马晓慧

作品数:12被引量:28H指数:3
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供职机构:北京工业大学更多>>
发文主题:打分函数蛋白质-蛋白质分子对接胰岛素HIV-1整合酶更多>>
发文领域:医药卫生生物学理学更多>>
发文期刊:《科学通报》《生物物理学报》《Acta Biochimica et Biophysica Sinica》《医用生物力学》更多>>
所获基金:国家自然科学基金北京市自然科学基金国家教育部博士点基金北京市教委科技发展计划更多>>
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蛋白质-蛋白质分子对接方法研究进展被引量:11
《生物化学与生物物理进展》2006年第7期616-621,共6页李春华 马晓慧 陈慰祖 王存新 
国家自然科学基金资助项目(30400087;10574009);北京市自然科学基金(5042003);国家教育部博士点基金(2004005013)资助项目~~
蛋白质分子间相互作用与识别是21世纪生命科学研究的前沿和热点.分子对接方法是研究这一课题有效的计算机模拟手段.通常,蛋白质-蛋白质分子对接包括四个阶段:搜索受体与配体分子间的结合模式,过滤对接结构以排除不合理的结合模式,优化结...
关键词:蛋白质-蛋白质分子对接 过滤 打分函数 分子柔性 
针对蛋白质复合物Other类型的打分函数被引量:2
《物理化学学报》2006年第5期622-626,共5页沈龙珠 李春华 马晓慧 常珊 陈慰祖 王存新 
国家自然科学基金(30400087;10574009);教育部博士学科点专项基金(20040005013);北京市自然科学基金(5042003)资助项目
在不同类型复合物结合界面的物理化学特征不同的基础上,针对较难预测的Other类型复合物设计出特异性打分函数,用于在对接过程中挑选出有效结构.该函数由原子接触能(EACE)、范德华和静电相互作用能组成,通过多元线性回归方法获得各项的...
关键词:打分函数 原子接触能 残基成对势 Other类复合物 CAPRI 
原胶原分子间的交联结构拉伸力学特性的量子化学计算模拟被引量:1
《医用生物力学》2006年第2期120-124,共5页钟红刚 马晓慧 袁小龙 王存新 
目的了解成骨过程胶原分子组装结构的力学特性;方法采用量子化学计算软件模拟骨I型胶原中的赖氨酸残基-羟赖氨酸残基醛缩交联结构的拉伸力-位移关系。结果模拟结果显示:拉伸力-位移曲线为非线性;初始能量优化后,连接结构分子体系两α碳...
关键词:胶原分子交联 量子化学计算 模拟拉伸断裂 
HIV-1整合酶蛋白的可溶性表达及功能研究被引量:3
《中国生物工程杂志》2006年第1期22-26,共5页程绍辉 马晓慧 何红秋 刘斌 陈慰祖 王存新 
国家自然科学基金资助项目(30500429);北京市教委重点基金资助项目(KZ200410005002)
HIV-1整合酶是HIV病毒复制中一个重要的酶,也是治疗艾滋病药物的一个重要靶点。为了开展以整合酶蛋白为靶点的抑制剂筛选,构建HIV-1整合酶重组质粒,在原核细胞中进行可溶性表达和功能研究。通过重叠PCR技术引入F185K和C280S突变于HIV-1...
关键词:HIV-1整合酶 克隆 表达 ELISA 
用从头药物设计方法合理设计HIV-1整合酶抑制剂被引量:1
《军事医学科学院院刊》2005年第4期355-358,共4页马晓慧 陈慰祖 王存新 
北京市自然科学基金项目(5032002;5042003);北京市教委重点基金资助项目(KZ200410005002)
目的:合理设计新的HIV-1整合酶抑制剂。方法:采用从头药物设计方法,从苯乙烯基喹啉抑制剂与整合酶的活性位点出发,产生3220个化合物。同时,通过分子对接方法模拟分析这些化合物与整合酶的结合能和结合模式。结果:设计产生的这些化合物...
