郝彤

作品数:9被引量:18H指数:3
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供职机构:天津师范大学生命科学学院更多>>
发文主题:代谢网络代谢工程生物计算生物技术领域生物技术更多>>
发文领域:生物学农业科学自动化与计算机技术更多>>
发文期刊:《天津师范大学学报(自然科学版)》《生物工程学报》《数学的实践与认识》《安徽农业科学》更多>>
所获基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划中国博士后科学基金国家科技支撑计划更多>>
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凡纳滨对虾营养需求研究被引量:5
《安徽农业科学》2021年第1期1-5,10,共6页郜晨晨 郝彤 杨佳睿 孙金生 
国家重点研发计划(2018YFD0901301);国家“973”项目(2012CB114405);国家自然科学基金项目(31770904);天津市人才发展特殊支持计划高层次创新创业团队项目(ITTFRS2017007);天津市高等学校创新团队建设规划(TD13-5076)。
凡纳滨对虾是目前世界上养殖虾类产量最高的三大品种之一,是水产养殖中非常重要的物种。提高凡纳滨对虾的产量是水产养殖中的重要课题。综合现有关于凡纳滨对虾营养学的研究,从蛋白质、脂类、碳水化合物、微生物和矿物质几个方面出发,...
关键词:凡纳滨对虾 水产养殖 营养需求 
中华绒螯蟹免疫蛋白互作网络提取及分析
《天津师范大学学报(自然科学版)》2017年第4期40-45,共6页王彬 宁黔冀 王倩 彭玮 郝彤 孙金生 
国家高技术研究发展计划(863计划)资助项目(2012AA10A401;2012AA092205);国家重点基础研究发展计划(973计划)资助项目(2012CB114405);国家自然科学基金资助项目(21106095);国家科技支撑计划资助项目(2011BAD13B07;2011BAD13B04);天津市应用基础与前沿技术研究计划资助项目(15JCYBJC30700);天津市"三年引进千名高层次人才"计划资助项目(5KQM110003);天津市"131"创新型人才培养工程资助项目(ZX110170);天津师范大学青年教师学术创新推进计划资助项目(52XC1403)
为了研究中华绒螯蟹的免疫蛋白作用机制,在已构建的中华绒螯蟹蛋白互作网络基础上,采用邻接节点注释方法对其全局网络进行细胞组分注释,为网络的903个未定位蛋白中的830个添加了GO注释,占未定位蛋白的91.9%.从中华绒螯蟹蛋白互作网络中...
关键词:中华绒螯蟹 蛋白互作网络 邻接节点注释 免疫蛋白 
人中心体的纯化提取及蛋白质谱分析
《山东大学学报(医学版)》2014年第12期54-59,共6页钟铠泽 赵健 袁首道 王庐宇 荆艳洁 郝彤 陈健行 詹启敏 姜伟 朱长军 潘丽娜 
分子肿瘤学国家重点实验室开放课题(SKL-KF-2013-12);国家自然科学基金(31271485);教育部“新世纪优秀人才支持计划”(NCET-11-1066)
目的提取人类细胞中的中心体,结合蛋白质谱分析,鉴定中心体蛋白组成。方法采用密度梯度离心方法提取K562细胞内中心体。经蛋白免疫印迹鉴定后,对样品进行蛋白质谱分析检测。对已检测出的中心体蛋白分子,应用基因本体(GO)进行系统分析。...
关键词:中心体 蛋白质谱分析 蛋白组学 
中国明对虾和中华绒螯蟹EST的Blast2GO注释及其在免疫基因分布研究中的应用被引量:1
《天津师范大学学报(自然科学版)》2014年第1期62-66,共5页曾铮 张亦陈 刘逸尘 郝彤 孙金生 
国家973计划资助项目(2012CB114405);国家863计划资助项目(2012AA092205;2012AA10A4);国家科技支撑计划资助项目(2011BAD13B04;2011BAD13B07)
以dbEST数据库中公布的中国明对虾和中华绒螯蟹的EST序列作为数据源,利用CAP3对其进行聚类拼接,采用Blast2GO软件进行功能注释,并通过查找免疫相关的GO注释和检索免疫关键词的方法寻找免疫相关基因,经与不同物种免疫基因的比较,推测可...
