职晓阳

作品数：14被引量：138H指数：7
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供职机构：云南大学生命科学学院微生物研究所更多>>
发文主题：放线菌嗜盐放线菌RRNA基因放线菌多样性系统发育分析更多>>
发文领域：生物学医药卫生轻工技术与工程化学工程更多>>
发文期刊：《云南大学学报（自然科学版）》《微生物学通报》《中国科学院院刊》《微生物学报》更多>>
所获基金：国家自然科学基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”国家重点基础研究发展计划云南省自然科学基金更多>>
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建设微生物组大数据中心 发挥长期科学影响被引量：2
《中国科学院院刊》2017年第3期280-289,共10页张国庆 宁康 职晓阳 刘婉 徐萍 周豪魁 胡黔楠 赵国屏 
国家高技术发展"863"项目计划(2014AA021502;2015AA020108);国家重点研发计划(2016Y FC0901904;2016YFC09016 04)
宏基因组研究的思想与技术推动了微生物组的兴起,积累了丰富的微生物基因组以及健康、动植物和环境相关的微生物宏基因组数据,形成了具备一定规模和影响力的数据库、标准化方法与分析工具。大多数平台聚焦于为项目或特定类型的微生物菌...
关键词：微生物组 微生物系统组 分类 生态 合成生物学 
分离自印度洋深海沉积物的部分链霉菌分离株多位点序列分析被引量：8
《微生物学通报》2016年第5期927-934,共8页姜钊 职晓阳 李文均 
国家973计划项目(No.2010CB833801)~~
【目的】采用多位点序列分析方法,研究印度洋3 000 m以下深海沉积物中分离得到的16S rRNA基因比对高度相似的链霉菌菌株的种间系统发育关系,同时探讨各管家基因及多基因聚类分析后的种间区分能力。【方法】以分离自印度洋深海沉积物的7...
关键词：链霉菌 管家基因 多位点序列分析 
云南江城和黑井盐矿沉积物未培养放线菌多样性比较被引量：15
《微生物学通报》2008年第10期1550-1555,共6页吴晋元 职晓阳 李岩 关统伟 唐蜀昆 徐丽华 李文均 
国家“973项目”(No.2004CB719601);国家自然科学基金项目(No.30600001);教育部科学技术重点项目(No.206139);教育部新世纪优秀人才支持计划(No.NCET-05-0821);云南省应用基础研究计划面上项目(No.2007C167M)
类群特异性引物的应用使得研究者可以对感兴趣的微生物类群进行针对性研究。围绕云南江城和黑井两个地区的3个盐矿样点沉积物中放线菌的多样性和群落组成,我们通过放线菌特异性引物对总DNA进行16SrRNA基因扩增,经过克隆文库构建,利用酶...
关键词：盐矿 极端环境 放线菌多样性 免培养技术 
PCR-SSCP技术在嗜盐放线菌链单孢菌属快速筛选中的应用被引量：2
《微生物学通报》2008年第9期1500-1504,共5页蔡曼 职晓阳 吴晋元 唐蜀昆 李文均 
国家"973项目"(No.2004CB719601);国家自然科学基金(No.30600001);教育部科学技术研究重点项目(No.206139);教育部新世纪优秀人才支持计划;云南省自然科学基金(No.2007C167M)
为提高嗜盐放线菌的研究效率,快速、准确的从大量分离菌株中去除重复菌株、筛选出目的菌株,在特异性引物快速定属的基础上,以嗜盐放线菌链单孢菌属的34株菌株为研究对象,采用与PCR相结合的单链构象多态性分析(PCR-SSCP),扩增出16SrRNA...
关键词：PCR-SSCP 链单孢菌属 快速筛选 
硝尔库勒湖沉积物中非培养放线菌多样性被引量：21
《微生物学报》2008年第7期851-856,共6页关统伟 吴晋元 职晓阳 唐蜀昆 徐丽华 李文均 张利莉 
国家自然科学基金(30600001,30660005);人事部留学人员科技活动项目(610605);教育部新世纪优秀人才支持计划(NCET);新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室开放课题(BR0803);新疆高校科研计划创新研究群体基金项目(XJEDU2005G07)~~
【目的】认识和了解盐湖沉积环境中放线菌的多样性,为今后的开发和利用奠定基础。【方法】应用免培养技术和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析对新疆硝尔库勒盐湖沉积物中放线菌的多样性进行了研究。实验采用SDS-CTAB法提取土样中总D...
