王雄飞

作品数：3被引量：6H指数：2
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供职机构：南京农业大学更多>>
发文主题：蛋白质亚细胞定位亚细胞蛋白序列哈希表动态规划法更多>>
发文领域：生物学自动化与计算机技术更多>>
发文期刊：《微生物学通报》《食品与生物技术学报》《生物工程学报》更多>>
所获基金：中央高校基本科研业务费专项资金江苏省自然科学基金江苏省博士后科研资助计划项目国家科技支撑计划更多>>
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集成改进KNN算法预测蛋白质亚细胞定位被引量：3
《生物工程学报》2017年第4期683-691,共9页薛卫 王雄飞 赵南 杨荣丽 洪晓宇 
中央高校基本科研业务费专项资金(No.KYZ201668);江苏省自然科学基金(No.BK2012363);国家科技支撑计划(No.2015BAK36B05)资助~~
基于Adaboost算法对多个相似性比对K最近邻(K-nearest neighbor,KNN)分类器集成实现蛋白质的亚细胞定位预测。相似性比对KNN算法分别以氨基酸组成、二肽、伪氨基酸组成为蛋白序列特征,在KNN的决策阶段使用Blast比对决定蛋白质的亚细胞...
关键词：亚细胞区间 蛋白序列特征 K-nearest NEIGHBOR basic local ALIGNMENT search tool ADABOOST 
词袋模型在蛋白质亚细胞定位预测中的应用被引量：5
《食品与生物技术学报》2017年第3期296-301,共6页赵南 张梁 薛卫 王雄飞 任守纲 
中央高校基本科研业务费专项资金项目(KYZ201668);江苏省自然科学基金项目(BK2012363;BK2011153);江苏省博士后科研计划项目(1302038B)
运用词袋模型结合传统的蛋白质特征提取算法提取蛋白质序列特征,采用K-means算法构建字典,计算获得蛋白质序列的词袋特征,最终将提取的特征值送入SVM多类分类器,对数据集中蛋白质的亚细胞位置进行预测,在一定程度上提高了亚细胞定位预...
关键词：词袋模型 K-MEANS 支持向量机 亚细胞定位预测 
相似性比对预测蛋白质亚细胞区间被引量：1
《微生物学通报》2016年第10期2298-2305,共8页王雄飞 张梁 薛卫 赵南 徐焕良 
中央高校基本科研业务费专项资金项目(No.KYZ201668);江苏省自然科学基金项目(No.BK2012363;BK20140002);江苏省博士后科研项目(No.1302038B)~~
【目的】对蛋白质所属的亚细胞区间进行预测,为进一步研究蛋白质的生物学功能提供基础。【方法】以蛋白质序列的氨基酸组成、二肽、伪氨基酸组成作为序列特征,用BLAST比对改进K最近邻分类算法(K-nearest neighbor,KNN)实现蛋白序列所属...
关键词：亚细胞区间 KNN BLAST 蛋白序列特征 
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