植物叶绿体

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玄参科植物叶绿体基因组特征及系统发育分析
《生物技术通报》2025年第3期240-254,共15页李斌 苏香萍 刘畅 王玉兵 张勇洪 周超 徐青 
肿瘤微环境与免疫治疗湖北省重点实验室开放基金(2023KZL026);武当特色中药研究湖北省重点实验室开放课题(WDCM2023014)。
【目的】探究玄参科(Scrophulariaceae)叶绿体基因组(chloroplast DNA,cpDNA)的特征及其系统发育关系。【方法】对湖北玄参进行DNA测序,通过组装与注释获得了其叶绿体基因组序列,并从GenBank下载46条玄参科植物叶绿体基因组序列进行比...
关键词：玄参科 叶绿体基因组 序列特征 系统发育分析 
植物叶绿体基因组介绍及应用
《唐山师范学院学报》2024年第6期56-59,共4页马紫瑶 马丹丹 张浩 安宁 王英 
河北省重点研发计划项目(21326341D);唐山市科技计划项目(22150212A);唐山师范学院博士基金项目(2023B18);河北省大学生创新训练计划(S202410099013)。
叶绿体是植物进行光合作用的重要场所,其基因组中包含大量功能基因。叶绿体基因组具有多态性位点,可用于分子标记的开发,进而应用于种质资源的筛选、保护以及亲缘关系、遗传进化及系统发育分析等方面。同时,叶绿体遗传转化也广泛应用于...
关键词：叶绿体基因组 分子标记 遗传转化 
17种楠属植物叶绿体基因组密码子偏好性分析
《南方农业学报》2024年第12期3646-3655,共10页朱恒星 戴前莉 魏卓 卢敏 黄飞逸 陈本文 
国家重点研发计划项目(2023YFF1305202-5);重庆市科技兴林项目(重大专项)(ZD2022-2)。
【目的】解析樟科(Lauraceae)楠属(Phoebe)植物叶绿体基因组密码子偏好性,为楠属植物系统发育关系及遗传多样性研究提供理论依据。【方法】以17种楠属植物叶绿体基因组为研究对象,利用Genious 8.1.3、EMBOSS explorer的CUSP和CodonW模...
关键词：楠属 叶绿体基因组 密码子偏好性 最优密码子 
4种霸王属植物叶绿体基因组密码子偏好性分析
《西北植物学报》2024年第9期1445-1455,共11页周美 王金涛 庄重 赵伟 张玲 
国家自然科学基金项目(31660048)。
【目的】分析4种霸王属植物叶绿体基因组密码子的使用模式及其成因,为深入理解霸王属植物的密码子优化、偏好机制研究及遗传进化关系提供科学依据。【方法】用CodonW、EMBOSS等对叶绿体基因组筛选出的40条基因编码序列密码子进行ENC-plo...
关键词：霸王属 叶绿体基因组 密码子偏好性 最优密码子 
角蒿属药用植物叶绿体基因组比较及系统发育分析
《中草药》2024年第17期5972-5981,共10页马海霞 张亚颖 张玉婉 益西卓玛 梁焯森 李欣冉 郭云涛 封烁 
青海省“帅才科学家”负责制项目(2024-SF-102);青海大学农牧学院大学生科研训练项目(NKX202304)。
目的研究角蒿属Incarvillea Juss.药用植物叶绿体基因组特征、变异程度及系统发育关系,为角蒿属物种分子鉴定、系统发育及药用植物资源保护等研究提供参考。方法以5种角蒿属药用植物为研究对象,通过高通量测序获取密生波罗花叶绿体基因...
关键词：角蒿属 密生波罗花 两头毛 黄波罗花 藏波罗花 角蒿 叶绿体基因组 变异 进化 系统发育 
鸡骨柴及香薷属药用植物叶绿体基因组比较
《西南农业学报》2024年第7期1420-1434,共15页余潇 宋雨茹 赵振宁 
湖南财政经济学院博士科研启动资金项目(90174010191);云南省第二次国家重点保护野生植物资源调查项目(09930-216304);2021年度云南省大学生创新创业国家级项目(202110677046)。
[目的]全面解析鸡骨柴(Elsholtzia fruticosa)的叶绿体全基因组序列与结构特征,探讨香薷属药用植物叶绿体基因组的整体特征与变异模式,比较序列的种间变异情况,筛选种间高变异序列,为香薷属药用植物叶绿体基因组的深入研究和应用奠定基...
关键词：鸡骨柴 香薷属 叶绿体基因组特征 密码子偏好性 系统发育分析 
2种楠属植物叶绿体基因组特征及系统发育
《东北林业大学学报》2024年第6期58-63,84,共7页戴前莉 朱恒星 魏卓 卢敏 黄飞逸 陈本文 
重庆市科技兴林重点项目(ZD2022-2)。
应用Illumina Novaseq 6000高通量测序平台进行测序,组装了完整的崖楠(Phoebe yaiensis)和红毛山楠(Phoebe hungmoensis)叶绿体基因组,并对其基因组特征、基因构成、序列重复、边界收缩、密码子偏好性及系统发育进行分析。结果表明:崖...
关键词：崖楠 红毛山楠 叶绿体基因组 SSR 密码子使用偏性 系统发育 
忍冬属囊管组植物叶绿体基因组进化分析被引量：2
《中草药》2024年第9期3085-3097,共13页张晶晶 袁庆 魏瑶 刘欢 郑雪梅 王英芳 刘海瑞 
青海省自然科学基金资助项目(2024-ZJ-723);西宁植物多样性资源调查与种质资源圃建设(2023-Z-13);生态环境工程学院研究生三江源一流学科建设科技创新项目(2023-stxy-Y21)。
目的揭示忍冬属囊管组16种植物叶绿体基因组特征及系统发育关系。方法以16种囊管组植物为研究材料,利用CodonW、EMBOSS、Excel等软件分析其叶绿体基因组密码子使用偏好性;利用IRscope、mVISTA、DNAsp进行叶绿体基因组比较分析;利用Phylo...
关键词：忍冬属 囊管组 叶绿体基因组 密码子偏好性 系统进化 
玉蜀黍属植物叶绿体基因组进化及变异研究
《东北农业大学学报》2024年第5期13-27,共15页马闯 贾民隆 王杰 彭丹 邢国芳 武志强 
广东珠江人才计划项目(2021QN02N792)。
玉蜀黍属(Zea)又名玉米属,包含玉蜀黍(俗称玉米,Z. mays)及其野生种,是全球重要谷物之一,也是基础研究的模式植物。为深入解析该属物种系统发育关系和遗传变异规律,研究利用NCBI已发表的201个玉蜀黍属植物Illumina二代测序数据,通过组...
关键词：叶绿体基因组 玉蜀黍属 进化 系统发育 
9种狼尾草属植物叶绿体基因组特征分析被引量：1
《西部林业科学》2024年第1期88-98,共11页胥富强 王海洋 师春娟 辛培尧 段利武 王齐 
云南省教育厅科学研究基金项目“观赏狼尾草属植物种质优选及其系统发育研究(编号:2022J1382)”。
狼尾草属为禾本科1 a生或多年生草本植物,该属植物在饲用、保护生态、观赏等方面均有良好的应用价值。为探讨狼尾草属植物叶绿体基因组的遗传结构及进化特征,基于基因组浅层测序技术获得狼尾草属9种植物叶绿体基因组序列,对其组装与注...
关键词：狼尾草属 叶绿体基因组 序列分析 系统发育 
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