《基因组学与应用生物学》

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《基因组学与应用生物学》
主办单位：广西大学
最新期次：2025年2期更多>>
发文主题：基因组学与应用生物学基因组学生物信息学分析基因克隆基因更多>>
发文领域：农业科学生物学医药卫生文化科学更多>>
发文作者：陈保善杜晓东兰干球张伟伟赵德刚更多>>
发文机构：广西大学中国热带农业科学院海南大学上海海洋大学更多>>
发文基金：国家自然科学基金广西壮族自治区自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
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板角山羊与酉州乌羊肌肉、心脏、肝脏的比较转录组分析
《基因组学与应用生物学》2024年第11期1761-1778,共18页屈明好 吕士鹏 孙晓燕 李杰 陈灿灿 蒋婧 范玉雪 刘良佳 王高富 任航行 
重庆市技术创新与应用发展专项重点项目(cstc2021jscx-gksbX0008);重庆市财政资金重点项目(22544C);重庆市人民政府与中国农业科学院战略合作资助项目共同资助。
板角山羊(Banjiao goat)和酉州乌羊(Youzhou dark goat)是重庆地方特色品种山羊(Capra hircus)。为研究板角山羊和酉州乌羊基因的差异表达,本研究利用Illumina测序技术分别对板角山羊和酉州乌羊背最长肌、心脏和肝脏进行转录组测序,对...
关键词：板角山羊 酉州乌羊 转录组分析 基因表达 
基于线粒体Cytb及COⅠ基因的黄河上游大鼻吻鮈(Rhinogobio nasutus)遗传多样性与系统发育关系分析
《基因组学与应用生物学》2024年第11期1826-1835,共10页王彩雯 穆爱娟 王吉祥 王永杰 刘彦斌 刘凯 肖伟 刘哲 连总强 
宁夏重点研发计划项目(2023BCF01013);农业农村部财政专项(HHDC-2022-02)共同资助。
为研究黄河上游不同群体大鼻吻鮈遗传结构与系统发育关系,保护其野生种质资源,本研究基于线粒体Cytb和COⅠ基因对黄河宁夏段及内蒙古段4个地理群体的大鼻吻鮈进行了遗传多样性及系统发育关系分析。结果表明,Cytb和COⅠ基因序列长度分别...
关键词：大鼻吻鮈 CYTB COⅠ 遗传多样性 
植物生物钟的研究进展
《基因组学与应用生物学》2024年第9期1483-1498,共16页廖宁 邱阳 石双连 范优荣 杨江义 
国家自然科学基金项目(32360149,32060472);广西大学“大学生创新创业训练计划”(S202210593360)共同资助。
在漫长的进化过程中,植物逐渐建立起了一套能够提前预测环境变化的调控网络——生物钟。它不仅仅是植物内部的分子计时器,更是植物与环境间联系的一座桥梁。通过输入途径将环境中授时因子(光照、温度等)发生变化的信息传递给核心振荡器...
关键词：近日节律 生物钟 核心振荡器 生长发育 胁迫应答 水稻 
21个禾本科物种线粒体基因组特征与系统进化分析
《基因组学与应用生物学》2024年第9期1533-1547,共15页杨树琼 刘嘉斐 江梳澈 郭冰倩 郭佳 曹玲玲 张婉 
河南省自然科学基金青年项目(232300420213);河南省高等学校重点科研项目(24A210021);南阳市科技计划项目(23KJGG293和23KJGG264);南阳师范学院自然科学项目(2024QN009)共同资助。
不同物种线粒体基因组有其特异的组成结构和进化方式,本研究基于NCBI-Genome数据库已公布的21个禾本科(Poaceae)物种线粒体基因组,利用比较基因组学方法对其线粒体基因组序列特征及亲缘关系进行了比较分析。结果显示,21个禾本科物种的...
关键词：禾本科 线粒体 基因组特征 亲缘关系 
炭疽芽孢杆菌的基因组学与生物学基本特征分析
《基因组学与应用生物学》2024年第8期1439-1454,共16页王倩倩 许倩钰 李超群 乔丽娟 邢江娃 
国家人社部2021年度高层次留学人才回国资助项目;青海大学青年科研基金项目(2022-QYY-15)共同资助。
为深入研究炭疽芽孢杆菌(Bacillus anthracis)基因组信息,探索其次级代谢产物、耐药基因和毒力基因种类,从NCBI数据库中下载43株炭疽芽孢杆菌的基因组,分别利用基因组分析软件、次级代谢产物挖掘软件以及耐药基因和毒力基因数据库对其...
