徐坤

作品数：22被引量：39H指数：4
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发文主题：供体基因介导同源靶位点更多>>
发文领域：生物学医药卫生农业科学轻工技术与工程更多>>
发文期刊：《农业生物技术学报》《生物工程学报》《西北农林科技大学学报（自然科学版）》《遗传》更多>>
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双定位信号增强工程化蛋白线粒体靶向性呈递
《遗传》2024年第11期937-946,共10页周冰倩 李尚朴 王旭 孟祥宇 邓竞荣 邢金良 王建刚 徐坤 
农业生物育种重大专项(编号:2023ZD04074,2023ZD04051);肿瘤生物学国家重点实验室开放基金(编号:CBSKL2022ZDKF11)资助。
有效传递工程化改造的蛋白进入线粒体对开发高效的线粒体DNA编辑工具、实现线粒体疾病精准治疗具有重要意义。本研究选取eGFP和Cas9基因,在其上游或/和下游引入不同的线粒体定位信号(mitochondrial localization signal,MLS)序列,分别...
关键词：线粒体疾病 线粒体DNA编辑 工程化蛋白 线粒体定位信号 线粒体靶向 
HDACi和RS-1提高CRISPR/Cas12i介导的HDR编辑效率
《农业生物技术学报》2024年第10期2306-2323,共18页陈秋崇 李尚朴 苗洱钰 周冰倩 王旭 孟祥宇 王小龙 徐坤 
国家自然科学基金(32301251,32272848);现代农业产业体系(CARS-39-03);陕西省地方助学金项目(2022GDTSLD-46);国家级大学生创新创业训练计划(202210712099)。
CRISPR/Cas12i是我国学者新近开发的、具有自主知识产权的CRISPR基因编辑系统,被证实具有不亚于CRISPR/Cas9系统的打靶效率。同源定向修复(homology-directed repair,HDR)是DNA双链断裂(double-stranded break,DSB)的主要修复方式之一...
关键词：CPRISPR/Cas12i 同源重组 RS-1(C_(20)H_(16)Br_(2)N_(2)O_(3)S) 组蛋白去乙酰化酶抑制剂(HDACi) 绵羊 
基于小型化Cas蛋白的CRISPR/Gal4BD-Cas供体适配基因编辑系统研究
《遗传》2024年第9期716-726,共11页杨森 马宝霞 钱泓润 崔婕妤 张潇筠 李利达 魏泽辉 张智英 王建刚 徐坤 
农业农村部农业生物育种重大专项(编号:2023ZD04074,2023ZD04051)资助。
在哺乳动物细胞中,利用同源引导修复(homology-directed repair,HDR)机制的基因编辑策略能够实现精准的点编辑和敲入,但是HDR的低效性严重制约了该策略在精准医疗和分子设计育种中的应用。鉴于HDR机制所需的供体DNA模板不能自主募集到...
关键词：基因编辑 同源引导修复 供体适配 小型化Cas蛋白 适配器 
不同CRISPR/Cas9供体适配基因编辑系统的比较及优化研究
《遗传》2024年第6期466-477,共12页马宝霞 杨森 吕明 王昱人 常立业 韩艺帆 王建刚 郭杨 徐坤 
科技创新2030−农业生物育种重大项目(编号:2023ZD04074,2023ZD04051)资助。
在哺乳动物细胞中进行基因敲入通常采用同源定向修复(homology-directed repair,HDR)机制将外源DNA模板整合到目标基因组靶点中。然而HDR效率往往较低,其中外源DNA模板与目标基因组靶点的共定位是关键限制因素之一。为提高CRISPR/Cas9...
关键词：基因编辑 基因敲入 CRISPR/Cas9 供体适配 同源定向修复 
毕赤酵母细胞工厂工程化改造与应用被引量：1
《生物工程学报》2023年第11期4376-4396,共21页刘宇飞 曹颖 常立业 单聪慧 徐坤 
国家级大学生创新创业训练计划(202210712099);陕西省大学生创新创业训练计划(S202310712277);西北农林科技大学大学生创新创业训练计划(X202310712140)。
毕赤酵母作为细胞工厂在小分子代谢产物发酵和蛋白制品生物合成中扮演着重要角色,具有极其重要的工业应用价值。随着CRISPR/Cas9等新型编辑工具的开发和应用,对毕赤酵母细胞工厂进行多基因高效率的工程化改造已成为可能。本文首先对毕...