关键词：硝尔库勒湖 系统发育 放线菌多样性 免培养方法 
涅斯捷连科氏菌特异性引物PCR分子鉴定(英文)被引量：1
《微生物学报》2008年第5期644-650,共7页职晓阳 杨玲玲 王芸 唐蜀昆 娄恺 李文均 
国家“973 项目”(2004CB719601);国家自然科学基金(30600001);教育部科学技术重点项目(206139);教育部新世纪优秀人才支持计划~~
涅斯捷连科氏菌属的建立基于对 Micrococcus halobius 的再分类,这是一类广泛分布于高盐土壤环境的革兰氏阳性细菌,属放线菌类。在对我国西部盐湖环境放线菌的生物多样性及分类学研究中,大量类似菌株被分离。【目的】为了对其进行快速鉴...
关键词：涅斯捷连科氏菌 属特异性引物 分子鉴定 
腾冲两热泉泉古菌多样性及系统发育的初步分析被引量：8
《微生物学通报》2008年第3期372-377,共6页宋兆齐 陈经全 职晓阳 黄志勇 张传伦 李文均 
国家“973项目”(No.2004CB719601);国家自然科学基金(No.30600001);教育部新世纪优秀人才支持计划(No.NCET-05-0821);云南省中青年学术和技术带头人后备人才基金(No.2005PY01-12)
通过构建16SrRNA基因片段的克隆文库对腾冲热海两温泉中泉古菌的多样性和系统发育关系进行了初步的研究。一共得到18个泉古菌克隆序列,可分为12个OTUs,两温泉的克隆序列与已知GenBank上关系最近序列的平均相似性较低,无名泉为92.56%,热...
关键词：泉古菌 多样性 系统发育 16S RRNA基因 克隆文库 热泉 腾冲 
拟诺卡氏菌16S rRNA,gyrB,sod和rpoB基因的系统发育分析被引量：15
《微生物学报》2007年第6期951-955,共5页杨玲玲 职晓阳 李文均 
国家"973项目"(2004CB719601);国家自然科学基金(30600001);教育部新世纪优秀人才支持计划;云南省中青年学术和技术带头人后备人才基金;云南省自然科学基金(2004C0002Q)~~
为了更好地了解拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)各物种间的系统发育关系,该属现有有效描述种的gyrB,sod和rpoB基因的部分序列被测定,结合16S rRNA基因,对拟诺卡氏菌属进行了系统发育重建。研究发现拟诺卡氏菌属gyrB,sod和rpoB基因的平均相...
关键词：拟诺卡氏菌属 系统发育分析 16S RRNA基因 看家基因 
新疆艾丁湖嗜盐放线菌纤维素酶特性初探被引量：3
《云南大学学报（自然科学版）》2007年第S3期420-423,共4页蔡曼 胡松楠 职晓阳 唐蜀昆 李文均 
国家自然科学基金(30600001);教育部新世纪优秀人才支持计划;云南省中青年学术和技术带头人后备人才基金;云南省自然科学基金(2004 C0002Q)
从本实验室已分离到的新疆艾丁湖嗜盐放线菌中,筛选出29株具有纤维素酶活性的菌株,其分别属于拟诺卡氏菌属、链单孢菌属、糖单孢菌属、多孢放线菌属及糖多孢菌属.并测定各菌株滤纸酶、单一内切葡聚糖酶及外切葡聚糖酶活力.经综合分析,...
关键词：嗜盐放线菌 内切葡聚糖酶 外切葡聚糖酶 滤纸酶 
艾丁湖盐碱环境分离菌株特异性多重PCR快速鉴定
《云南大学学报（自然科学版）》2007年第S3期424-426,共3页吴晋元 职晓阳 唐蜀昆 李文均 
国家自然科学基金(30600001);教育部新世纪优秀人才支持计划;云南省中青年学术和技术带头人后备人才基金;云南省自然科学基金(2004 C0002Q)
参照糖单孢菌属(Saccharomonospora)和拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)的特异性引物,建立多重PCR反应体系快速鉴定分离自新疆艾丁湖盐碱环境分离的118株嗜盐菌株,检测出14株糖单孢菌属菌株,17株拟诺卡氏菌属菌株.研究发现2株普氏菌属菌株出...
关键词：糖单孢菌 拟诺卡氏菌 特异性PCR 多重PCR 
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