染色质结构

作品数:109被引量:149H指数:5
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基于密度聚类的染色质拓扑相关结构域识别方法
《生物医学工程学杂志》2024年第3期552-559,共8页龚海燕 张司臣 张晓彤 
国家重点研发项目(2023YFB3812901);中国博士后科学基金资助项目(2023M740219);国家资助博士后研究人员计划(GZC20230239)。
高通量染色质构象捕获(Hi-C)技术的快速发展为染色质结构分析提供了丰富的基因组位点间交互作用数据,但目前基于Hi-C数据的已有拓扑相关结构域(TAD)识别方法存在准确率低、参数敏感等问题。在此背景下,本文设计并实现了一种基于空间密...
关键词:高通量染色质构象捕获 拓扑相关结构域 染色质结构 密度聚类 生物信息学分析 
配子及早期胚胎发育过程中的DNA甲基化动态改变
《实用妇产科杂志》2024年第1期6-9,共4页李明皓 潘洁雪 黄荷凤 
国家自然科学基金基础科学中心项目(编号:82088102);中国医科院胚胎源性疾病创新单元(编号:2019-I2M-5-064);上海市卫生健康委员会协同创新集群项目(编号:2020CXJQ01);上海市妇科疾病临床医学研究中心(编号:22MC1940200);上海市申康医院发展中心临床三年行动计划资助项目(编号:SHDC2020CR1008A);上海市泌尿生殖系统疾病研究中心(编号:2022ZZ01012)。
近年来,随着对染色质DNA、组蛋白、RNA化学修饰了解的深入,表观遗传学在胚胎发育、疾病发生发展中的生物学作用被逐步揭示。其中,DNA甲基化作为一种重要的表观遗传学修饰,在基因表达调控与染色质结构调节中具有重要作用。在哺乳动物细胞...
关键词:DNA甲基化 表观遗传学 早期胚胎发育 染色质结构 基因表达调控 碳原子 化学修饰 CPG 
动物早期胚胎发育中表观重编程的机制被引量:2
《畜牧兽医学报》2023年第12期4898-4909,共12页张宸艺博 余彤 任斌斌 郑睿智 朱文治 苏建民 
国家自然科学基金(32172812);青海省重点研发与转化计划(2023-NK-131)。
哺乳动物早期胚胎发育过程中,受精卵经历了一系列表观遗传重编程事件,去除了雌雄原核的表观遗传记忆,从而建立了胚胎的全能性。然而,这些重编程事件的进行必须受到种属特异性的精确调控,而相关的调控机制仍需进一步研究。随着分子生物...
关键词:早期胚胎发育 表观遗传重编程 DNA甲基化 组蛋白修饰 染色质结构 
染色质结构蛋白变异与人类疾病被引量:1
《中国科学:生命科学》2023年第11期1575-1594,共20页曹红 吴迪 魏瑜 林海燕 李国红 
北京市科技计划项目(批准号:Z221100007022001);国家自然科学基金(批准号:32300435,32270581)资助。
层级复杂的三维染色质结构对于细胞命运决定和功能维持所需的多种DNA相关生物学过程的时空调控至关重要,如DNA复制、转录、重组和损伤修复等.三维染色质结构失调导致基因表达异常,被认为是肿瘤或神经发育障碍等多种疾病的主要诱因.本文...
关键词:三维染色质结构 染色质结构蛋白 组蛋白及其变体 甲基CpG结合蛋白2(MeCP2) 人类疾病 
乙型肝炎病毒稳定转染后宿主细胞高级染色质结构改变分析
《军事医学》2023年第9期662-667,共6页江修宇 郝晓娟 周喆 王学军 杨骞 
北京市科技新星培养项目(Z171100001117119)。
目的研究乙型肝炎病毒(HBV)对肝细胞三维基因组学空间组织结构的影响。方法使用桥接高通量染色质构象捕获(BL‐Hi‐C)技术,获取HBV稳定转染细胞HepG2.CW与对照细胞HepG2的基因组三维空间互作信息,并联合转录组测序分析差异表达基因。通...