关键词：毕赤酵母 细胞工厂 基因编辑 代谢工程 合成生物学 
一种新型的CRISPR/Cas9-hLacI双链DNA供体适配基因编辑系统被引量：3
《生物工程学报》2023年第10期4204-4218,共15页马宝霞 崔婕妤 钱泓润 张潇筠 杨森 张骐镜 韩艺帆 张智英 王建刚 徐坤 
地方基金项目(NK2022010207);内蒙古自治区“揭榜挂帅”项目(2022JBGS0025)。
在CRISPR/Cas9系统介导的基因编辑中,借助于双链DNA(double-stranded DNA,dsDNA)供体模板的重组效应能够实现对目标基因组靶位点的精确编辑和基因敲入,然而高等真核生物细胞中同源重组的低效性限制了该基因编辑策略的发展和应用。为提高...
关键词：基因编辑 CRISPR/Cas9 LacI基因 LacO序列 供体适配 
一种新型提高HDR效率的 CRISPR/Cas9-Gal4BD 供体适配基因编辑系统被引量：4
《遗传》2022年第8期708-719,共12页张潇筠 徐坤 沈俊岑 穆璐 钱泓润 崔婕妤 马宝霞 陈知龙 张智英 魏泽辉 
国家自然科学基金项目(编号:32172736);陕西省重点研发计划项目(编号:2021NY-027)资助。
近年来,CRISPR基因编辑及衍生技术迅速发展,在生命科学、生物医学研究以及动植物育种领域得到了广泛应用。基于DNA双链断裂(double-stranded break,DSB)同源指导修复(homology-directed repair,HDR)机制的基因敲入和点编辑是基因编辑的...
关键词：CRISPR/Cas9 基因编辑 供体DNA 供体适配 同源指导修复 
OrfA与E2F5的互作关系及其对肺腺癌细胞增殖的影响
《西北农林科技大学学报（自然科学版）》2021年第12期11-17,27,共8页穆璐 张潇筠 韩宝泉 陈昱光 张智英 徐坤 
国家自然科学基金项目(31702099,30870119)。
【目的】确认大眼狮鲈鱼皮肤肿瘤病毒(WDSV)辅助因子OrfA与转录因子E2F5的互作关系,以及OrfA对肿瘤细胞增殖的影响。【方法】采用重组DNA技术构建orfA与E2F5基因过表达载体;通过Western Blot试验,检测对比HEK293T、Hela229宫颈癌细胞、A...
关键词：逆转录病毒周期蛋白(OrfA) E2F5转录因子 SPC-A-1肺腺癌细胞 细胞增殖 
基因编辑动物模型在人类疾病研究中的应用被引量：6
《生物工程学报》2020年第5期849-860,共12页马宝霞 沈文璐 王旭 李泽 徐坤 
陕西省自然科学基金(No.2017JQ3007),中国博士后科学基金(Nos.2018T111111,2015M580887)资助。
近年来,随着以CRISPR/Cas9为代表的多种CRISPR系统的开发和不断改进,基因编辑技术逐渐完善,并广泛应用于人类疾病动物模型的制备。基因编辑动物模型为人类疾病的发病机理、病理过程以及预防和治疗等方面的研究提供了重要的素材。目前,...
关键词：CRISPR 基因编辑 动物模型 人类疾病 
影响高校本科生传统课堂专注力的主要因素及提高对策被引量：3
《家畜生态学报》2020年第1期94-96,共3页徐秀容 薛虎平 徐坤 王喜宏 
西北农林科技大学教改项目(Z105021706)。
本科生课堂专注力低是高校传统课堂上的突出问题,也是影响大学教学质量的重要原因。除授课效果等外在原因外,还存在学生多方面的自身原因,教师应提高授课质量和改变授课风格,采取激励学生学习兴趣、重视课堂专注力考查、加强课堂管理等...
关键词：本科生 课堂专注力 影响因素 对策 
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