关键词:中国明对虾 中华绒螯蟹 免疫基因 基因功能注释 EST Blast2GO 
外部代谢物模拟在代谢工程中的应用指导
《化学工业与工程》2013年第6期74-79,共6页耿昭辉 郝彤 马红武 
国家重点基础研究项目(2012CB725203;2011CBA00804);国家自然科学基金项目(NSFC-21106095)
外部代谢物是代谢网络模型中通过添加运输反应来平衡其在菌体内的通量的一类代谢物,比如底物、产物或副产物、信号分子等。首次通过对模型中运输反应的模拟来预测大肠杆菌和枯草芽孢杆菌在不同的生长状态下外部代谢物的优先排出顺序。...
关键词:基因组尺度代谢网络模型 外部代谢物 代谢工程 优先顺序 
一种基于代谢网络分析最小化基因组的方法及其在大肠杆菌中的应用被引量:1
《生物工程学报》2013年第8期1173-1184,共12页汤彬彩 郝彤 袁倩倩 陈涛 马红武 
国家重点基础研究发展计划(Nos.2012CB725203;2011CBA00804);国家自然科学基金(Nos.NSFC-21106095;NSFC-21176182)资助~~
最小生命体的合成是合成生物学研究的重要方向。最小化基因组的同时而又不对细胞生长产生影响是代谢工程研究的一个重要目标。文中提出了一种从基因组尺度代谢网络模型出发,通过零通量反应删除及对非必需基因组合删除计算获得基因组最...
关键词:基因组尺度代谢网络 基因组最小化 组合算法 大肠杆菌 
大尺度代谢网络通量平衡分析的进展与应用被引量:1
《化学工业与工程》2013年第3期71-79,共9页李慧 马红武 郝彤 
国家自然科学基金项目(NSFC-21106095;NSFC-20806055;NSFC-20875068);国家重点基础研究项目(2011CBA00804);博士后科学基金项目(2011M500512)
利用大尺度代谢网络分析生物体内部复杂的生化机制已经研究了很多年,大尺度代谢网络的算法也有很多,在这其中通量平衡分析是一个有效的定量研究基因组尺度代谢网络的方法,并在很多分析中都有应用。总结了通量平衡分析算法的最新进展,包...
关键词:大尺度代谢网络 通量平衡分析 算法 软件工具 
云计算在生物技术领域的应用被引量:3
《数学的实践与认识》2012年第17期117-123,共7页郝彤 马红武 赵学明 
国家重点基础研究发展计划(973)资助项目(2012CB725203;2011CBA00804);国家自然科学基金(21106095;61100124;20875068;20806055);中国博士后科学基金(2011M500512)
随着基因组测序等生物学技术的发展,海量生物学数据不断产生,生物计算对计算能力和存储量的要求也越来越高.云计算所具有的高速的计算能力、高存储量以及使用方便等特点能够很好地满足生物研究的需求,融合云计算成为生物计算发展的趋势...
关键词:云计算 生物技术 生物计算 
基因组尺度代谢网络自动重构及分析工具研究进展被引量:7
《生物工程学报》2012年第6期661-670,共10页郝彤 马红武 赵学明 
国家重点基础研究发展计划(973计划)(Nos.2012CB725203;2011CBA00804);国家自然科学基金(Nos.21106095;61100124;20806055;20875068);中国博士后科学基金(No.2011M500512)资助~~
高通量数据的产出为基因组尺度代谢网络的构建提供了基础,但同时也对网络构建和分析方法的改进提出了挑战。随着数据量的不断增大,耗时耗力的人工构建及分析已经无法满足模型发展的需要,因而各种自动化的方法应运而生。模型构建和分析...
关键词:基因组尺度 代谢网络 自动重构 网络分析 
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