蛋白质功能预测

作品数:55被引量:121H指数:6
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相关作者:赵立军张霞王峻余国先倪青山更多>>
相关机构:吉林大学西南大学国防科学技术大学中南大学更多>>
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蛋白质功能预测方法概述被引量:3
《生物信息学》2013年第1期33-38,共6页刘言 沈素萍 方慧生 陈凯先 
蛋白质是生物体内最必需也是最通用的大分子,对它们功能的认识对于科学领域和农业领域的发展有着至关重要的作用。随着后基因组时代的发展,NCBI数据库中迅速涌现出大量不明结构与功能的蛋白质序列,这些蛋白质序列甚至一跃成了研究的热...
关键词:蛋白质功能预测方法 结构基序 相互作用网络 ESG 
基于分组重量编码的蛋白质功能预测被引量:1
《生物信息学》2007年第1期25-27,共3页王秀鹤 王正华 王勇献 张振慧 
国家自然科学基金资助项目(NO.60603054)
从蛋白质序列出发,采用分组重量编码(Encoding Based on Grouped Weight,简记EBGW),并结合最近邻居算法对蛋白质功能进行预测。对酵母(Saccharomyces cerevisiae)蛋白质的1826条序列进行预测,整体预测准确率与其他基于序列信息的蛋白质...
关键词:分组重量编码 蛋白质功能预测 特征序列 最近邻居算法 
根据基因表达谱筛选间接互作蛋白质进行蛋白质功能预测
《生物信息学》2006年第3期105-108,共4页高磊 朱明珠 郭政 李霞 
国家自然科学基金(30370798;30170515;30370388)资助项目;国家863计划(2003AA2Z2051;2002AA2Z2052)资助项目;黑龙江科技攻关重点(GB03C602-4)资助项目;哈尔滨市科技攻关(2003AA3CS113)资助项目;黑龙江自然科学基金(F0177)资助项目;哈医大211工程"十五"建设项目
利用基因表达谱数据,通过计算互作蛋白质的表达相关系数,来筛选、优化蛋白质互作网络。结果显示,利用经过筛选的互作数据,根据邻居计数法和卡方法进行功能预测的预测效果明显提高,距离待测蛋白质较远的邻居也包含着与待测蛋白质功能一...
关键词:蛋白质互作 基因表达谱 基因功能 预测 相关 
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