国家高技术研究发展计划(2009AA02Z308)

作品数：6被引量：6H指数：2
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相关作者：南蓬李杰辉徐荣艳陈健张亮更多>>
相关机构：复旦大学上海生物信息技术研究中心中国科学院更多>>
相关期刊：《Science Bulletin》《Chemical Research in Chinese Universities》《科学通报》《计算机工程》更多>>
相关主题：并行计算IFSHADOOP化合物可扩展性更多>>
相关领域：生物学自动化与计算机技术农业科学医药卫生更多>>
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基于Hadoop的化合物生物活性分析系统被引量：3
《计算机工程》2012年第13期48-50,共3页李杰辉 张亮 陈健 南蓬 
国家"863"计划基金资助项目(2009AA02Z308)
通过药物虚拟筛选,发现在具有生物活性化合物过程中,存在小分子结构相似性比较计算繁杂等问题。为此,结合MapReduce模型,提出一种基于Hadoop的并行计算模型处理方法,并通过Hadoop工具予以实现。同时根据Hadoop分区算法不均匀、容错功能...
关键词：生物活性 生物信息学 并行计算 可扩展性 数据库 Hadoop框架 
新型多巴胺D_3受体抑制剂的发现
《高等学校化学学报》2011年第8期1779-1784,共6页邓欣贤 沈庆 徐丽丽 熊子君 赵伟利 镇学初 付伟 
国家自然科学基金(批准号:20702009);国家"八六三"计划项目(批准号:2009AA02Z308);国家"九七三"计划项目(批准号:2010CB912601)资助
根据最新解析的多巴胺D3受体的晶体结构进行活性位点分析,建立了基于受体的药效团模型,并对Asinex Gold Collection数据库进行筛选,选择7个化合物进行生物活性测试,得到了高活性新型多巴胺受体抑制剂(04932482),它对多巴胺D3受体抑制率...
关键词：多巴胺D3受体 药效团模型 数据库筛选 抑制剂 
Discovery of a Novel 5-HT_(2A) Inhibitor by Pharmacophore-based Virtual Screening
《Chemical Research in Chinese Universities》2011年第4期655-660,共6页XIONG Zi-jun DU Peng LI Bian XU Li-li ZHEN Xue-chu FU Wei 
Supported by the National High Technology Research and Development Program of China(No.2009AA02Z308);the Major State Basic Research Development Program of China(No.2010CB912601);the National Natural Science Foundation of China (No.20702009)
The serotonin 2A（5-HT2A） receptor has been implicated in several neurological conditions and potent 5-HT2A antagonists have therapeutic effects in the treatment of schizo phrenia and depression.In this study,a poten...
关键词：Pharmacophore model Serotonin 2A receptor Database search Virtual screening Molecular docking 
Prediction of multiple drug resistance phenotype in cancer cell lines using gene expression profiles and phylogenetic trees
《Chinese Science Bulletin》2010年第33期3778-3786,共9页LIU XmYi LI ZuoFeng WEN JingRan CAI QingQing XU Ye ZHANG XiaoYan 
supported by the National High Technology Research and Development Program of China(2007AA02Z332,2008AA02Z126 and 2009AA02Z308);Shanghai Great Project Program Foundation(07DZ19505)
When microarray gene expression data are used to predict multiple drug resistance(MDR)phenotypes for anticancer drugs,the normalization strategy and the quality of the selected signature genes are usually the main cau...
关键词：肿瘤细胞株 基因表达谱 多药耐药 模型预测 表型进化 抗癌药物 系统进化树 基因表达数据 
植物的异黄酮合酶(IFS)被引量：3
《植物生理学通讯》2010年第4期388-394,共7页郑晓宣 徐荣艳 陈家宽 南蓬 
国家“863”计划(2009AA02Z308和2007AA02Z332);国家基础科学人才培养基金(J0630643);教育部博士点新教师基金(20070246156)
植物异黄酮是在植物次生代谢过程中产生的一类多酚混合物。其对植物自身防御病虫害和诱导根瘤形成以及人类预防或治疗激素相关的多种疾病都有作用。异黄酮合成的关键酶是异黄酮合酶(isoflavone synthase,IFS)。本文就异黄酮的代谢途径、...
关键词：异黄酮 异黄酮合酶 代谢途径 
基于恶性疟原虫全基因组蛋白信息预测青蒿素的潜在抗疟靶点
《科学通报》2009年第18期2806-2812,共7页韩利平 黄强 南蓬 钟扬 
上海市重点学科(批准号:B111);上海市科学技术委员会(批准号:07XD14025);国家自然科技资源平台(批准号:2005DKA21403);国家高技术研究发展计划(批准号:2009AA02Z308);上海市经济与信息化委员会(批准号:06NY-25)资助项目
结合NCBI分类数据库和KEGG提供的恶性疟原虫3D7株相关蛋白质信号通路信息,筛选出8个处于信号通路关键位置的蛋白酶,分别与青蒿素进行分子对接研究.通过分析它们之间的结合模式,发现嘌呤核苷磷酸化酶(pfPNP)、肽脱甲酰基化酶(pfPDF)和核...
关键词：青蒿素 抗疟靶点 分子对接 信号通路 
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