云南高校图书馆联盟文献共享服务平台- 李彦辉

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结合蛋白质互作与功能类的可分性预测蛋白质功能: 《中国生物医学工程学报》2009年第2期270-274,共5页朱明珠高磊李彦辉马文才朱晶张敏郭政李霞; 国家自然科学基金资助项目(30571034,30370798,30570424,30600367);2006年北京市新世纪百千万人才工程;北京市教育委员会科技发展计划资助项目(KM200610025011); 当前蛋白质功能注释体系的欠完备性限制了生物学及医药研究的进一步发展和应用,有必要将基因本体功能知识体系(GO)的功能注释信息进一步深化,把蛋白质注释到GO中更具体的功能节点。为此,提出一种结合互作信息的新的预测策略,将酵母蛋白...; 关键词：蛋白质功能深化预测基因本体功能知识体系(GO) 预测空间

利用癌功能类从癌基因组突变谱中识别癌基因: 《中国科学（C辑）》2008年第8期694-698,共5页李彦辉郭政彭春芳刘庆马文财王靖姚晨张敏朱晶; 国家自然科学基金(批准号:30370388,30670539和30770558)资助项目; 从大规模癌样本基因突变扫查数据中识别癌基因具有重要的意义.一些重要功能的改变对于癌的发生发展是必需的,因此将它们定义为癌功能类,并从GO(Gene Ontology)中选择一组显著富集已知癌基因的细致功能类来代表它们.为了评价以癌相关功...; 关键词：突变谱癌基因 GENE ONTOLOGY 蛋白质功能预测

根据蛋白质互作网络预测前列腺癌相关蛋白质的细致功能: 《生物信息学》2008年第4期145-147,共3页李彦辉马文财郭政龚雪张敏姚晨王靖; 国家自然科学基金(30370388;30670539); 对于功能部分已知的前列腺癌相关蛋白质,提出了一种基于Gene Ontology的功能特异的子网构建方法来细化其功能注释。结果显示该方法能够以很高的精确率为前列腺癌相关蛋白质预测更为精细的功能。预测的相关蛋白质的功能对于指导实验研究...; 关键词：前列腺癌蛋白质功能蛋白质互作网络 GENE ONTOLOGY

Oligo基因芯片的异常值处理对有监督疾病分类的影响: 《中国生物医学工程学报》2008年第1期69-75,共7页吕莹丽王栋郭政于梁梁李彦辉朱晶王晨光; 国家自然科学基金(39970397,30170515,30370388,)资助项目;国家863计划(2003AA2Z2051;2002AA2Z2052)资助项目;哈医大211工程“十五”建设项目; 基因芯片实验产生的表达谱数据中存在大量不合格的检测点,对异常值的不同处理,对于有监督疾病分类结果的影响很大。针对此问题,在Oligo芯片数据中,在表达水平层面,通常对检测值做最大值和最小值的预处理后,进行后续分析。本研究选取了四...; 关键词：基因表达谱异常值分类功能表达谱

根据蛋白质互作网络预测乳腺癌相关蛋白质的细致功能被引量：2: 《遗传》2007年第9期1061-1066,共6页王靖李彦辉郭政朱晶马文财彭春方刘庆; 国家自然科学基金(编号:30370388;30670539)项目资助~~; 乳腺癌是最为常见的恶性肿瘤之一。已有的关于乳腺癌相关蛋白质的功能注释比较宽泛,制约了乳腺癌的后续研究工作。对于已知部分功能的乳腺癌相关蛋白质,提出了一种结合Gene Ontology功能先验知识和蛋白质互作的方法,通过构建功能特异的...; 关键词：乳腺癌蛋白质功能预测互作网络基因本体

通过蛋白质互作网络预测已知部分功能的蛋白质的精细功能被引量：2: 《科学通报》2007年第20期2367-2373,共7页李彦辉郭政马文财杨达王栋张敏朱晶钟国才李永进姚晨王靖; 国家自然科学基金(批准号:3037088和30670539)资助项目; 基于高通量数据,研究人员已经设计了许多算法用于寻找功能完全未知蛋白质的功能.然而,这些算法的效率受到一些根本因素的制约,包括:(ⅰ)功能完全未知的蛋白质参与一个精细功能的先验概率低;(ⅱ)高通量互作数据中有大量的假阳性互作;(ⅲ...; 关键词：蛋白质互作 GENE ONTOLOGY 基因功能算法预测

结合蛋白质互作与基因表达谱信息大范围预测蛋白质的精细功能被引量：8: 《中国科学（C辑）》2006年第5期441-450,共10页高磊李霞郭政朱明珠李彦辉饶绍奇; 国家自然科学基金(批准号:30170515;30370388;30370798;30570424和30571034);国家863计划(批准号:2003AA2Z2051和2002AA2Z2052);黑龙江科技攻关重点(批准号:GB03C602-4);哈尔滨市科技攻关(批准号:2003AA3CS113);黑龙江自然科学基金(批准号:F0177);黑龙江省教育厅杰出海外学人基金(批准号:1055HG009); GESTs(gene expression similarity and taxonomy similarity)是结合基因表达相似性和基因功能分类体系Gene Ontology(GO)中的功能概念相似性测度进行功能预测的新方法.将此预测算法推广应用于蛋白质互相作用数据,并提出了几种在蛋白质...; 关键词：基因表达谱蛋白质互作 GENE ONTOLOGY 相似·性距离蛋白质功能预测

基因功能预测问题中的样本不平衡处理被引量：5: 《中国生物医学工程学报》2006年第2期158-162,177,共6页朱明珠郭政李霞刘帅李彦辉高磊; 国家自然科学基金资助项目(39970397;30170515;30370388);国家"863"计划(2002AA2Z2052;2003AA2Z2051);黑龙江科技攻关重点(GB03C6024);黑龙江自然科学基金资助项目(F0177);哈尔滨市科技攻关(2003AA3CS113);哈尔滨医科大学211工程"十五"建设项目; 应用机器学习进行分类是基因功能预测的一种重要手段。但是许多预测集中的阳性样本过少,会降低功能预测的效果。针对此问题,本研究对结合支持向量机(SVM)算法的几种常用非平衡数据分类方法进行实验比较,包括投票整合分类器和移动分类面...; 关键词：支持向量机功能预测基因表达谱不平衡

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李彦辉