孟军

作品数：27被引量：196H指数：7
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供职机构：大连理工大学更多>>
发文主题：粗糙集非编码RNA互作关系基因调控网络开放阅读框更多>>
发文领域：自动化与计算机技术文化科学环境科学与工程医药卫生更多>>
发文期刊：《微电子学与计算机》《系统仿真学报》《计算机教育》《郑州大学学报（理学版）》更多>>
所获基金：国家自然科学基金辽宁省自然科学基金国家重点基础研究发展计划辽宁省教育厅攻关计划项目更多>>
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结合多尺度卷积胶囊网络的植物lncRNA编码小肽预测
《郑州大学学报（理学版）》2022年第1期12-18,共7页胡鹤还 孟军 赵思远 纪腾其 
国家自然科学基金项目(61872055)。
长非编码RNA(lncRNA)是一类不编码蛋白、长度大于200 nt的非编码RNA。然而,最近研究表明,部分lncRNA中含有不超过300 nt的短开放阅读框(sORFs),具备编码小肽的能力。这一发现使得sORFs编码小肽(SEPs)这一崭新的研究领域引起人们的重视...
关键词：胶囊网络 长非编码RNA 短开放阅读框 小肽 预测 
基于表示学习和深度森林的长链非编码RNA编码短肽预测模型被引量：1
《计算机应用》2021年第12期3614-3619,共6页纪腾其 孟军 赵思远 胡鹤还 
国家自然科学基金资助项目(61872055)。
长链非编码RNA(lncRNA)中的小开放阅读框(sORFs)能够编码长度不超过100个氨基酸的短肽。针对短肽预测研究中lncRNA中的sORFs特征不鲜明且高可信度数据尚不充分的问题,提出一种基于表示学习的深度森林(DF)模型。首先,使用常规lncRNA特征...
关键词：长链非编码RNA 小开放阅读框 短肽 表示学习 深度森林 预测 
融合CNN和Bi-LSTM的miRNA-lncRNA互作关系预测模型被引量：8
《计算机研究与发展》2019年第8期1652-1660,共9页石文浩 孟军 张朋 刘婵娟 
国家自然科学基金项目(61872055,61702075)~~
非编码RNA(ncRNA)在很多动植物生命活动方面起着重要的调节作用,而微小RNA(miRNA)与长非编码RNA(lncRNA)的相互作用更为重要,其互作关系的研究不仅有助于深入分析基因间生物学功能,也可为疾病的诊治和植物的遗传育种方面提供新思路.目前...
关键词：卷积神经网络 双向长短期记忆网络 miRNA-lncRNA 预测 深度学习 
多特征融合的lncRNA识别与其功能预测被引量：5
《智能系统学报》2018年第6期928-934,共7页常征 孟军 施云生 莫冯然 
国家自然科学基金项目(61472061);大连理工大学研究生教改基金项目(Jg2017015);大连理工大学大学生创新训练项目(2018101410201011019)
针对传统的基于单一特征的植物lncRNA识别的局限性,提出了融合RNA序列的开放阅读框、二级结构以及k-mers等多特征方法,训练高斯朴素贝叶斯、支持向量机和梯度提升决策树3种经典的分类模型,并实现分类结果的集成,利用交叉验证对模型的性...
关键词：lncRNA 识别 特征提取 多特征融合 机器学习 互作关系 网络构建 功能预测 
结合近邻传播聚类的选择性集成分类方法被引量：12
《计算机研究与发展》2018年第5期986-993,共8页孟军 张晶 姜丁菱 何馨宇 李丽双 
国家自然科学基金项目(61472061;61672126)~~
从海量的基因微阵列数据中提取出有价值的信息是生物信息学的研究热点.基因微阵列数据具有高维度、小样本和高冗余的特性.因此,提出一种基于相交邻域粗糙集的基因选择方法,挑选出关键基因用于对微阵列数据进行分类.首先利用pathway知识...
关键词：选择性集成 近邻传播 通路 相交邻域 基因微阵列数据 
融合粒子群优化和遗传算法的基因调控网络构建被引量：4
《计算机应用》2016年第11期2969-2973,共5页孟军 史贯丽 
国家自然科学基金资助项目(61472061)~~
MicroRNA（miRNA）是一类大小为21～25nt的内源性非编码小核糖核酸（RNA），通过与mRNA的3’-UTR互补结合，导致mRNA降解或翻译抑制来调控编码基因的表达。为了提高构建基因调控网络的准确度，提出一种基于粗糙集、融合粒子群（PSO）和...
关键词：基因调控网络 粒子群优化 遗传算法 粗糙集 特征选择 
基于多特征融合的基因调控网络构建方法研究被引量：3
《小型微型计算机系统》2016年第4期743-747,共5页孟军 周广博 黄楚冰 
国家自然科学基金项目(61472061)资助;大连理工大学大学生创新创业训练计划项目(201410141065)资助
构建基因调控网络一直是生物信息学和系统生物学领域的一个研究热点.为了进一步提高基因调控网络构建的准确度,提出一种多特征融合的构建方法.分别对基因表达数据、序列信息和基因功能数据进行特征提取,利用特征级融合策略将三类特征融...
关键词：多特征融合 支持向量机 基因调控网络 特征选择 数据集成 
基于双重索引矩阵的蛋白质功能预测被引量：1
《计算机应用》2015年第6期1637-1642,共6页孟军 张信 
国家自然科学基金资助项目(61472061)
针对单一数据源预测蛋白质功能效果不佳以及蛋白质相互作用网络信息不完全等问题,提出一种多数据源融合和基于双重索引矩阵的随机游走的蛋白质功能预测(MSI-RWDIM)算法。该算法使用了蛋白质序列、基因表达和蛋白质相互作用数据预测蛋白...
关键词：多数据源融合 随机游走 双重索引矩阵 功能相关性网络 蛋白质功能预测 
基于相交邻域粗糙集的基因微阵列数据分类被引量：4
《计算机科学》2015年第6期37-40,66,共5页孟军 李锐 郝涵 
辽宁省自然科学基金项目(20130200029)资助
在对基因微阵列数据的特征选择和分类的研究中,粗糙集理论是一个可以消除冗余基因的有效工具。但是传统的粗糙集模型不能很好地处理连续型数值数据,而离散化方法可能会导致信息的丢失。为此,提出了一种基于相交邻域粗糙集模型的属性约...
关键词：粗糙集 相交邻域 基因微阵列数据 
基于近邻传播聚类的集成特征选择方法被引量：6
《计算机科学》2015年第3期241-244,260,共5页孟军 尉双云 
辽宁省自然科学基金项目(20130200029)资助
针对高维数据中的类标记仅与少部分特征关联紧密的问题,提出了基于排序聚合和聚类分组的特征随机选择集成学习方法。采用排序聚合技术对特征进行过滤,选出与样本分类相关的特征,以bicor关联系数作为关联衡量标准,利用近邻传播聚类算法...
关键词：分类 排序聚合 近邻传播聚类 集成特征选择 
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