张文

作品数：13被引量：40H指数：3
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供职机构：江苏大学临床医学院更多>>
发文主题：宏基因组学病毒中性粒细胞基因组环状病毒更多>>
发文领域：医药卫生农业科学文化科学更多>>
发文期刊：《国际检验医学杂志》《中国动物传染病学报》《考试周刊》《江苏预防医学》更多>>
所获基金：国家自然科学基金江苏省科技厅基金江苏省社会发展科技计划常州市社会发展科技计划项目更多>>
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纳米孔测序技术及其在病原学诊断中的应用进展被引量：3
《江苏大学学报（医学版）》2023年第6期502-508,共7页庄子 孟雨桐 刘润旸 焦馨怡 芦娟 尹军 张文 杨世兴 沈权 
国家重点研发计划项目(2017YFC1200201);江苏省高校基础科学(自然科学)研究项目(22KJA320001);常州市社会发展项目(CE20225001)。
在病原学诊断中,基因测序扮演着重要的角色,测序技术也在不断地更新发展,其中牛津纳米孔科技(Oxford Nanopore Technologies,ONT)公司所推出的纳米孔测序技术近年来发展迅速,并凭借其超长读长、快速实时测序、简单便携以及能够读取蛋白...
关键词：纳米孔测序 基因测序 高通量测序 第三代测序技术 单分子测序 
野生大雁新发单链环状DNA病毒基因组鉴定和分析
《中国动物传染病学报》2023年第6期101-107,共7页姚雨欣 杨世兴 沈权 王晓春 张文 
国家重点研发计划(2017YFC1200201)。
野鸟作为多种致病性病毒的天然宿主,可通过迁徙活动广泛传播病毒,给人类和其他动物的生命安全带来了严峻挑战。本研究中,我们从青海湿地公园的野生大雁泄殖腔拭子中鉴定出13个新型CRESS-DNA病毒全基因组。此外,基于Rep蛋白的系统发育分...
关键词：CRESS-DNA病毒 环状DNA病毒 病毒宏基因组学 野生大雁 
新发林麝环状类病毒的鉴定和分析被引量：1
《中国动物传染病学报》2022年第1期39-43,共5页刘齐 杨世兴 张文 齐敦武 付为国 
国家重点研发计划(2017YFC1200201);国家自然基金(81741062)。
利用病毒宏基因组学(viral metagenomics)方法,本研究从95份林麝粪便样品中检测到1株新型圆环病毒样(Circoviruslike)病毒,经过拼接获得其全基因组序列,该毒株命名为ls-cyc。其基因组全长约3552 nt,GC含量39.00%,含有2个开放阅读框(ORF)...
关键词：林麝 环状病毒 病毒宏基因组学 基因组结构分析 系统发育分析 
镇江地区上呼吸道病毒感染患儿鼻腔病毒谱构成
《检验医学》2021年第4期408-411,共4页王亚楠 张文 
国家自然科学基金项目(81741062);江苏省重点研发计划(BE2017693)。
目的通过病毒宏基因组学分析镇江地区上呼吸道病毒感染患儿鼻腔病毒谱构成。方法收集100份呼吸道疾病患儿鼻黏膜分泌物样本,提取核酸,采用高通量测序平台进行测序,通过病毒宏基因组学分析平台分析病毒谱。结果镇江地区上呼吸道病毒感染...
关键词：儿童 上呼吸道 病毒宏基因组学 高通量测序 腺病毒科 小RNA病毒科 镇江地区 
病毒宏基因组学在新发病毒快速确认中的优势被引量：3
《江苏大学学报（医学版）》2021年第1期6-10,16,共6页张文 代紫苑 鲍思雯 茅庆庆 
国家重点研发计划子课题(2017YFC1200201);江苏省重点研发计划(BE2017693)。
新发病毒性传染病已成为人类健康的巨大威胁。自然界存在大量的未知新型病毒,它们可能构成人类未来新发传染病的传染源。由于未知新型病毒遗传信息与已知病毒差异较大,因而传统的病毒检测方法难以有效发现它们。近年来,随着病毒分子生...
