张文

作品数:2被引量:1H指数:1
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供职机构:南京农业大学理学院更多>>
发文主题:粒子群优化支持向量机RNA聚合酶II启动子序列启动子识别更多>>
发文领域:生物学更多>>
发文期刊:《生物物理学报》《安徽农业大学学报》更多>>
所获基金:江苏省自然科学基金国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金国家教育部博士点基金更多>>
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应用基于粒子群优化的支持向量机算法识别真核生物基因的RNA聚合酶II启动子序列被引量:1
《生物物理学报》2015年第2期143-153,共11页张文 骈聪 陈园园 张瑾 李琴 张良云 
国家自然科学基金项目(11401311);江苏省自然科学基金项目(BK20141358)~~
启动子是调节基因表达的重要元件,对其的研究对于阐明基因转录调控机制具有重要意义。作者依据RNA聚合酶Ⅱ启动子序列特性选取高效的特征提取方法,构建了基于粒子群优化的支持向量机(particle swarm optimization-support vector machin...
关键词:位置关联权重矩阵 粒子群优化 支持向量机 随机森林 极限学习机 启动子识别 
基于粒子群优化的支持向量机算法识别人类基因启动子
《安徽农业大学学报》2015年第2期310-315,共6页张文 陈园园 张瑾 骈聪 李琴 张良云 
教育部博士点基金(20100097110040);中央高校基本科研业务费专项资金(KYZ201125);江苏省自然科学基金(BK20140676;BK20141358)共同资助
人类基因启动子识别是医学研究的基本需要。提取DNA序列碱基的PZ曲线特征、二核苷酸空间结构特征、保守信号似然得分,以及K联体似然得分,结合GC含量变化和非均匀指数,构建基于粒子群优化的支持向量机算法来识别人类基因启动子。利用粒...
关键词:相位特异PZ曲线 粒子群优化 支持向量机 启动子预测 
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