国家现代农业产业技术体系建设项目(CARS-45-KXJ7)

作品数：18被引量：87H指数：7
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相关期刊：《福建农林大学学报（自然科学版）》《江苏农业科学》《中国农业科学》《中国蜂业》更多>>
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基于RNA-seq技术分析意大利蜜蜂幼虫肠道响应球囊菌胁迫的高表达基因
《江苏农业科学》2018年第13期29-35,共7页熊翠玲 黄枳腱 梁勤 徐细建 张曌楠 骆群 刘敏 陈大福 郭睿 
国家现代农业产业技术体系(蜜蜂)建设专项(编号:CARS-45-KXJ7);福建省自然科学基金(编号:2013J01070)
对意蜂幼虫肠道组织基因进行深度RNA测序,并对高表达基因进行GO注释和KEGG分析,旨在揭示意蜂幼虫免疫抗病机制。分别取3、4、5、6日龄意蜂幼虫中肠组织抽提RNA,合成cDNA。得到的总读段数都在26 715 638条以上,有效数据达到97%以上,且测...
关键词：RNA seq 意大利蜜蜂 幼虫肠道 高表达基因 
球囊菌胁迫中华蜜蜂幼虫肠道过程中病原的转录组学研究被引量：18
《微生物学报》2017年第12期1865-1878,共14页郭睿 陈大福 黄枳腱 梁勤 熊翠玲 徐细建 郑燕珍 张曌楠 解彦玲 童新宇 侯志贤 江亮亮 刀晨 
现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-45-KXJ7);福建农林大学科技发展资金(KF2015123);国家自然科学基金(30800806);福建省大学生创新创业训练计划(201610389053)~~
【目的】本研究利用RNA-seq技术对球囊菌胁迫的中华蜜蜂(中蜂)幼虫肠道进行深度测序,经趋势分析得到差异表达基因(DEGs)的显著表达模式,进而对胁迫过程中的球囊菌进行转录组学分析。【方法】利用Illumina HiSeq 2500平台对球囊菌胁迫的...
关键词：球囊菌 中华蜜蜂 幼虫肠道 趋势分析 转录组 
中华蜜蜂幼虫肠道的高表达基因分析
《浙江农业学报》2017年第9期1575-1580,共6页解彦玲 王鸿权 张璐 侯志贤 刀晨 江亮亮 熊翠玲 郑燕珍 徐细建 黄枳腱 郭睿 陈大福 
现代农业产业技术体系建设专项基金(CARS-45-KXJ7);福建农林大学科技发展基金(KF2015123);福建省大学生创新创业项目(201610389053)
中华蜜蜂(中蜂)是中国特有的本土蜜蜂资源,也是养蜂生产中的常用蜂种之一,具有重要的生态和经济价值。本研究利用RNA-seq技术对中蜂5和6日龄幼虫肠道进行深度测序,得到的有效读段(clean reads)数分别为29290630与26636038,Q20分别为98....
关键词：RNA-SEQ 中华蜜蜂 幼虫肠道 高表达基因 
基于RNA-seq数据大规模挖掘蜜蜂球囊菌的SSR分子标记被引量：5
《福建农林大学学报（自然科学版）》2017年第4期434-438,共5页李汶东 熊翠玲 王鸿权 侯志贤 童新宇 张璐 付中民 郑燕珍 陈大福 郭睿 
现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-45-KXJ7);福建农林大学科技发展资金(KF2015123);国家自然科学基金(30800806)
基于已获得的球囊菌转录组数据预测微卫星标记(SSR),并进行SSR位点的信息分析和SSR引物的挖掘.利用软件MISA对球囊菌转录组中42610条unigenes进行搜索,共预测出7968个SSRs,分布于5233条unigenes中,其中最主要的重复类型为三核苷酸重复(5...
关键词：蜜蜂球囊菌 微卫星标记 转录组 RNA-SEQ 
意大利蜜蜂6日龄幼虫肠道内球囊菌的差异表达基因分析被引量：5
《浙江农业学报》2017年第7期1119-1128,共10页杜宇 熊翠玲 史秀丽 郑燕珍 付中民 徐细建 陈大福 郭睿 
现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-45-KXJ7);福建农林大学科技发展资金(KF2015123);国家级大学生创新创业项目(201610389016)
为检测蜜蜂球囊菌(Ascosphaera apis)在胁迫意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica,简称意蜂)幼虫后期的基因表达谱,利用RNA-seq技术对纯培养的球囊菌孢子及球囊菌胁迫的意蜂6日龄幼虫肠道进行深度测序。通过比较处理组和对照组得到21 36...
