宁岩

作品数:5被引量:12H指数:2
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供职机构:中国科学技术大学计算机科学与技术学院更多>>
发文主题:基因预测生物信息学模式识别代表点数据挖掘更多>>
发文领域:自动化与计算机技术生物学医药卫生更多>>
发文期刊:《模式识别与人工智能》《生物物理学报》《北京生物医学工程》更多>>
所获基金:国家自然科学基金中国科学技术大学青年基金海外青年学者合作研究基金安徽省自然科学基金更多>>
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聚类和关联规则挖掘在基因表达数据分析中的应用研究
《北京生物医学工程》2008年第4期371-375,共5页马猛 钮俊清 宁岩 郑浩然 王煦法 
安徽省自然科学基金(050420204);安徽省高校学科拔尖人才基金(05025102);安徽省高校青年教师基金(2006jql038)资助
随着DNA微阵列技术的广泛应用,产生了海量基因表达数据,如何利用这些数据研究基因间的调控关系成为当前生物信息学的一个研究热点。关联规则挖掘是数据挖掘领域的一个重要技术,然而直接对基因表达数据进行关联规则挖掘存在两个问题:一...
关键词:生物信息学 基因表达数据 数据挖掘 聚类 关联规则 
基于统计组合与CpG含量分类的基因预测算法被引量:2
《北京生物医学工程》2007年第2期178-181,190,共5页童庆 郑浩然 宁岩 王煦法 
中国科学技术大学高水平大学建设重点项目资助
基因预测是研究基因功能、基因表达、基因之间的关联关系以及如何控制基因转录等工作的基础。现有的基因预测方法在预测内部编码外显子方面能达到较高的精度,但在预测5′端外显子方面却存在着不足。本文针对5′端外显子,构建了一种基于...
关键词:基因预测 CpG含量 线性组合 统计组合 
一种用于基因5’exons预测的新方法
《北京生物医学工程》2007年第1期13-18,共6页童庆 郑浩然 宁岩 王煦法 
国家自然科学基金委员会海外青年学者合作研究基金(60428202);中国科学技术大学高水平大学建设重点项目资助
基因预测是生物信息学领域中的一个重要研究方向。本文在研究了基因局部特征的基础上,针对现有遗传算法在预测基因5’exons方面的不足,从生物免疫机制出发,构建了一种用于基因5’exons预测的免疫遗传算法。该算法利用T细胞发育过程中强...
关键词:基因预测 5'exons 遗传算法 T细胞 生物信息学 
一种新的蛋白质结构编码方法及其应用
《生物物理学报》2005年第2期114-120,共7页陈双平 郑浩然 宁岩 王煦法 
中国科学院研究生科学与社会实践资助专项(蛋白质构象空间分析);中国科学技术大学高水平大学建设重点项目(蛋白质空间结构的生物信息学);中国科学技术大学青年基金资助(基于自然机理的快速进化模型及应用研究)。
基于四肽构象的可视化聚类的结果,提出了一种新的编码方法,由此可将蛋白质三维构象空间映射到:一维编码空间,将蛋白质三维结构空间中的模式搜索和模式发现问题转化为一维编码空间中的相应问题。通过两个算法从模式检索以及模式发现两方...
关键词:编码  序列-结构模式 四肽构象空间 
一种利用代表点的有效聚类算法设计与实现被引量:10
《模式识别与人工智能》2001年第4期417-422,共6页陈恩红 王上飞 宁岩 王煦法 
国家自然科学基金
本文针对传统的聚类算法倾向于识别大小类似的球形聚类簇,且对离群数据较为敏感等问题,利用聚类簇代表点选取的方法,设计了一种有效的聚类算法。该方法首先从聚类簇中选取充分分散的若干数据点,然后将它们向聚类簇的重心收缩,依此得到...
关键词:层次式聚类 代表点 有效聚类算法 数据挖掘 模式识别 
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