河南省高等学校青年骨干教师资助计划项目(2010GGJS-072)

作品数：9被引量：90H指数：6
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相关作者：郭大龙张国海刘崇怀侯小改李猛更多>>
相关机构：河南科技大学中国农业科学院郑州果树研究所中国洛阳国家牡丹基因库福建省农业科学院更多>>
相关期刊：《生命的化学》《华北农学报》《园艺学报》《植物遗传资源学报》更多>>
相关主题：葡萄SSR反转录转座子单核苷酸多态性表达序列标签更多>>
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葡萄SNP标记的CAPS和TSP分析被引量：8
《园艺学报》2013年第11期2307-2315,共9页郭大龙 李猛 张国海 郭明晓 
国家自然科学基金项目(30800742;31372026);河南省高校科技创新人才支持计划项目(2010HASTTT002;13HAST1T004);河南省高等学校青年骨干教师资助计划项目(2010GGJS-072);河南省重点科技攻关项目(132102110029)
为了建立起葡萄SNP标记分析的一般方法和探索EST-SNP标记在葡萄中的应用,对前期开发的葡萄EST-SNP位点进行了筛选,设计了28对CAPS(cleaved amplified polymorphic sequences,酶切扩增多态性序列)标记引物和22对TSP(Temperature-switch P...
关键词：葡萄 单核苷酸多态性 酶切扩增多态性序列 温度转变PCR 
DNP处理对巨峰葡萄浆果贮藏品质的影响被引量：3
《江苏农业学报》2013年第1期162-166,共5页柳菁 郭大龙 王苗苗 曹欣 程小培 
国家自然科学基金项目(30800742);河南科技大学大学生研究训练计划项目(2011207);河南省高等学校青年骨干教师资助计划项目(2010GGJS-072)
为了研究不同浓度解偶联剂2,4-二硝基苯酚(DNP)处理对巨峰葡萄浆果贮藏品质的影响,分别用0.05 mmol/L、0.10 mmol/L和0.20 mmol/L DNP浸泡葡萄果实30 min,以蒸馏水处理为对照,果实晾干后用0.015mm厚的聚乙烯薄膜袋密封包装,在4℃下贮藏...
关键词：葡萄 DNP 贮藏 
牡丹Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶序列的克隆及分析被引量：13
《园艺学报》2013年第1期98-106,共9页侯小改 郭大龙 黄燕梅 张曦 
国家自然科学基金项目(31070620);河南省高校科技创新人才支持计划项目(2010HASTTT002);河南省高等学校青年骨干教师资助计划项目(2010GGJS-072)
根据 Ty3-gypsy 反转录转座子反转录酶的保守序列设计简并引物,从中原牡丹(Paeonia suffruticosa Andrews)品种‘洛阳红’和野生种卵叶牡丹(Paeonia qiui Y. L. Pei et D. Y. Hong)中扩增出430 bp 左右的目标片段。目的条带经回收、克...
关键词：牡丹 Ty3-gypsy 类反转录转座子 反转录酶 异质性 
牡丹反转录转座子RT基因的分离与序列分析被引量：3
《华北农学报》2012年第6期30-33,共4页贾甜甜 郭大龙 侯小改 刘改秀 王丽娜 张修铭 李双双 
河南省高校科技创新人才支持计划项目(2010HASTTT002);国家自然科学基金(31070620);河南省高等学校青年骨干教师项目(2010GGJS-072);河南科技大学大学生研究训练计划(2011270)
以牡丹基因组为模板,利用简并引物进行PCR扩增,得到了编码Ty1-copia类反转录转座子反转录酶(RT基因)的序列,测序后所得序列长度为240 bp,包含2个开放读码框,共编码63个氨基酸。经NCBI中BLAST比对结果显示,洛阳红牡丹RT基因与枸杞、甜菜...
