王晨光

作品数：18被引量：14H指数：2
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供职机构：哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院更多>>
发文主题：基因表达谱基因芯片CDNA芯片AUTHORWARE疾病分类更多>>
发文领域：医药卫生生物学文化科学自动化与计算机技术更多>>
发文期刊：《高技术通讯》《哈尔滨医科大学学报》《科技创新导报》《国际遗传学杂志》更多>>
所获基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划黑龙江省自然科学基金哈尔滨市科技攻关计划项目更多>>
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微阵列数据揭示基因在癌样本中广泛表达
《生物信息学》2012年第2期136-140,共5页王栋 黄燕 程立新 李朋飞 顾云燕 吴瑞红 王明月 李宾 王晨光 郭政 
黑龙江省教育厅科学技术研究项目(编号:11541156)
癌的发生与发展过程涉及大量基因的异常表达。在目前基因表达谱分析中采用的标准化方法通常假设在疾病中差异表达的基因的比例很小并且差异上、下调的比例大致相等。这个被研究者所广泛采用的标准化的前提假设尚未被充分地论证过。通过...
关键词：胰腺癌 微阵列 标准化 差异表达 生物学通路 
《生物信息学》创新教学模式的探讨被引量：1
《科技创新导报》2011年第30期192-192,共1页王栋 黄燕 王晨光 郭政 
《生物信息学》是生物科学中一门新兴的前沿学科。我们在其他学科的成功教学的基础之上,结合信息学当前在我国的教学实际情况,还有结合教学课程的相关特点,笔者提出了崭新的教学模式,以求在生物信息学教学模式上得以创新和发展。
关键词：生物信息学 教学模式 理论实验 
基于不同标准化假设分析癌基因组甲基化谱
《中国生物医学工程学报》2011年第5期706-711,共6页王栋 吴瑞红 程立新 李朋飞 王明月 李宾 王晨光 郭政 
国家自然科学基金重大研究计划(91029717);国家自然科学基金(81071646);黑龙江省自然科学基金(QC2010012);黑龙江省教育厅科学技术研究项目(11541156)
在处理甲基化谱时,通常采用标准化方法,强制所有样本的信号值服从同一种分布或至少具有相同的中值。然而,有研究者认为这些标准化方法可能会移除甲基化谱中的生物学信号,有必要全面评估不同的处理方法对后续分析的影响。通过配对秩和检...
关键词：DNA甲基化 微阵列 数据标准化 癌基因组 差异甲基化 
基于表达谱的可卡因精神成瘾脑区性与时程性分析
《国际遗传学杂志》2010年第4期215-220,共6页许艳 陈鑫恺 胡雯 李晋 王晨光 韩俊伟 于海龙 
黑龙江省教育厅基金项目（11531112）;黑龙江省博士后基金项目（LBH-206110）
目的探讨不同奖赏性脑区及不同用药时程下可卡因的精神成瘾机制及其成瘾过程是否具有脑区性和时程性差异。方法从基因表达谱中提取随可卡因摄人量递增、在不同用药时程下6个脑区（NAc、AMG、LH、Septum、VTA和mPFC）表达水平发生改变的...
关键词：可卡因成瘾 差异表达基因 富集分析 脑区性 时程性 
cDNA芯片重复探针检测值的一致性分析
《高技术通讯》2009年第1期95-98,共4页于梁梁 王栋 吕莹丽 肖会 杨强 王晨光 郭政 李霞 
国家自然科学基金(30370388,30670539,30770558)资助项目
通过SOURCE数据库对4套cDNA数据的探针进行了注释,分析了对应同一条Unigene的多个探针的检测值(即重复检测值)之间的相关性。采用两种常规方法处理了重复检测值,比较了这两种处理方法对筛选差异表达基因的影响。结果显示:Unigene的重复...
