中央高校基本科研业务费专项资金(JUSRP11126)

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计算机专业生物信息学课程教学的实践探讨被引量:5
《安徽农业科学》2012年第29期14596-14597,共2页丁彦蕊 蔡宇杰 
国家自然科学基金项目(21001053);中央高校基本科研业务费专项资金资助(JUSRP11126)
介绍了生物信息学课程教学的特点,分析了计算机专业生物学课程教学中存在的问题,提出了计算机专业生物信息学课程教学方法。
关键词:生物信息学 计算机专业 教学方法 多学科交叉 
BP和概率神经网络预测微生物热稳定性的比较被引量:1
《江南大学学报(自然科学版)》2012年第6期637-641,共5页丁彦蕊 徐星宇 须文波 
国家自然科学基金项目(21001053);中央高校基本科研业务专项基金项目(JUSRP11126)
微生物的热稳定性与代谢网络的拓扑特征之间存在着密切的关系。分析了460个微生物的22个代谢网络拓扑特征,分别利用BP神经网络和概率神经网络建立分类模型,以比较两种算法预测微生物热稳定性的效果。通过分析隐层数目和扩展常数对分类...
关键词:BP神经网络 概率神经网络 代谢网络拓扑特征 热稳定性预测 
基于复杂网络理论的产甲烷常温菌和嗜热菌的代谢网络的拓扑与模块化的研究被引量:1
《计算机与应用化学》2012年第6期642-646,共5页陈璟 丁彦蕊 须文波 
国家自然科学基金资助项目(21001053);中央高校基本科研业务费专项资金资助(JUSRP11126)
近几年,复杂网络的研究正成为广泛关注的热点,代谢网络是复杂网络的一个例子。本文以产甲烷的常温古细菌Methanosarcina acetivorans(M.acetivorans)和嗜热古细菌Methanopyrus kandleri(M.kandleri)的代谢网络为对象,从拓扑参数以及模...
关键词:代谢网络 网络拓扑 网络功能 模块性 
基于PCA-SVM混合算法的嗜热菌和常温菌网络特征的研究
《计算机与应用化学》2012年第6期651-655,共5页王文超 丁彦蕊 陈璟 
国家自然科学基金资助项目(21001053);中央高校基本科研业务费专项资金资助(JUSRP11126)
通过比较嗜热菌和常温菌代谢网络的特征参数,可以从系统角度确定微生物嗜热性的主要因素。本文首先利用主成分分析法对22个网络特征进行相关性分析,根据特征值、载荷值的大小最终选择了11个主要网络特征;用选出的这11个网络特征组成特...
关键词:主成分分析法 SVM算法 网格搜索 网络特征 
基于PCA-SVM混合算法的嗜热菌和常温菌网络特征的研究
《计算机与应用化学》2012年第2期142-146,共5页王文超 丁彦蕊 陈璟 
国家自然科学基金资助项目(21001053);中央高校基本科研业务费专项资金资助(JUSRP11126)
通过比较嗜热菌和常温菌代谢网络的特征参数,可以从系统角度确定微生物嗜热性的主要因素。本文首先利用主成分分析法对22个网络特征进行相关性分析,根据特征值、载荷值的大小最终选择了11个主要网络特征:用选出的这11个网络特征组成特...
关键词:主成分分析法 SVM算法 网格搜索 网络特征 
产甲烷常温菌和嗜热菌代谢网络特征的比较研究被引量:1
《计算机与应用化学》2011年第6期769-773,共5页陈璟 丁彦蕊 须文波 
国家自然科学基金资助项目(21001053);中央高校基本科研业务费专项资金资助(JUSRP11126)
以产甲烷的常温古细菌Methanosarcina acetivorans(MAC)和嗜热古细菌Methanopyrus kandleri(MKA)的代谢网络为研究对象,分析了网络的拓扑结构与功能之间的关联性。本文利用Networkx计算了代谢网络的度、度的中心性、紧密度中心性以及介...
关键词:代谢网络 古细菌 产甲烷菌 
基于支持向量机的太湖入湖河流水质影响因素的研究
《水资源与水工程学报》2011年第5期38-40,46,共4页丁彦蕊 孙小妹 王文超 孙培冬 陈蓓 
国家自然科学基金项目(21001053);中央高校基本科研业务费专项资金资助(JUSRP11126);江苏省环境检测科研基金项目(0902)
以影响太湖入湖河流水质的23个因素值为研究对象,通过分析这些因素值随时间的变化趋势,发现随时间变化较大的因素为TN,CODMn,TP,石油类,Cd和Pb;以这些因素值为特征向量,利用支持向量机对轻度污染水质和重度污染水质进行了分类。当支持...
关键词:支持向量机 影响因素 水体水质 
产甲烷常温古细菌和嗜热古细菌代谢网络拓扑结构与功能间的关联性研究
《生命科学研究》2011年第3期189-194,共6页陈璟 丁彦蕊 须文波 
国家自然科学基金资助项目(21001053);中央高校基本科研业务费专项资金资助项目(JUSRP11126)
根据从KEGG数据库获得的产甲烷的常温古细菌Methanosarcina acetivorans(MAC)和嗜热古细菌Methanopyrus kandleri(MKA)的代谢网络,通过不同的网络属性特征的比较,发现常温古细菌MAC的代谢网络比嗜热古细菌MKA有更长的平均路径长度,...
关键词:代谢网络 古细菌 产甲烷菌 社团结构 模块性 GN算法 
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