关键词：牡丹 反转录转座子 RT基因 克隆 
葡萄EST-SNP位点的信息与特征被引量：6
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》2012年第3期263-270,共8页李猛 郭大龙 刘崇怀 张国海 侯小改 
国家自然科学基金资助项目(30800742);河南省高等学校青年骨干教师资助计划资助项目(2010GGJS-072);现代农业产业技术体系建设专项资金资助项目(CARS-30-yz-1)
为了从不同基因型葡萄组织的表达序列标签(EST)中得到候选单核苷酸多态性(SNP)位点,从NCBI的dbEST数据库中下载来源于9个不同葡萄基因型的不同组织EST序列42 493条,利用CAP3软件拼接得到6 126个重叠群(contig),将拼接结果导入QualitySN...
关键词：葡萄 表达序列标签 单核苷酸多态性 筛选原则 
葡萄核心种质的构建被引量：30
《中国农业科学》2012年第6期1135-1143,共9页郭大龙 刘崇怀 张君玉 张国海 
国家自然科学基金资助项目(30800742);现代农业产业技术体系建设专项资金资助(CARS-30-yz-1);河南省高等学校青年骨干教师资助计划项目(2010GGJS-072);河南省教育厅自然科学研究计划项目(2009B210003)
【目的】在已建立的葡萄初级核心种质的基础上,利用SSR分子标记技术构建葡萄核心种质。【方法】利用M策略(Core Finder和Power Core)、遗传距离法(least distance stepwise sampling,LDSS和geneticdistance optimization,GDOPT)和Core H...
关键词：葡萄 核心种质 SSR SRAP M策略 遗传距离法 
葡萄种质资源初级核心群的构建被引量：19
《植物遗传资源学报》2012年第1期72-76,共5页刘鑫铭 刘崇怀 樊秀彩 郭大龙 张国海 孙海生 
国家葡萄产业技术体系(nycytx-30-zy-01);国家自然科学基金(NSFC:30800742);河南省高等学校青年骨干教师资助计划(2010GGJS-072)
以国家果树种质郑州葡萄圃保存的867份栽培种质为材料,对47项表型性状进行了主成分分析。采用欧氏遗传距离、离差平方和法进行种质初选。采用分组和逐步聚类法,分别以15%、20%、25%和30%的比例抽样,依次获得124、170、205和252份种质。...
关键词：葡萄种质 初级核心群 构建 
EST-SNP开发软件特性分析及比较被引量：2
《生命的化学》2011年第6期906-911,共6页李猛 郭大龙 刘崇怀 张国海 
国家自然科学基金项目(30800742);国家葡萄产业技术体系(nycytx-30-zy-01);河南省高等学校青年骨干教师资助计划(2010GGJS-072)资助
利用生物信息学软件,对表达序列标签(EST)序列进行单核苷酸多态性(SNP)开发目前已较为普遍,其方法简单实用,且软件数量较多,可分为需要测序峰图的SNP开发软件和不需要测序峰图的SNP开发软件。对有测序峰图的序列进行SNP开发,操作步骤较...
关键词：SNP 软件分析 测序峰图 EST序列 
牡丹EST资源的SSR信息分析被引量：7
《湖南农业大学学报（自然科学版）》2011年第2期172-176,共5页侯小改 王娟 郭大龙 刘改秀 马慧丽 王小燕 
国家自然科学基金项目(NSFC31070620);河南省高校科技创新人才支持计划项目(2010HASTTT002);河南省重点科技攻关项目(092102110024);河南省高等学校青年骨干教师资助计划(2010GGJS-072)
首先对NCBI数据库下载获得的2 204条牡丹EST序列进行比对,去冗余后得到1 658条牡丹EST序列,然后利用MISA软件对这些序列进行筛查,结果在其中901条EST序列中发掘出1 111个SSR,出现频率为67.00%,平均每1 004 bp出现1个SSR。在牡丹EST–SSR...
关键词：牡丹 表达序列标签 简单重复序列 频率 特征 
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