关键词：cDNA基因芯片 差异表达基因 相关系数 探针 
根据基因功能表达谱研究抑郁症模型及安佳欣胶囊的抗抑郁症机制被引量：2
《生物信息学》2008年第2期49-51,共3页赵丽娜 肖会 郝晓峰 李强 马国才 李崇前 钟国才 杨达 王晨光 郭政 
国家自然科学基金(30170515;30370388;30370798;30570424;30571034)资助项目;国家863计划(2003AA2Z20512002AA2Z2052);哈尔滨市科技攻关(2003AA3CS113)
由基因芯片检测正常大鼠、模型大鼠和服用安佳欣胶囊进行治疗后的大鼠各8例的基因表达谱,在正常组和模型组之间,筛选得到207个差异表达基因和25个差异表达基因功能模块,在模型组和给药组之间,筛选得到860个差异表达基因和24个差异表达...
关键词：抑郁症 安佳欣胶囊 基因表达谱 功能模块 
Oligo基因芯片的异常值处理对有监督疾病分类的影响
《中国生物医学工程学报》2008年第1期69-75,共7页吕莹丽 王栋 郭政 于梁梁 李彦辉 朱晶 王晨光 
国家自然科学基金(39970397,30170515,30370388,)资助项目;国家863计划(2003AA2Z2051;2002AA2Z2052)资助项目;哈医大211工程“十五”建设项目
基因芯片实验产生的表达谱数据中存在大量不合格的检测点,对异常值的不同处理,对于有监督疾病分类结果的影响很大。针对此问题,在Oligo芯片数据中,在表达水平层面,通常对检测值做最大值和最小值的预处理后,进行后续分析。本研究选取了四...
关键词：基因表达谱 异常值分类 功能表达谱 
利用GeneHub软件多角度分析基因功能相关与表达相关的联系被引量：1
《生物医学工程学杂志》2006年第6期1157-1161,共5页王晨光 郭政 李霞 余辉 徐建震 
国家自然科学基金资助项目(39970397;30170515;30370388);国家863计划资助项目(2002AA222052;2003AA2Z2051);黑龙江科技攻关重点资助项目(GB03C602-4);哈尔滨市科技攻关资助项目(2003AA3CS113);黑龙江自然科学基金资助项目(F0177);211工程"十五"建设项目
我们研制的GeneHub软件可以用来评价基因功能分类体系中各个功能单元的表达相关性的显著性,从而筛选与实验条件相关的功能单元。采用不同的相似性测度与不同的数据集,使用GeneHub研究了分别按染色体定位、蛋白质细胞位置与互作、代谢通...
关键词：基因芯片 基因表达 基因功能 相关 数据库 
基于功能模块组织癌细胞系基因表达谱的关联规则被引量：1
《第三军医大学学报》2006年第13期1370-1373,共4页王晨光 郭政 李霞 王健 
国家自然科学基金资助项目(30370798;30170515;30370388);国家高技术研究发展计划("863")资助项目(2003AA2Z20512002AA2Z2052);黑龙江科技攻关资助重点项目(GB03C602-4);哈尔滨市科技攻关资助项目(2003AA3CS113);黑龙江自然科学基金资助项目(F0177)~~
目的提出一种在功能模块化水平上组织大量基因表达谱关联规则的新方法。方法以高频出现在关联规则后件中的基因为基础分类关联规则,再选择显著聚集前件基因的GO基因功能类作为功能模块关联规则的前件,获得功能模块表达关联规则。结果根...
关键词：基因芯片 关联规则 GENE ONTOLOGY 癌症 
cDNA芯片缺失值处理对基于基因表达谱的疾病分类的影响被引量：3
《高技术通讯》2006年第5期501-505,共5页王栋 郭政 李霞 吕莹丽 朱晶 王晨光 
国家自然科学基金（30370798,30170515,30370388）资助项目.
选取了4套cDNA芯片数据,分别运用补零和K近邻的方法,对有检测缺失的基因进行了补缺失值处理,分析了不同处理对支持向量机、K近邻分类器、决策树三种分类器分类效能的影响.结果显示： 在cDNA基因表达谱数据中,对检测缺失率不高于5%的基...
关键词：基因表达谱 缺失值 分类 
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