蛋白质功能

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捕捉瞬间变化 提供蛋白质结构研究新视角——自由电子激光技术
《前沿科学》2024年第3期23-27,共5页李洪杰 沈建仁 
了解蛋白质的三维结构是理解其在生物体内发挥功能的基础。近年来,大量的蛋白质结构通过X射线衍射晶体学(X-ray Crystallography)和单粒子冷冻电镜(Single Particle Analysis by Cryo-electron Microscopy,SPA cryo-EM)方法得到解析,Alp...
关键词：自由电子激光 静态结构 冷冻电镜 蛋白质结构 发挥功能 蛋白质功能 三维结构 单粒子 
蛋白质结构预测的过去、现在和未来
《前沿科学》2024年第3期75-80,共6页周耀旗 汤金乐 张哲 詹剑 
蛋白质结构预测通常是指根据蛋白质的序列来预测其结构。蛋白质从化学成份上来讲,是一种由20种氨基酸残基所连接而成的线性高分子。不同长度和不同组分的氨基酸排列组合构成了不同的蛋白质。奇特的是,这些不同氨基酸的排列组合往往能够...
关键词：排列组合 蛋白质结构预测 分子马达 蛋白质功能 化学成份 线性高分子 支撑结构 化学反应 
基于生物信息学的蛋白质功能预测方法研究进展被引量：5
《生物工程学报》2024年第7期2087-2099,共13页何新媛 刘杨 曾祥荷 高荣凤 田真 樊祥宇 
国家自然科学基金(31600148);山东省自然科学基金(ZR2021MC018)。
随着计算能力的增加和生物数据的快速扩展,利用生物信息学解决一些生物学问题逐渐成为主流的解决方案。蛋白质功能预测是生物医学和药物研究领域的重要任务。利用生物信息学进行蛋白质功能预测成为研究热点。本文将基于生物信息学的蛋...
关键词：生物信息学 蛋白质功能预测 基因本体论 机器学习 深度学习 
做真科研,育新人才,推动行业致远发展——记四川大学轻工科学与工程学院院长彭必雨
《北京皮革》2024年第6期18-23,共6页本刊编辑部 
彭必雨主要从事皮革化学与工程、酶工程与制革生物技术、生态皮革与绿色皮革化学品、蛋白质功能与制革废弃物高值利用等领域的研发和人才培养工作。作为负责人承担了“国家重点研发计划”以及“国家科技支撑计划”等国家级、省部级和企...
关键词：皮革化学 制革废弃物 国家重点研发计划 工程学院院长 蛋白质功能 酶工程 国家科技支撑计划 绿色皮革化学品 
蛋白质棕榈酰化修饰调控蛋白质功能的研究进展
《中国预防兽医学报》2024年第5期546-552,共7页管翔雨 杨晓柯 李树稳 张新 赵小天 仇华吉 李永锋 
国家重点研发计划(2021YFD1801401)。
蛋白质是生命的物质基础,也是基因功能的执行者。蛋白质需要经过基因转录、转录后加工、翻译、翻译后加工及转运等多个复杂过程后才具有生理功能。蛋白质翻译后加工修饰形式包括磷酸化、糖基化、甲基化、羟基化、泛素化及脂质化等[1],...
关键词：翻译后加工 转录后加工 蛋白质功能 蛋白质需要 基因转录 棕榈酰化修饰 泛素化 羟基化 
利用序列和组合图卷积网络预测蛋白质功能被引量：1
《小型微型计算机系统》2023年第12期2692-2699,共8页秦琪琪 丁学明 王金雷 
国家自然科学基金项目(11502145)资助。
蛋白质功能的准确预测有利于推进生物医学发展,高通量测序技术的快速发展加快了蛋白质序列的提取速度,从而产生了大量未注释的蛋白质,并且新测序序列缺乏结构等生物信息,针对该问题提出了基于序列和组合图卷积网络的蛋白质功能预测模型(...
关键词：蛋白质功能预测 功能位点 图卷积网络 蛋白质序列 
融合Doc2vec与GCN的多类型蛋白质相互作用预测方法
《智能系统学报》2023年第6期1165-1172,共8页曹汉童 陈璟 
江苏省青年自然科学基金项目(BK20150159).
多类型蛋白质−蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)的研究是从系统角度理解生物过程和揭示疾病机制的基础。现有的GNN-PPI、PIPR等针对多类型PPI预测方法在采用广度和深度优先搜索对数据集进行划分时,测试准确率会显著下降...
关键词：PPI网络 图神经网络 蛋白质功能预测 深度学习 生物学意义 复杂网络 图卷积神经网络 非监督学习 蛋白质序列 
膜蛋白靶向降解技术研究进展被引量：1
《自然杂志》2023年第6期434-442,共9页赵俗 张衡 李焱 王贞超 
国家自然科学基金青年基金(22007022);贵州省科技拔尖人才项目(黔教技[2022]075);贵州省教育厅重点项目(QjhKYZi[2021]041)。
膜蛋白是细胞间相互作用的主要参与者,在信号传导、分化增殖、应激响应等生命过程中均扮演着重要的角色。传统小分子抑制剂与抗体分别通过抑制和阻断膜蛋白与其配体之间的相互作用来发挥作用,但往往存在抑制不彻底或诱发耐药性的问题。...
关键词：膜蛋白 靶向降解 蛋白质功能 
基于对比学习的蛋白质功能预测模型
《福建师范大学学报（自然科学版）》2023年第6期32-39,共8页孙旭 林劼 
国家自然科学基金资助项目(61472082)。
确定蛋白质的功能可为许多生物学问题的解决提供支持,目前已提出了多种机器学习方法来对蛋白质的功能进行预测.大多数方法利用蛋白质序列、结构域以及蛋白质间的相互作用等特征来预测蛋白质功能,然而对于新发现的蛋白质来说,除序列外其...
关键词：对比学习 基因本体 标签传播 
基于协同进化信息和深度学习的蛋白质功能预测被引量：1
《计算机应用研究》2023年第12期3572-3577,共6页王金雷 丁学明 秦琪琪 彭博雅 
国家自然科学基金资助项目(11502145)。
蛋白质的功能对于理解细胞和生物的活动机制、研究疾病机理等至关重要。面对序列数据库的快速增长,传统的实验和序列对比方法不足以支撑大规模的蛋白质功能标注。为此,提出EGNet(evolutionary graph network)模型,采用蛋白质预训练语言...
关键词：蛋白质功能 深度学习 协同进化信息 语言模型 图卷积神经网络 
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