朱明珠

作品数：6被引量：12H指数：2
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供职机构：首都医科大学生物医学工程学院更多>>
发文主题：基因表达谱蛋白质基因功能支持向量机蛋白质互作网络更多>>
发文领域：生物学医药卫生更多>>
发文期刊：《中国生物医学工程学报》《生命科学研究》《生物信息学》更多>>
所获基金：国家自然科学基金北京市教育委员会科技发展计划国家高技术研究发展计划黑龙江省自然科学基金更多>>
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结合蛋白质互作与功能类的可分性预测蛋白质功能
《中国生物医学工程学报》2009年第2期270-274,共5页朱明珠 高磊 李彦辉 马文才 朱晶 张敏 郭政 李霞 
国家自然科学基金资助项目(30571034,30370798,30570424,30600367);2006年北京市新世纪百千万人才工程;北京市教育委员会科技发展计划资助项目(KM200610025011)
当前蛋白质功能注释体系的欠完备性限制了生物学及医药研究的进一步发展和应用,有必要将基因本体功能知识体系(GO)的功能注释信息进一步深化,把蛋白质注释到GO中更具体的功能节点。为此,提出一种结合互作信息的新的预测策略,将酵母蛋白...
关键词：蛋白质功能深化预测 基因本体功能知识体系(GO) 预测空间 
基于网络特征的药物靶蛋白识别被引量：1
《中国科学（C辑）》2008年第12期1184-1190,共7页朱明珠 高磊 李霞 刘志成 
国家高技术研究发展计划(批准号:2007AA02Z329);国家自然科学基金(批准号:30571034,30370798,30570424和30600367);北京市新世纪百千万人才工程、北京市教育委员会科技发展计划(批准号:KM200610025011)资助项目
蛋白质很少孤立得发挥作用,往往通过网络中彼此互作来共同行使功能.因此分析药物靶蛋白在生物学网络中的性质将十分有助于从信息学角度理解药物的作用机制.但目前尚无研究对药物靶蛋白在人类蛋白质互作网络中的拓扑特性给与具体的分析...
关键词：药物靶点 蛋白质互作 拓扑特征 
人类蛋白质互作网络hub蛋白与其结构域关联分析被引量：2
《生命科学研究》2008年第3期253-256,共4页王靖 李霞 朱明珠 肖雪 
国家自然科学基金资助项目(30571034;30370798);国家863项目(2007AA02Z329);2006年北京市新世纪百千万人才工程;北京市教育委员会科技发展计划项目(KM20060025011)
hub蛋白质作为参与较多互作的"中心蛋白",在实现蛋白质功能和生命活动中发挥着关键作用.而结构域作为蛋白质上的基本功能区域,决定着蛋白质功能及蛋白质互作的情况.互作网络中hub蛋白质和结构域对于蛋白质功能的实现均起到决定性的作用...
关键词：蛋白质互作网络 连通度 hub蛋白质 互作伙伴(partner) 结构域 
结合蛋白质互作与基因表达谱信息大范围预测蛋白质的精细功能被引量：8
《中国科学（C辑）》2006年第5期441-450,共10页高磊 李霞 郭政 朱明珠 李彦辉 饶绍奇 
国家自然科学基金(批准号:30170515;30370388;30370798;30570424和30571034);国家863计划(批准号:2003AA2Z2051和2002AA2Z2052);黑龙江科技攻关重点(批准号:GB03C602-4);哈尔滨市科技攻关(批准号:2003AA3CS113);黑龙江自然科学基金(批准号:F0177);黑龙江省教育厅杰出海外学人基金(批准号:1055HG009)
GESTs(gene expression similarity and taxonomy similarity)是结合基因表达相似性和基因功能分类体系Gene Ontology(GO)中的功能概念相似性测度进行功能预测的新方法.将此预测算法推广应用于蛋白质互相作用数据,并提出了几种在蛋白质...
关键词：基因表达谱 蛋白质互作 GENE ONTOLOGY 相似·性距离 蛋白质功能 预测 
根据基因表达谱筛选间接互作蛋白质进行蛋白质功能预测
《生物信息学》2006年第3期105-108,共4页高磊 朱明珠 郭政 李霞 
国家自然科学基金(30370798;30170515;30370388)资助项目;国家863计划(2003AA2Z2051;2002AA2Z2052)资助项目;黑龙江科技攻关重点(GB03C602-4)资助项目;哈尔滨市科技攻关(2003AA3CS113)资助项目;黑龙江自然科学基金(F0177)资助项目;哈医大211工程"十五"建设项目
利用基因表达谱数据,通过计算互作蛋白质的表达相关系数,来筛选、优化蛋白质互作网络。结果显示,利用经过筛选的互作数据,根据邻居计数法和卡方法进行功能预测的预测效果明显提高,距离待测蛋白质较远的邻居也包含着与待测蛋白质功能一...
关键词：蛋白质互作 基因表达谱 基因功能 预测 相关 
基因功能预测问题中的样本不平衡处理被引量：5
《中国生物医学工程学报》2006年第2期158-162,177,共6页朱明珠 郭政 李霞 刘帅 李彦辉 高磊 
国家自然科学基金资助项目(39970397;30170515;30370388);国家"863"计划(2002AA2Z2052;2003AA2Z2051);黑龙江科技攻关重点(GB03C6024);黑龙江自然科学基金资助项目(F0177);哈尔滨市科技攻关(2003AA3CS113);哈尔滨医科大学211工程"十五"建设项目
应用机器学习进行分类是基因功能预测的一种重要手段。但是许多预测集中的阳性样本过少,会降低功能预测的效果。针对此问题,本研究对结合支持向量机(SVM)算法的几种常用非平衡数据分类方法进行实验比较,包括投票整合分类器和移动分类面...
关键词：支持向量机 功能预测 基因表达谱 不平衡 
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