关键词：炭疽芽孢杆菌 泛基因组 次级代谢产物 耐药基因 毒力基因 
马铃薯StSN2信号肽缺失对其定位及蛋白互作的影响
《基因组学与应用生物学》2024年第5期755-766,共12页温和 蔡诚诚 李罗品 刘石锋 梁晓 王强 王西瑶 
国家现代农业技术体系四川薯类创新团队项目(SKL-ZY202203);西南作物基因资源与利用国家重点实验室“生物育种”揭榜挂帅项目(sccxtd-2023-09)共同资助。
StSN2属于马铃薯(Solanum tuberosum L.)Snakin/GASA(gibberellic acid-stimulated arabidopsis)蛋白家族,其N端具有信号肽,C端具有12个保守的半胱氨酸残基,主要在植物生长发育和逆境胁迫响应方面发挥重要调控作用。为了明确StSN2蛋白N...
关键词：马铃薯 StSN2 信号肽 亚细胞定位 酵母双杂交 
草莓(Fragaria×ananassa)MYC2-like基因的克隆和非生物胁迫下的表达分析被引量：2
《基因组学与应用生物学》2024年第3期416-427,共12页叶宇芸 李浩 易元珺 邱国秀 文勇 杨进 赵永康 韩庆新 秦燕 
国家现代农业产业技术体系四川特色经作创新团队草莓岗位(SCCXTD-2023-12);四川省科技计划项目(2021YFYZ0023-09)共同资助。
髓细胞组织增生蛋白2(myelocytomatosis protein 2,MYC2)作为MYC型bHLH转录因子家族成员,是茉莉酸响应途径的关键转录因子,在调控植物抵抗逆境胁迫中具有重要作用。本研究基于NCBI数据库中野草莓(Fragaria vesca)的基因序列,从草莓(Frag...
关键词：草莓 髓细胞组织增生蛋白2 表达分析 非生物胁迫 
九翅豆蔻叶绿体基因组特征及其密码子偏好性分析被引量：1
《基因组学与应用生物学》2024年第1期17-30,共14页傅武祥 郭雨桐 张雪梅 马占霞 
滇西应用技术大学教学质量工程项目(21JK16);云南省教育厅科学研究基金项目(2022J1045)共同资助。
为探究九翅豆蔻(Amomum maximum)叶绿体全基因组(chloroplast DNA,cpDNA)特征和密码子使用偏好性,本研究利用Illumina HiSeq测序平台对九翅豆蔻叶绿体全基因组进行测序,通过组装与注释得到叶绿体基因组全序列,使用MISA、IQTREE和CodonW...
关键词：九翅豆蔻 叶绿体基因组 微卫星位点 密码子偏好性 系统发育分析 
烟草NtPhyA基因的生物信息学分析和功能验证被引量：1
《基因组学与应用生物学》2023年第7期674-683,共10页罗家骏 陆安彬 龙本山 段丽丽 莫泽君 舒彦淇 皮凯 刘仁祥 
贵州省高层次创新型人才项目[黔科合平台(2016)5663];贵州省烟草公司重大专项项目[2022XM02,201904]共同资助。
低温是制约烟叶生产的重要气候因素,为研究PhyA基因在烟草(Nicotiana tabacum L.)应对低温胁迫的功能,本研究通过PCR技术克隆NtPhyA基因,利用生物信息学分析基因序列和蛋白特征;构建NtPhyA过表达载体,并对该基因进行了功能验证。结果表...
关键词：烟草 PHYA基因 基因克隆 低温胁迫 功能验证 
纳米孔测序技术在基因组学中的应用研究进展被引量：4
《基因组学与应用生物学》2023年第3期233-241,共9页雷文龙 雷思茹 陈帅 孔维龙 张兴坦 唐海宝 
国家自然科学基金项目(32222019)资助。
牛津纳米孔技术(Oxford nanopore technologies,ONT)是新兴的第三代单分子测序技术,以其超长读长、直接测序、实时测序等技术优势在生命科学领域发挥了重要作用,尤其在解决测序读长的技术瓶颈方面有着突破性的进展,并广泛应用于基因组...
关键词：牛津纳米孔技术(ONT) ONT应用 基因组学 
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