序列,比较分析其13个蛋白质编码基因的密码子使用情况、核苷酸进化速率及核苷酸序列信息位点等序列特征,归纳蝽次目tRNA基因的重排现象,同时基于蛋白质编码基因用贝叶斯法和最大...
关键词：蝽次目 线粒体基因组 蛋白质编码基因 基因重排 系统发育 
植物B染色体的分子结构组成及遗传机制研究进展被引量：1
《遗传》2022年第9期772-782,共11页吴丹丹 朱明昆 方忠艳 马伟 
江南大学基本科研计划青年基金项目(编号:2050205)资助~~。
B染色体(B chromosomes, Bs)是独立于常规染色体即A染色体(A chromosomes, As)的一类特殊染色体。长期以来,由于实验方法的限制和B染色体可有可无的性质,B染色体一直被认为是完全由异染色质组成且不携带任何功能基因。随着高通量测序技...
关键词：B染色体 DNA组成 转录调控 蛋白质编码基因 
缺齿甲胁虱线粒体基因组测序与分析被引量：2
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》2022年第2期194-203,210,共11页孙佳宁 陈婷 董文鸽 
国家自然科学基金(31660314,32060143)。
目的对缺齿甲胁虱线粒体基因组序列进行测定与分析,了解甲胁虱属线粒体基因组的结构特征和变异情况。方法在大理苍山世界地质公园捕获大绒鼠,全捕法采集大绒鼠体表吸虱,鉴定后选取缺齿甲胁虱用组织DNA提取试剂盒提取单只缺齿甲胁虱DNA...
关键词：缺齿甲胁虱 线粒体微环染色体 RNA基因 蛋白质编码基因 非编码区 
基于叶绿体基因组探讨桃金娘目及其近缘类群的系统发育关系被引量：3
《广西植物》2021年第1期68-80,共13页王雪芹 宋卫武 肖建加 李超琼 刘红占 
国家自然科学基金青年基金(81803388);河南省重点研发与推广专项(182102310617);河南省高等学校重点科研项目(15A180066)。
该研究基于叶绿体基因组数据,对桃金娘目(6科44属97种)及其近缘类群(牻牛儿苗目2科5属25种)的系统发育关系进行了分析。结果表明:(1)桃金娘目基因组大小为152~171 kb,包括的蛋白质编码基因数目为74~90个;牻牛儿苗目基因组大小为116~242 ...
关键词：牻牛儿苗目 桃金娘科 野牡丹科 蛋白质编码基因 系统发育 
蝎蝽次目线粒体蛋白质编码基因的比较研究
《山西农业大学学报（自然科学版）》2020年第4期66-72,共7页张丹丽 李敏 张苗苗 田菁 李悦锐 张虎芳 
山西省高等学校科技创新项目(2019L0810);太原师范学院第四批青年学术骨干。
[目的]本研究旨在对蝎蝽次目11科线粒体基因组中13个蛋白质编码基因(PCG)的密码子使用情况、A+T含量、氨基酸序列和核苷酸序列信息位点以及核苷酸进化速率进行比较研究,同时基于13个PCG序列构建蝎蝽次目系统发育树。[方法]通过GenBank...
关键词：蝎蝽次目 线粒体基因组 蛋白质编码基因 比较研究 系统发育 
枣食芽象甲线粒体基因组全序列测定与系统发育分析被引量：8
《昆虫学报》2019年第11期1305-1314,共10页张锋 洪波 王远征 李英梅 陈志杰 
陕西省科技统筹创新工程项目(2013KTZB-03-01);陕西省科学院重大科技项目(2013K-02)
【目的】从线粒体基因组水平上探讨枣食芽象甲Scythropus yasumatsui与近缘种的系统发育关系。【方法】利用Illumina MiSeq测序平台对枣食芽象甲线粒体基因组进行测序,对基因组序列进行拼装、注释和特征分析;利用贝叶斯法和最大似然法...
关键词：鞘翅目 象甲科 枣食芽象甲 近缘种 线粒体基因组 蛋白质编码基因 系统发育 
天津完成世界首个花椰菜基因组测序 可缩短育种周期及选育新品种
《中国蔬菜》2018年第10期49-49,共1页天津日报 
据《天津日报》2018年9月6日报道,天津科润农业科技股份有限公司蔬菜研究所花椰菜育种团队完成了世界上第一个花椰菜全基因组测序。我国是世界上花椰菜种植面积最大、总产量最高的国家。据2016年FAO报告,全世界花椰菜种植面积约134.33万...
关键词：全基因组测序 花椰菜 世界 育种周期 天津 蛋白质编码基因 品种 选育 
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