杨子恒

作品数:12被引量:18H指数:3
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供职机构:北京农业大学动物科技学院更多>>
发文主题:DNA序列计算机模拟研究群体遗传结构计算机DNA更多>>
发文领域:生物学更多>>
发文期刊:《遗传》《Journal of Genetics and Genomics》更多>>
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分子进化树的统计推断被引量:5
《遗传》1995年第S1期92-96,共5页杨子恒 
国家自然科学基金
关键词:分子进化树 建树方法 简约法 距离矩阵 进化速率 最大似然法 构建方法 树结构 替代速率 距离方法 
蛋白质序列间进化距离的估计
《Acta Genetica Sinica》1994年第3期198-200,共3页杨子恒 
本文考察了目前采用的估计同源蛋白质序列间进化距离的方法的缺陷,并提出了几个新的计算公式,它们考虑了氨基酸位点间显然存在的替代速率的差异。另外,提出了一种考虑氨基酸间不同替代概率的最大似然估计方法。文中对这些公式进行了...
关键词:蛋白 进化距离 序列分化 
DNA进化马尔可夫过程模型的评价与推广被引量:1
《Acta Genetica Sinica》1994年第1期17-23,共7页杨子恒 Goldm.,N 
本文对DNA序列进化过程中核苷酸替代的随机模型进行了评价,对替代速率在时间和空间上不恒定的情形进行了考察与推广。Lanave等(1984)曾提出一个模型,宣称对替代的模式未做任何假定,但事实上我们证明它假定替代过程是...
关键词:随机过程模型 分子进化 DNA 
氨基酸间的距离与蛋白质进化的随机模型
《北京农业大学学报》1993年第4期66-71,共6页杨子恒 张沅 
用遗传密码词典中61个密码作为链的状态,提出了一个氨基酸替代的马氏链模型。将20种氨基酸间首次通过时间作为突变距离与 Grantham(1974)的氨基酸间理化距离以及Dayhoff(1978)的相对替代概率做相关分析。结果表明,替代概率与理化距离的...
关键词:氨基酸 蛋白质进化 
DNA序列中限制酶切割位点的分布
《遗传》1993年第5期34-38,共5页杨子恒 
本文以人类、小鼠、大鼠和病毒基因组中的DNA序列为材料,分析了其中40种Ⅱ型限制性核酸内切酶识认位点的数量和分布情况,发现人鼠序列中绝大多数酶的切点数量可以通过序列中单核苷酸或双核苷酸的频率来预测,而切点在序列上的分布也是随...
关键词:限制性 核酸内切酶 DNA 序列 
病毒φX174基因组的核苷酸频率分析被引量:2
《Acta Genetica Sinica》1992年第5期475-480,共6页杨子恒 
本文对噬菌体ΦX174基因组的核苷酸频率进行了细致的分析。蛋白质编码基因中核苷酸在各密码位点上的分布是不随机的,且其分布模式在各基因间非常相似,可能是该基因组的特点。本文提出1个基于位点×碱基3×4表的统计量,可以揭示编码区存...
关键词:核苷酸频率 病毒 基因组 
DNA序列的信息度量揭示了DNA序列中多少信息量?
《遗传》1992年第4期44-48,共5页杨子恒 
DNA序列的信息度量D_n实际上度量的是n联体频率与根据n—1联体频率预期的值之间的差异。对病毒、线粒体、叶绿体等基因组以及真核生物基因组DNA序列进行的计算表明,D_(?)能揭示DNA序列中某些结构特征,也能将主要的生物类群区分开来,但...
关键词:DNA序列 信息度量 显著性检验 
多个核酸序列的计算机比较分析
《遗传》1991年第2期9-11,共3页杨子恒 
本文介绍了一组应用于多个DNA序列比较分析的BASIC程序。程序K1246P利用1-P、2-P、4-P和6-P替代模型估计同源DNA序列分化后的核苷酸替代数K;程序DOT利用点阵方法比较两个DNA或蛋白质序列,寻找序列间的相似性以及寡聚核苷酸、回文序列等...
关键词:DNA序列 微机程序 
长期选择的反应被引量:3
《遗传》1991年第1期44-48,共5页杨子恒 张沅 
一、引言 预测选择反应对于动物育种工作者来说,是非常重要的。对于短期反应,只根据基础群的参数就可提供准确的预测,其公式为: R=iρ_(AI)σ_A其中R为所考虑性状一代的选择反应;i为选择强度;ρ_(AI)为性状加性值A和选择标准I间的相关,...
关键词:长期选择 选择反应 
一组DNA序列分析的微机程序被引量:1
《遗传》1990年第6期15-18,共4页杨子恒 
本文介绍了作者编制的一组用于分析DNA序列资料的计算机程序。程序用BASIC语言写成,在IBM微型机上调试运行,包括序列打入、核苷酸频率统计、转译及限制酶切位点查找等几部分。
关键词:DNA序列 计算机分析 微机程序 
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