蛋白质功能

作品数：241被引量：494H指数：9
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基于PPI网络与机器学习的蛋白质功能预测方法被引量：7
《计算机应用》2018年第3期722-727,共6页唐家琪 吴璟莉 
国家自然科学基金资助项目(61363035;61762015);广西自然科学基金资助项目(2015GXNSFAA139288);"八桂学者"工程专项;广西多源信息挖掘与安全重点实验室系统性研究基金资助项目(14-A-03-02;15-A-03-02);广西研究生教育创新计划项目(XYCSZ2017067)~~
针对现有的基于蛋白质相互作用(PPI)网络的蛋白质功能预测方法预测精度不高、易受数据噪声影响的问题,提出一种基于机器学习(层次聚类、主成分分析和多层感知器)的蛋白质功能预测方法 HPMM。该方法综合考虑蛋白质宏观和微观层面的信息,...
关键词：功能预测 机器学习 蛋白质相互作用 层次聚类 主成分分析 多层感知器 
基于双重索引矩阵的蛋白质功能预测被引量：1
《计算机应用》2015年第6期1637-1642,共6页孟军 张信 
国家自然科学基金资助项目(61472061)
针对单一数据源预测蛋白质功能效果不佳以及蛋白质相互作用网络信息不完全等问题,提出一种多数据源融合和基于双重索引矩阵的随机游走的蛋白质功能预测(MSI-RWDIM)算法。该算法使用了蛋白质序列、基因表达和蛋白质相互作用数据预测蛋白...
关键词：多数据源融合 随机游走 双重索引矩阵 功能相关性网络 蛋白质功能预测 
基于有向双关系图和多核融合的蛋白质功能预测
《计算机应用》2014年第12期3433-3437,3474,共6页孟军 刁印 
辽宁省自然科学基金资助项目(20130200029)
针对多源异构蛋白质相互作用网络信息量大、数据冗余导致预测结果不能充分反映数据分布信息的问题,将功能类别网络和蛋白质相互作用网络相结合,提出基于有向双关系图和多核融合的多标记学习算法。首先,构建基于含有损失函数的目标方程...
关键词：有向双关系图 多核融合 半监督学习 多标记 蛋白质功能预测 
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