关键词：球囊菌 意大利蜜蜂 幼虫肠道 差异表达基因 RNA-SEQ 
中华蜜蜂幼虫肠道响应球囊菌早期胁迫的转录组学被引量：13
《中国农业科学》2017年第13期2614-2623,共10页陈大福 郭睿 熊翠玲 梁勤 郑燕珍 徐细建 张曌楠 黄枳腱 张璐 王鸿权 解彦玲 童新宇 
国家自然科学基金(30800806);国家现代农业产业技术体系(蜜蜂)建设专项(CARS-45-KXJ7);福建农林大学科技发展资金(KF2015123)
【目的】白垩病是困扰养蜂生产的顽疾。目前,尚无利用二代测序技术研究中华蜜蜂(Apis cerana cerana,简称中蜂)幼虫白垩病的报道。本研究利用RNA-seq技术对健康(Ac CK)及球囊菌(Ascosphaera apis)胁迫的中蜂4日龄幼虫肠道(Ac T)进行深...
关键词：中华蜜蜂 幼虫肠道 球囊菌 转录组 RNA-SEQ 
中华蜜蜂6日龄幼虫肠道响应球囊菌胁迫的差异表达基因分析被引量：5
《环境昆虫学报》2017年第3期539-547,共9页郭睿 张璐 徐细建 史秀丽 熊翠玲 郑燕珍 付中民 黄枳腱 王鸿权 侯志贤 陈大福 
现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-45-KXJ7);福建农林大学科技发展资金(KF2015123)
蜜蜂球囊菌特异性侵染蜜蜂幼虫而导致白垩病,严重危害养蜂生产。本研究利用RNA-seq技术对健康及球囊菌胁迫的中蜂幼虫肠道进行深度测序,进而对宿主的差异表达基因进行深入分析。本研究中,幼虫肠道样品的RNA-seq共得到191167730条原始读...
关键词：中华蜜蜂 幼虫肠道 球囊菌 差异表达基因 免疫防御 
胁迫意大利蜜蜂幼虫肠道的球囊菌的转录组分析被引量：26
《昆虫学报》2017年第4期401-411,共11页陈大福 郭睿 熊翠玲 梁勤 郑燕珍 徐细建 黄枳腱 张曌楠 张璐 李汶东 童新宇 席伟军 
国家自然科学基金项目(30800806);现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-45-KXJ7);福建农林大学科技发展资金(KF2015123)
【目的】本研究旨在通过趋势分析对胁迫意大利蜜蜂Apis mellifera ligustica(简称意蜂)幼虫肠道的球囊菌Ascosphaera apis的差异表达基因(DEGs)进行转录组分析。【方法】将纯化的球囊菌孢子配制为1×107孢子/m L的饲料饲喂意蜂3日龄幼虫...
关键词：意大利蜜蜂 球囊菌 幼虫肠道 RNA-SEQ 转录组 差异表达基因 
中华蜜蜂幼虫肠道参考转录组的de novo组装及SSR分子标记鉴定被引量：13
《中国农业科学》2017年第6期1157-1166,共10页徐细建 郭睿 骆群 熊翠玲 梁勤 张串联 郑燕珍 张曌楠 黄枳腱 张璐 李汶东 陈大福 
国家现代农业产业技术体系(蜜蜂)建设专项(CARS-45-KXJ7);福建省自然科学基金(2013J01070)
【目的】利用RNA seq技术对中华蜜蜂(Apis cerana cerana,简称中蜂)幼虫肠道参考转录组进行de novo组装,并进行功能及代谢通路注释,进而利用该转录组数据进行中蜂幼虫的SSR分子标记鉴定。【方法】实验室条件下饲养中蜂幼虫,将纯化的蜜...
关键词：RNA seq 参考转录组 中华蜜蜂 UNIGENE SSR 
基于RNA-seq数据大规模开发中华蜜蜂幼虫的SSR分子标记被引量：17
《环境昆虫学报》2017年第1期68-74,共7页熊翠玲 张璐 付中民 王鸿权 侯志贤 童新宇 李汶东 郑燕珍 陈大福 郭睿 
现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-45-KXJ7);福建农林大学科技发展资金(KF2015123);国家自然科学基金(30800806)
中华蜜蜂是东方蜜蜂的一个亚种,也是我国的特有蜂种。本研究基于已获得的中华蜜蜂幼虫肠道转录组数据预测SSR分子标记,并进行SSR位点的信息分析和SSR引物的发掘。利用MISA软件对幼虫肠道转录组中数据组装得到的43557条unigenes进行搜索...
关键词：RNA-SEQ 中华蜜蜂 幼虫肠道 SSR分子标记 
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