关键词：病毒宏基因组学 下一代测序 新发病毒 新发传染病 疾病关联分析 
不明原因发热患者肺泡灌洗液病毒群落解析被引量：1
《江苏大学学报（医学版）》2020年第5期395-401,共7页李欣霖 刘齐 陈旭 肖宇晴 杨世兴 张文 陈建国 
国家重点研发计划资助项目(2017YFC1200201);国家自然科学基金资助项目(81741062);江苏省重点研发计划项目(BE2017693)。
目的:分析不明原因发热患者肺泡灌洗液中的病毒谱。方法:将58例肺泡灌洗液样本随机分为5组分别构建5个文库,利用病毒宏基因组学技术进行病毒群落分析,并对获得的细环病毒及鼻病毒进行阳性样本筛选。结果:肺泡灌洗液病毒群落组成中,指环...
关键词：肺泡灌洗液 病毒宏基因组学 细环病毒 鼻病毒 系统进化分析 
1例引起突发性耳聋的猪链球菌的鉴定及分子流行病学分析被引量：3
《国际检验医学杂志》2020年第17期2150-2154,共5页郑礼杰 李欣霖 张文 陈建国 谈忠鸣 许金凤 
江苏省社会发展重点研发项目(BE2017693);镇江市社会发展项目(SH2019057);镇江市第一人民医院院级课题(Y2019010)。
目的分离鉴定1例突发性耳聋患者血液和脑脊液分离的猪链球菌并进行分子流行病学分析。方法采用VITEK-2 Compact微生物系统进行初步鉴定和药敏试验,PCR扩增细菌的16S rRNA基因、7个管家基因及4种毒力基因。通过实时荧光定量PCR进行血清...
关键词：猪链球菌 突发性耳聋 多位点序列分型 毒力因子 
人类肠道病毒的特征和研究进展被引量：2
《江苏预防医学》2020年第4期395-397,402,共4页王惠玲 朱柯颖 王心灵 张文 
江苏省重点研发计划项目(BE2017693);国家重点研发计划子课题项目(2017YFC1200201)。
噬菌体和真核生物病毒是最具代表性的肠道病毒,其中CrAss噬菌体是人类病毒组的核心,人内源性逆转录病毒是人类基因组中稳定的遗传标志。噬菌体的溶原转化增强了其自身和宿主菌的进化优势,使其逐渐与宿主基因融为一体。本综述通过对肠道...
关键词：人类肠道病毒 噬菌体 细菌 
新型冠状病毒SARS-CoV-2亟待阐明的若干关键科学问题被引量：7
《江苏大学学报（医学版）》2020年第2期97-100,108,共5页沈权 王建强 杨世兴 王晓春 张文 
江苏省社会发展项目(BE2016663);江苏省出入境检验检疫局项目(2018KJ07);常州市社会发展项目(CE20185002);张家港市科技计划项目(ZKS1703)。
2019年底爆发的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)至今在全球已造成超过8万人感染、2700多人死亡(截至2020年2月25日)。虽然SARS-CoV-2与2003年爆发的SARS-CoV同属冠状病毒科、β冠状病毒属且相似性较高,全基因组同源性约79%,但是两者在病程、...
关键词：新型冠状病毒 宿主 传播途径 全球流行 
病毒宏基因组学方法鉴定出小熊猫粪便中一株新型指环状病毒被引量：3
《上海交通大学学报（农业科学版）》2018年第1期14-19,35,共7页郭靓骅 吴孔菊 华修国 崔立 张文 齐敦武 
国家自然科学基金(31270186;31372223);四川省大熊猫保育研究基金(CPFResearch CPF2014-02);上海交通大学Agri-X项目(AF1500028/001)
研究从2份小熊猫粪便样品中检测到了一种新型的指环状病毒,命名为AV-Chengdu1(GenBank KX611132)。全基因组测序结果表明,其基因组全长约2 900nt,GC含量为49.8%;基因组结构分析表明其含3个开放阅读框(ORF1:1 743nt,ORF2:393nt,ORF3:399n...
关键词：小熊猫 病毒宏基因组学 指环状病毒 基因组结构分析 系统进化分析 
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