关键词:乙型肝炎病毒 HEPG2细胞 肝细胞癌 三维基因组 染色质易位 拓扑相关结构域 
染色质结构稳定蛋白4的下调诱导肿瘤细胞进入滞育样状态:乳酸化及胞质分裂的协同调控
《科学通报》2023年第27期3568-3570,共3页孙雪丹 何立芳 吴缅 刘连新 
胚胎滞育是许多哺乳动物面对恶劣环境时采取的一种生存策略.这种策略通过暂时停止胚胎的发育来提高在恶劣条件下的生存能力.在这种情况下,胚胎的增殖被抑制,着床过程被延迟.Dhimole等人[1]最近的一项研究表明,肿瘤细胞在受到细胞毒性药...
关键词:协同调控 染色质结构 胚胎滞育 细胞死亡 胞质分裂 肿瘤细胞 生存策略 着床过程 
Hi-C技术在三维基因组学和疾病致病机理研究中的应用被引量:1
《遗传》2023年第4期279-294,共16页王舜泽 江丰 朱东丽 杨铁林 郭燕 
国家自然科学基金面上项目(编号:82170896),陕西省科技创新团队(编号:2022TD-44)资助。
三维基因组学在基因组序列、基因结构及其调控元件的基础上对细胞核内的染色质的三维空间结构进行研究。染色体的空间交互作用是基因表达调控的重要因素,随着高通量染色体构象捕获(high-throughput chromosome conformation capture,Hi...
关键词:Hi-C 三维基因组学 染色质结构 基因表达调控 
三链染色质结构R-loop的研究进展:从检测方法到生物学功能被引量:1
《中国科学:生命科学》2023年第3期289-303,共15页周劲聪 王文杰 孙前文 
国家自然科学基金(批准号:32170321,31822028,91940306)资助。
R-loop是由一条单链DNA和另一条RNA∶DNA杂合链组成的三链染色质结构,在众多生物体中发挥着重要的生物学功能.生物体内有众多调控因子通过调节R-loop的稳态来影响各水平的基因组调控事件,如转录、复制、DNA损伤及修复等.近年来,随着R-l...
关键词:RNA:DNA杂合链 R-LOOPS 基因组调控 
以口周肌阵挛为临床表现的SETD1B综合征1例被引量:1
《福建医药杂志》2023年第1期179-180,共2页庄嘉鑫 吴小慧 林学锋 
SETD1B (SET domain containing 1B)编码组蛋白H3赖氨酸4 (H3K4)甲基转移酶,该酶参与染色质结构和基因表达的表观遗传控制,从而参与复杂的神经发育调控[1-2]。SETD1B相关综合征是SETD1B基因突变导致的一种罕见的常染色体显性神经发育障...
关键词:肌阵挛 运动发育迟缓 常染色体显性 智力残疾 临床报道 染色质结构 发育障碍综合征 癫痫发作 
电离辐射诱导组蛋白乙酰化引起的染色质结构解聚研究被引量:1
《原子核物理评论》2022年第4期497-504,共8页沈程 吴汝群 刘文静 郭金龙 赵靖 毛光博 牟宏进 张磊 杜广华 
国家自然科学基金面上项目(11975283);国家自然科学基金联合基金项目(U1632271);国家重大研发计划项目(2021YFA1601400)。
真核生物的DNA分子经高度压缩以染色质形式存在于细胞核中,染色质动态结构在DNA复制、基因转录和DNA修复等过程中起着重要的调控作用。核内染色质结构的原位高分辨解析和其结构变化定量表征一直受困于显微成像观测分辨率的限制。通过点...
关键词:电离辐射 组蛋白乙酰化 超分辨率显微镜 最近邻距离分布 
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