关键词:HIV-1 整合酶 抑制剂 分子对接 从头药物设计方法 
锚定表达GM-CSF疫苗的抑瘤效果研究被引量:1
《中国肿瘤生物治疗杂志》2004年第1期27-30,共4页程绍辉 马晓慧 陈兴 于继云 
863计划项目(2001AA217131)资助
目的:研究锚定表达GM—CSF的小鼠黑色素瘤作为肿瘤疫苗的有效性。方法:GM-CSF基因嵌合GPI信号肽修饰序列实现在B16小鼠黑色素瘤细胞表面的锚定表达,研究锚定修饰的B16细胞于同源C57BL/6小鼠的成瘤性及诱导抗肿瘤免疫的效果。结果:抑瘤...
关键词:膜表达 GM—CSF 抗肿瘤免疫 
单细胞电泳法检测肿瘤患者化疗后淋巴细胞DNA损伤被引量:2
《中国实验血液学杂志》2003年第5期534-537,共4页程绍辉 马晓慧 卜黎明 刘宁 孙殿军 
应用单细胞电泳 (SCGE)检测肿瘤患者环磷酰胺化疗后外周血T淋巴细胞DNA损伤。在标准SCGE条件下应用彗星图象分析系统定量分析人T淋巴细胞DNA的损伤程度。彗星图象分析研究结果显示 ,肿瘤患者外周血T淋巴细胞DNA损伤明显强于正常对照组 ...
关键词:单细胞凝胶电泳 DNA损伤 环磷酰胺 淋巴细胞 彗星图象分析系统 肿瘤患者 
蛋白质-蛋白质对接中打分函数的研究被引量:2
《生物物理学报》2003年第1期47-52,共6页李春华 马晓慧 陈慰祖 王存新 
国家自然科学基金(29992590-2;30170230;10174005);北京市自然科学基金(5032002)项目
通过分析蛋白质-蛋白质间的静电、疏水作用和熵效应与相对于晶体结构的蛋白质主链原子的均方根偏差(RMSD)的相关性,定量地考查了它们在蛋白质-蛋白质对接中作为打分函数评价近天然构象的能力。对7个蛋白质复合物体系的分析表明,就水化...
关键词:结合自由能 溶剂化自由能 侧链熵 静电能 
预测蛋白质-蛋白质复合物结构的软对接算法(英文)
《生物化学与生物物理学报》2003年第1期35-40,共6页李春华 马晓慧 陈慰祖 王存新 
国家自然科学基金 (No .2 9992 5 90 2,No .30 170 2 30,No .10 1740 0 5 );北京市自然科学基金 (No .5 0 32 0 0 2 )资助项目~~
提出了一种有效的软对接算法 ,用于在已知受体和配体三维结构的条件下预测蛋白质 蛋白质复合物的结构。该算法的分子模型基于Janin提出的简化蛋白质模型 ,并在此基础上有所改进。对蛋白质分子表面的柔性氨基酸残基Arg、Lys、Asp、Glu和...
关键词:蛋白质-蛋白质相互作用 分子识别 分子柔性 结合自由能 预测 蛋白质-蛋白质复合物 结构 软对接算法 
HIV-1辅助受体的研究进展
《北京工业大学学报》2003年第1期59-63,共5页谭建军 张小轶 马晓慧 陈慰祖 王存新 
北京市自然科学基金资助项目(5032002);北京市教委科技发展计划基金
综述了HIV辅助受体研究的新进展,特别是有关细胞嗜性、CXCR4在介导病毒进入细胞中的作用、gp120与CXCR4的作用区域、CCR5的结构及其在介导病毒进入细胞中的作用、gp120与CCR5的作用区域。人免疫缺陷病毒1型(HIV-1)感染细胞时,病毒先附...
关键词:辅助受体 人免疫缺陷病毒 HIV 细胞嗜性 获得性免疫缺陷综合症 艾滋病 AIDS 
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