分子进化树

作品数：43被引量：178H指数：6
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叠氮丙啶-实时荧光聚合酶链式反应-高通量测序技术鉴定冷链食品中多种病原菌被引量：1
《食品安全质量检测学报》2024年第5期85-96,共12页柯振华 
福建省科技计划项目(2021Y0058)。
目的 应用叠氮丙啶-实时荧光聚合酶链式反应-高通量测序技术鉴定冷链食品中多种病原菌,构建病原菌分子进化树。方法 以冷链食品中的沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、蜡样芽胞杆菌、副溶血性弧菌、单核细胞增生李斯特氏菌5种病原菌作为研究对...
关键词：叠氮丙啶-实时荧光聚合酶链式反应技术 高通量测序 分子进化树 冷链食品 病原菌 
临床分离CRKP耐药和毒力基因检测及分子进化分析被引量：1
《中国感染控制杂志》2022年第11期1060-1067,共8页陈祖阳 徐令清 何倩君 
广东省卫计委广东省医学科学技术研究基金项目(A2021490);清远市人民医院医学科研基金项目(20190209)。
目的了解临床耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药和毒力基因携带情况,为临床防治提供依据。方法收集某院2020年3月—2021年3月临床标本分离的CRKP 36株,对菌株进行药敏鉴定,采用聚合酶链反应(PCR)扩增检测耐药基因、荚膜血清型基因...
关键词：耐碳青霉烯类高毒力肺炎克雷伯菌 耐药基因 毒力基因 分子进化树 
豫西黑猪线粒体Cytb基因遗传多样性分析被引量：2
《黑龙江畜牧兽医》2021年第19期1-4,9,共5页雷莹 白俊艳 杨又兵 张小辉 赵淑娟 庞有志 张文涛 
国家自然科学基金项目(31201777);河南科技大学博士科研启动基金项目(4025-13480084)。
为了评估河南省地方类群豫西黑猪的种质资源,分析其遗传多样性和基因混杂情况,试验以长白猪为对照,采用PCR扩增的方法,并用最大似然法(ML法)和邻接法(NJ法)构建分子进化树,对豫西黑猪线粒体Cytb基因进行了研究,并与GenBank中37个其他品...
关键词：豫西黑猪 线粒体 CYTB基因 分子进化树 遗传多样性 
渤海S油田油藏硫酸盐还原古菌分析被引量：2
《生物加工过程》2021年第5期562-568,共7页张世仑 王大威 尹榆钧 靖波 王秀军 
国家科技重大专项(2016ZX05025003)。
为了证实油藏环境中古菌的酸蚀作用,借助高通量测序的方法对渤海S油田古菌的群落组成和多样性进行分析,发现了具有硫酸盐还原功能的古菌:热球菌(Thermococcales)、古球菌(Archaeoglobales)和脱硫球菌(Desulfurococcales)。通过构建aprA...
关键词：硫酸盐还原菌 古菌 高通量测序 群落组成 分子进化树 生物竞争抑制 
2株牛源多杀性巴氏杆菌的分离鉴定及生物特性被引量：3
《中国兽医杂志》2021年第8期15-20,26,共7页高尚 徐高原 周明光 张华伟 郝根喜 陈波 顾强 向文杰 
为了诊断广东某养殖场肉牛连续出现发热、呼吸困难、病死等原因,对死亡牛进行病理剖检,采集肺、肝组织进行细菌分离。采用染色镜检和16S rRNA序列测定对分离菌进行鉴定;分型PCR对分离菌进行分型,并分析其系统进化;药敏试验分析药物敏感...
关键词：多杀性巴氏杆菌 荚膜A型 分子进化树 药敏试验 生长曲线 攻毒试验 
基于密码子偏性对应分析数据的牛病毒性腹泻病毒分型研究被引量：2
《甘肃农业大学学报》2020年第2期22-31,共10页马小静 张巧娥 李继东 
“十三五”国家重点研发计划“优质肉牛高效安全养殖技术应用与示范”项目(2018YFD0501700);宁夏自然科学基金项目(2018AAC03011).
【目的】牛病毒性腹泻病毒(BVDV)的分型对于阐明病毒的致病机理、分析其流行规律以及其进化意义重大,本文旨在探索一种基于密码子使用偏性的BVDV分型鉴定方法.【方法】应用CodonW计算102株不同BVDV病毒株基因组序列的相对同义密码子使用...
关键词：牛病毒性腹泻病毒 密码子偏性 对应分析 分子进化树 
广西口岸出入境人员HIV毒株基因多态性研究
《口岸卫生控制》2019年第1期23-27,共5页方晋 黎湘娟 樊幼珍 
目的分析广西口岸出入境人员艾滋病感染者中HIV毒株遗传特征。方法收集2017年广西各口岸出入境人员HIV感染者血液样本,提取病毒RNA,运用巢式PCR的方法对env区和pol区进行扩增,将扩增产物进行基因测序和进化树分析。结果共获得C亚型2例,...
关键词：HIV-1 分子进化树 CRF01-AE 口岸 
民猪全基因组序列测定与分析被引量：8
《东北农业大学学报》2018年第11期9-17,共9页张冬杰 何鑫淼 王文涛 汪亮 刘娣 
黑龙江省科技攻关项目(GC12B311);黑龙江省科研机构创新能力提升专项(YC2016D001);国家生猪产业技术体系项目(CARS-37)
民猪是我国优良地方猪品种,具有高繁殖、耐粗饲、抗逆和肉质优良等特性,但遗传背景模糊。为合理保护和利用民猪资源,利用Illumina Hiseq2000测序平台,采用双末端测序方法,测定10头民猪和4头东北野猪全基因组序列,统计分析SNPs和InDel标...
关键词：民猪 SNPS INDEL 主成分分析 分子进化树 
基于PG蛋白的蔷薇科植物分子进化树的构建与分析被引量：3
《分子植物育种》2018年第19期6332-6340,共9页李芳菲 马文瑶 金亮亮 杨英军 
河南省教育厅重点项目(13A210873);洛阳市科技发展计划项目(1402011A)共同资助
为了分析蔷薇科植物PG蛋白序列的进化关系,从NCBI网站搜索到177条相关蔷薇科植物PG蛋白序列,筛选出23条可用序列,采用ClustalW2和MEGA6两种聚类方法联配,并构建分子进化树。结果表明:蔷薇科植物23条PG序列聚类成2个类群,一类群有14条序...
关键词：蔷薇科 多聚半乳糖醛酸酶 分子进化树 亲缘关系 
基于拟南芥的葫芦苯丙氨酸解氨酶生物信息学分析
《科技与创新》2018年第16期72-72,76,77,共3页孙宇蛟 陈欣 李润天 王媛 郑治 
苯丙氨酸解氨酶是苯丙烷代谢途径的第一个酶,对植物发育、抗逆及信号传导起着尤为重要的作用。为了在葫芦(Lagenaria siceraria cv.USVL1VR-Ls)中更为深入地研究苯丙氨酸解氨酶的结构及理化性质,发掘更多潜在的苯丙氨酸解氨酶基因,本研...
关键词：拟南芥 苯丙氨酸解氨酶 PAL基因 分子进化树 
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