国家自然科学基金(61271448)

作品数:8被引量:10H指数:2
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Evolutionary direction of processed pseudogenes被引量:1
《Science China(Life Sciences)》2016年第8期839-849,共11页Guoqing Liu Xiangjun Cui Hong Li Lu Cai 
supported by the National Natural Science Foundation(61102162,61271448,31260274,31260219);the Program for Young Talents of Science and Technology in Universities of Inner Mongolia Autonomous Region(NJYT-14-B10);the Inner Mongolia Science&Technology Plan(20140401)
While some pseudogenes have been reported to play important roles in gene regulation, little is known about the possible relationship between pseudogene functions and evolutionary process of pseudogenes, or about the ...
关键词:GC content mutual information transcription factor binding motifs mutational bias recombination 
体外组装含有组蛋白变体H2A.Z及H3.3的核小体被引量:4
《中国生物工程杂志》2016年第3期53-60,共8页赵宏宇 刘媛 张凤慧 邢永强 蔡禄 
国家自然科学基金(61271448);内蒙古自然科学基金(2013MS0514;2014MS0312)资助项目
核小体是构成真核生物染色质的基本结构单位,组蛋白变体H2A.Z及H3.3对染色质结构及基因转录过程发挥着重要的调控作用。体内研究核小体及染色质结构受到诸多因素限制,体外重构含有H2A.Z及H3.3的核小体结构是研究与组蛋白变体相关基因表...
关键词:组蛋白变体 核小体定位 染色质结构 荧光标记 
基于序列信息预测内含子保留型可变剪接
《湖北农业科学》2016年第1期208-213,共6页李敏 李瑞彬 邢永强 蔡禄 
国家自然科学基金项目(61271448);内蒙古自然科学基金项目(2014MS0312;2014MS0311;2013MS0514);内蒙古科技大学创新基金项目(2014QDL012)
可变剪接是遗传信息传递与表达的重要环节,真核生物多外显子基因pre-m RNA的可变剪接现象非常普遍。可变剪接增加了蛋白质的多样性,影响诸如细胞组织特异性分化、个体发育、疾病发生等重要的生物学过程。基于内含子的k-mer(k=1…5)信息...
关键词:可变剪接 内含子保留 多样性增量 二次判别函数 
可变剪接与蛋白质结构多样性被引量:4
《生物物理学报》2015年第1期65-75,共11页李敏 刘国庆 蔡禄 
国家自然科学基金项目(61271448);内蒙古自治区科技创新团队项目;内蒙高校青年科技英才支持计划~~
研究可变剪接和蛋白质结构多样性之间的相关性,对于理解可变剪接的功能具有重要意义。已有研究支持可变剪接增加蛋白质结构多样性的观点,但可变剪接影响蛋白质结构的程度、机制等还尚未阐明。作者基于具有确定三维结构的可变剪接蛋白质...
关键词:可变剪接 蛋白质结构 蛋白质稳定性 疏水非均一性 
人类转录因子与剪接因子互作网络的构建与分析被引量:1
《生物物理学报》2014年第3期238-246,共9页魏官云 邢永强 蔡禄 
国家自然科学基金项目(61271448)~~
转录因子与剪接因子分别是转录和剪接过程中的重要调控蛋白,研究转录因子与剪接因子的偶合作用对理解真核生物的基因表达调控有重要意义。作者基于SpliceAid F、TFclass、HPRD、Biogrid、DIP、Intact和HINT数据库,构建了转录因子和剪接...
关键词:转录因子 剪接因子 蛋白互作网络 
人类组成型和可变外显子的密码子偏性及聚类分析
《湖北农业科学》2014年第11期2675-2679,共5页张占军 邢永强 王成爱 
国家自然科学基金项目(61271448)
通过计算人类组成型外显子和可变外显子的RSCU值,对两种外显子的RSCU值进行了比较。结果表明,除了UAG、UGA、UAA 3个终止密码子外,两种外显子的密码子偏性都是相同的。对30条可变外显子和30条组成型外显子序列的RSCU值进行聚类分析,聚...
关键词:人类 组成型外显子 可变外显子 密码子偏性 聚类 
基于多信息融合的酵母重组冷热点预测
《科学通报》2014年第11期953-959,共7页张冰洁 刘国庆 蔡禄 
国家自然科学基金(61102162,61271448)资助
减数分裂重组并非均匀发生在基因组上,而是在一些区域有着较高的重组频率(重组热点),在另一些区域重组频率较低(重组冷点).重组的发生不仅与序列特征有关,还依赖于染色质的结构.准确鉴定重组热点和冷点对于认识重组发生的分子机制以及...
关键词:重组热点 k-mer频数 热力学稳定性 核小体占据率 
原核生物大肠杆菌基因组序列形成核小体能力的预测
《信阳师范学院学报(自然科学版)》2013年第2期204-207,300,共5页陈冰 任松叶 赵秀娟 蔡禄 
国家自然科学基金项目(61271448);内蒙古自然科学基金项目(2011MS0504);内蒙古高等学校科研基金项目(NJZY12103)
以大肠杆菌基因组为研究对象,基于体外组装的核小体序列中k-mers频数信息,采用多样性增量结合二次判别算法对核心DNA和连接DNA进行分类预测,整体准确率和相关系数分别达到83.08%和0.619.对大肠杆菌、酵母和人类基因组中核小体定位序列...
关键词:大肠杆菌基因组 核小体定位 k-mers频数 多样性增量 二次判别 
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