罗静初

作品数：26被引量：154H指数：7
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供职机构：北京大学生命科学学院更多>>
发文主题：生物信息学数据库分子生物学唾液酸酶蛋白质序列更多>>
发文领域：生物学自动化与计算机技术文化科学农业科学更多>>
发文期刊：《科学通报》《生物物理学报》《高技术通讯》《遗传》更多>>
所获基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划北京市科委基金中国博士后科学基金更多>>
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双序列比对基础和应用实例被引量：4
《生物信息学》2023年第1期1-19,共19页罗静初 
首先介绍序列比对的分子生物学基础,即核酸序列基本单元核苷酸和蛋白质序列基本单元氨基酸。文中以精心设计的图表列出四种核苷酸和二十种氨基酸的名称、性质和分类。第2节简述序列比对基础,包括相似性和同源性基本概念、整体比对和局...
关键词：双序列比对 相似性和同源性 整体比对和局部比对 点阵图 计分矩阵 空位罚分 血红蛋白 多肽毒素 植物转录因子 癌胚抗原 唾液酸酶 
顾孝诚教授与北京大学生物信息中心被引量：1
《中国科学：生命科学》2022年第10期1555-1560,共6页罗静初 
顾孝诚(1930~2012年),北京大学生命科学学院教授.曾任北京大学生物学系主任,国家高技术研究发展计划(简称863计划)蛋白质工程评审专家组组长,蛋白质工程和植物基因工程国家重点实验室主任、学术委员会主任,国际遗传工程及生物技术中心...
关键词：国家重点实验室 传播事业 医学研究所 蛋白质工程 生物技术中心 终身成就奖 学术委员会委员 陈章良 
EMBOSS和EMBnet被引量：3
《生物信息学》2021年第4期223-231,共9页罗静初 
笔者撰写的“EMBOSS软件包序列分析程序实例”一文,已经在《生物信息学》期刊2021年第19卷第1期发表。此文介绍欧洲分子生物学开放软件包(European Molecular Biology Open Software Suite,EMBOSS)。EMBOSS是欧洲分子生物学网络组织(Eur...
关键词：生物信息学 生物信息学软件 欧洲分子生物学开放软件包EMBOSS 欧洲分子生物学网络组织EMBnet 
EMBOSS软件包序列分析程序应用实例被引量：2
《生物信息学》2021年第1期1-25,共25页罗静初 
本文介绍欧洲分子生物学开放软件包EMBOSS序列分析程序应用实例。第1节简单介绍EMBOSS软件包的概况和基本用法。第2节介绍格式转换、序列提取、序列变换和序列显示等常用序列处理程序。第3节介绍序列比对程序,包括双序列比对、多序列比...
关键词：EMBOSS软件包 双序列比对 多序列比对 点阵图 核酸序列分析 蛋白质序列分析 
UniProt蛋白质数据库简介被引量：44
《生物信息学》2019年第3期131-144,共14页罗静初 
UniProt(https://www.uniprot.org/)是国际知名蛋白质数据库,主要包括UniProtKB知识库、UniParc归档库和UniRef参考序列集三部分。UniProtKB知识库是UniProt的核心,除蛋白质序列数据外,还包括大量注释信息。UniProtKB知识库分Swiss-Prot...
关键词：数据库 蛋白质序列 蛋白质功能 数据库注释 数据库交叉链接 数据库高级检索 
植物转录因子分类、预测和数据库构建被引量：25
《生物技术通报》2015年第11期68-77,共10页靳进朴 郭安源 何坤 张禾 朱其慧 陈新 高歌 罗静初 
国家自然科学基金项目(31071160;31171242;31470330);博士后科学基金项目(2014M560017;2015T80015)
转录因子在植物生长发育和应对胁迫等过程中具有重要调控作用,基因组水平上系统预测植物转录因子是研究其功能和演化的基础。通过深入全面的文献调研,总结了一套完整的植物转录因子家族分类规则,开发了转录因子预测流程,构建了转录因子...
关键词：转录因子 转录因子家族分类 转录因子预测 植物转录因子数据库 
实用生物信息技术课程教学实例被引量：4
《生物技术通报》2015年第11期102-111,共10页罗静初 
介绍"实用生物信息技术"研究生课程的5个教学实例。以血红蛋白序列和结构为例,介绍常用生物信息技术和分析方法,包括蛋白质和核酸序列相似性比对、蛋白质和核酸序列数据库检索、Blast数据库相似性搜索、分子系统发生树构建,以及蛋白质...
关键词：生物信息技术 血红蛋白 序列比对 数据库检索 Blast数据库搜索 系统发生树构建 蛋白质结构比较分析 
北京大学生物信息资源系统 提供数据和软件服务
《中国教育网络》2012年第11期61-63,共3页罗静初 
生物产业发展现状与挑战 21世纪是生命科学的卅纪，人类丛因组计划的实施使我们对于人类自身的研究进入了一个新阶段。在探索遥远的月球、火星、太阳系乃至整个宇宙奥秘的同时，
关键词：信息资源系统 软件服务 北京大学 生物 产业发展现状 生命科学 21世纪 太阳系 
猪水泡病病毒结构蛋白基因的克隆及其蛋白二级结构和淋巴细胞表位的预测被引量：1
《中国兽医科技》2005年第11期843-850,共8页郑海学 刘湘涛 尚佑军 刘光清 白兴文 罗静初 谢庆阁 
国家高技术研究发展计划(863)项目(2003AA241110)
以免疫信息学和反向疫苗学为理论根据,利用RT-PCR法获得了猪水泡病病毒(SVDV)HK/70株的基因组序列并测序,应用生物信息学相关软件和方法,对SVDV结构蛋白的二级结构的不同方面及其抗原特异性淋巴细胞表位进行了预测,综合评价了SVDV结构...
关键词：猪水泡病病毒 结构蛋白 淋巴细胞表位 二级结构 反向遗传学 反向疫苗学 
酵母基因上游与内含子可能存在的转录协同作用被引量：11
《生物化学与生物物理进展》2005年第1期46-52,共7页张昆林 张静 罗静初 
国家自然科学基金资助项目(30360027);国家重点基础研究发展规划项目(973) (2003CB715900)~~
前期研究表明,酵母高转录基因内含子与低转录基因内含子的序列结构有较大差异,高转录基因内含子中存在一些潜在的正调控位点,而且这些内含子非常靠近基因上游区,有的内含子甚至位于5'-UTR区. 这些结果提示,高转录基因内含子可能参与转...
关键词：基因上游 内含子 寡核苷酸对 协同作用 酵母基因 
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