异构机群

作品数:30被引量:45H指数:4
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相关领域:自动化与计算机技术更多>>
相关作者:钟诚范大娟许莉莉李显宁崔鑫更多>>
相关机构:广西大学联想(北京)有限公司北京航空航天大学成都理工大学更多>>
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异构机群系统中序列比对并行算法进展
《福建电脑》2019年第4期67-69,共3页李显宁 
广西机电职业技术学院异构机群系统上序列比对并行处理研究项目(No.[2008]KY014)资助
简要介绍生物序列比对问题,生物序列比对分为双序列比对和多序列比对两大类,介绍了双序列比对并行算法和多序列比对并行算法的研究现状,并分析它们的主要设计思想及其性能。最后,对异构机群计算环境下序列比对近似并行算法的研究进行简...
关键词:生物序列比对 序列比对 双序列比对 多序列比对 并行 
多核机群主节点并发发送数据的可分负载调度
《计算机研究与发展》2014年第6期1281-1294,共14页钟诚 蔡德霞 杨锋 
国家自然科学基金项目(60963001)
对于节点计算、通信与存储能力不同、节点由多个多核处理器(多个片上多处理器)组成且共享L3cache的机群系统,采取计算与传输重叠模式,提出了主节点以多进程方式并发发送数据给从节点的可分负载调度模型.该调度模型自适应节点具有不同的...
关键词:可分负载 并行调度 多核异构机群 多级缓存划分 k-选择 
Hadoop加速比性能模型研究被引量:3
《河南师范大学学报(自然科学版)》2014年第2期152-157,共6页闫娟 穆晓霞 
河南省基础与前沿技术研究项目(132300410389)
MapReduce编程模型被看作是Hadoop的核心组件,一直以来都受到广泛的应用和研究,但针对Hadoop云平台的性能研究主要集中在配置调优和分布式算法等方面,缺乏对Hadoop加速比性能模型的理论研究.针对此问题提出了Hadoop云平台加速比性能模型...
关键词:加速比 HADOOP MAPREDUCE 同构机群 异构机群 
Hadoop加速比性能模型研究
《保密科学技术》2014年第3期55-60,共6页邵津生 管磊 
MapReduce编程模型被看做是Hadoop的核心组件,一直以来都受到广泛应用和研究,但针对Hadoop云平台的性能研究主要集中在配置调优和分布式算法等方面,缺乏对Hadoop加速比性能模型的理论研究。本文提出了Hadoop云平台加速比性能模型,并分...
关键词:加速比 HADOOP MAPREDUCE 同构机群 异构机群 
基于CPU-GPU异构机群的FDTD并行算法加速研究被引量:1
《系统仿真学报》2013年第2期235-240,共6页邵宗有 王昭顺 刘新春 
国家高技术研究发展计划(863)(2011AA040502);核高基重大专项(2012ZX01028001-003)
时域有限差分法(FDTD)求解电磁学中麦克斯韦方程组是科学与工程计算中一个非常重要的算法。通过对FDTD求解麦克斯韦旋度方程的直接时间域的分析,给出其基于多个GPU组成异构机群系统上的并行加速算法,用OpenCL、CUDA和MPI编程模型实现了...
关键词:电磁场仿真 时域有限差分法 GPU 机群 
异构机群上高效可扩展的Motif发现并行算法被引量:3
《计算机科学》2012年第3期279-282,共4页李锦 钟诚 
国家自然科学基金(60563003);广西大学拔尖创新团队建设计划(211-3-1-45)资助
在节点具有不同计算速度、不同通信能力的异构机群系统上,分别建立求解l≤16和l>16的Motif发现问题的最优序列分配模型,在此基础上设计实现融合投票和统一投影-邻居阈值思想的Motif发现并行算法。实验结果表明,给出的基于最优序列分配...
关键词:DNA序列 Motif发现 并行算法 异构机群 数据分配模型 
一种基于模糊推理的Hadoop异构机群自动配置工具被引量:5
《中国科学院研究生院学报》2011年第6期793-800,共8页代栋 周学海 杨峰 王超 
国家自然科学基金(60873221);思科大学研究计划资助
以运行Hadoop云计算软件平台的异构机群中服务器的硬件指标作为模糊输入,设计了一种自动配置本地服务器的工具.该工具改变了传统云计算平台下的配置方法,以服务器运行历史数据作为参考,引入异构配置方法,通过对异构机群特性的分析,实现...
关键词:HADOOP 自动配置 模糊逻辑 模糊推理 
异构机群系统上并行计算双序列的最长公共子序列
《计算机应用研究》2010年第5期1669-1671,1682,共4页许莉莉 魏鹰 罗海鹏 张林才 
国家自然科学基金资助项目(60563008)
针对处理机节点具有不同计算速度、不同通信能力的情况,考虑计算和通信启动开销,给定处理机分配顺序,基于可分负载理论,提出一种存储受限异构机群系统的序列串最优分配线性规划模型,给出相应的序列串最优分配方法。实验结果表明,基于最...
关键词:双序列的最长公共子序列 并行算法 异构机群系统 可分负载 分配策略 
异构机群下数据流自适应分配策略被引量:6
《计算机辅助设计与图形学学报》2009年第8期1175-1181,共7页郭文忠 陈国龙 夏添 
国家自然科学基金(60673161);教育部科学技术研究重点项目(206073);福建省自然科学基金重点项目(A0820002);福建省自然科学基金(A0610012)
数据流分配问题是典型的NP问题,为了有效地解决异构机群下数据流分配问题,提出一种基于改进粒子群优化算法的自适应分配策略.基于生物学的基因理论设计了转基因算子,以保护最优个体并提高策略的局部求解能力;引入变异算子,在很好地保持...
关键词:异构机群 数据流分配 粒子群优化 转基因算子 变异算子 
异构机群系统上双序列全局比对并行算法被引量:2
《计算机工程与应用》2009年第8期58-61,共4页崔鑫 钟诚 陆向艳 
国家自然科学基金No.60563003~~
对于处理机节点具有不同的计算速度、通信延迟和存储容量的异构机群系统,考虑通信启动开销,基于可分负载理论,提出一种双序列全局比对问题并行处理的最优分配策略,利用该策略确定出并行迭代次数和分配给各个从处理机的子序列长度。异构P...
关键词:双序列比对 并行算法 异构机群系统 可分负载 
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