生物合成基因簇

作品数:182被引量:366H指数:9
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一种针对多重耐药病原体的天然抗生素
《中国临床药理学杂志》2022年第20期2463-2463,共1页
革兰氏阴性菌导致越来越多的由抗生素耐药性感染引起的死亡。细菌天然产物黏菌素被认为是对抗许多革兰氏阴性病原体的最后一道防线。质粒携带的多黏菌素抗性基因磷酸乙醇胺转移酶(mcr-1)最近在全球范围内的传播威胁到多黏菌素的实用性...
关键词:天然抗生素 抗生素耐药性 多黏菌素 磷酸乙醇胺 生物合成基因簇 革兰氏阴性菌 结构多样性 天然产物 
微生物天然产物生物及化学信息学最新进展
《中国抗生素杂志》2022年第7期625-630,共6页王梦源 常珊珊 解云英 
国家自然基金面上项目(No.81973219);国家自然基金青年项目(No.82104047);中国医学科学院医学与健康科技创新工程项目(No.2021-I2M-1-028)。
微生物天然产物一直是药物开发的重要源泉,而且目前仍是新结构天然产物的重要来源。但随着微生物天然产物基数的增加,重复发现已经成为制约其发展的主要因素,而基于生物信息学和化学信息学建立起来的基因组挖掘技术是解决这一问题的关...
关键词:微生物天然产物 生物信息学 化学信息学 生物合成基因簇 
锡林郭勒盟高原盐湖放线菌资源勘探及抗菌活性筛选被引量:2
《中国抗生素杂志》2022年第5期443-452,共10页赵思捷 王春苗 王聪聪 李甲 郑文 张璐 岳泽惠 李小俊 
国家自然科学基金(No.81703476);河北省自然科学基金(No.C2017405031);河北省教育厅省属高校基本科研业务费研究项目(No.JYT2020001,No.JYT2021010);河北省大学生创新创业训练计划项目(No.S202110092025)。
目的探究锡林郭勒盟高原盐湖放线菌的多样性、新颖性及抗菌活性,为新型抗菌活性产物的发掘储备菌种资源。方法采用20种分离培养基,以平板涂布法分离放线菌;依据16S rRNA基因的同源性对菌株进行分子鉴定;PCR检测代表菌株的Ⅰ型聚酮合酶(P...
关键词:盐湖 放线菌 多样性 抗菌活性 生物合成基因簇 
利普斯他汀高产菌株毒三素链霉菌AP617-N12CA的全基因组测序与分析被引量:1
《中国抗生素杂志》2022年第1期28-34,共7页李辉 方志锴 郭霞凌 
湖南省制造强省专项(湘财企指[2018]64号);福建省公益类科研院所专项(No.2020R10050011)。
目的解析利普斯他汀(lipstatin)高产菌株毒三素链霉菌AP617-N12CA(S.toxytricini AP617-N12CA)的基因组序列信息,为深入研究该菌株高产lipstatin的分子机理与调控机制奠定基础。方法联合应用三代单分子测序技术和二代高通量测序技术对AP...
关键词:毒三素链霉菌 利普斯他汀 全基因组测序 基因组完成图 线型质粒 生物合成基因簇 
链霉菌沉默生物合成基因簇激活策略的研究进展被引量:5
《中国药科大学学报》2019年第4期379-388,共10页戴岩 吴旭日 陈依军 
江苏省“六大人才高峰”项目资助(No.SWYY-097);江苏高校“青蓝工程”资助项目~~
微生物次级代谢产物因其显著的生物活性一直是新药发现与开发的重要来源之一,激增的基因组信息表明,链霉菌中存在着巨大的生物合成潜力。但目前从链霉菌中挖掘的具有新骨架或新结构单元的活性次级代谢产物数量远低于生物合成基因簇的数...
关键词:链霉菌 次级代谢产物 沉默生物合成基因簇 生物信息学工具 基因簇激活策略 
罗米地辛类抗癌药物的生物合成被引量:1
《药学研究》2017年第12期683-688,699,共7页童甜甜 云轩 程义强 邓子新 朱冬青 
国家自然科学基金项目(No.81373305、31401057)
罗米地辛(又称FK228)是紫色色杆菌中非核糖体肽合酶(NRPS)和I型聚酮合酶(PKS)催化合成的一种缩酚酸肽类天然产物,具有组蛋白脱乙酰基酶抑制剂活性,现被用于皮肤T细胞淋巴瘤和外周T细胞淋巴瘤的临床治疗。我们对已发现的罗米地辛类天然...
关键词:罗米地辛 组蛋白脱乙酰基酶抑制剂 生物合成基因簇 基因组挖掘 组合生物合成 
河南神仙洞放线菌资源勘探及抗菌活性筛选被引量:7
《中国抗生素杂志》2015年第9期641-648,共8页戴素娟 李静 刘少伟 李小俊 蒋忠科 姜蓉 孙承航 
2014年度中央级公益性科研院所基本科研业务专项(IMBF201407);国家自然科学基金(81172963和81321004);十二五"重大新药创制"科技重大专项(2012ZX09301-002-001-018)
目的勘探河南神仙洞放线菌多样性,以期发现药用微生物资源,为新抗生素发现奠定基础。方法采用10种分离培养基,以稀释涂布法分离放线菌;采用16S r RNA基因序列比对分析开展初步鉴别;经液体发酵,发酵液乙酸乙酯萃取,菌丝体丙酮浸提,获得...
关键词:洞穴 放线菌 多样性 生物合成基因簇 生物活性 
匹马菌素的生物合成研究进展被引量:3
《中国抗生素杂志》2012年第10期728-732,共5页王宗瑞 赵广荣 
教育部博士点基金(20090032110015)
匹马菌素是纳塔链霉菌产生的一种安全、高效的多烯大环类真菌抑制剂,广泛应用于医药领域与食品工业。作为26元环的糖基化多烯大环聚酮,其生物合成基因簇长度约110kb,包含19个基因,编码5个聚酮合酶、10个修饰和转运蛋白及4个调控因子。...
关键词:匹马菌素 纳塔链霉菌 生物合成基因簇 聚酮合成基因 修饰基因 转运基因 调控基因 
小链霉菌HCCB10043产脂肽类抗生素的鉴定及其生物合成基因簇研究被引量:7
《中国医药工业杂志》2012年第2期92-96,136,共6页饶敏 靳旭 阮丽军 罗敏玉 盛下放 
国家"重大新药创制"科技重大专项(2009ZX9302-004)
使用高效液相色谱法分离纯化了小链霉菌HCCB10043的重要代谢产物,获得3个精制品;经高分辨质谱、二级质谱与氨基酸分析鉴定其分别为A21978C1、C2和C3。菌株16S rDNA与已知的A21978C产生菌玫瑰孢链霉菌NRRL11379的同源性为99.2%,系统发育...
关键词:小链霉菌 A21978C 16SrDNA 生物合成基因簇 
雷帕霉素生物合成基因簇的研究进展
《世界临床药物》2009年第7期426-430,共5页郭铭 胡海峰 朱宝泉 
雷帕霉素有效的免疫抑制作用备受关注,尤其是雷帕霉素产生菌吸水链霉菌的雷帕霉素生物合成基因簇的测定,雷帕霉素的生物合成途径得到全面系统的研究。本文从雷帕霉素基因簇出发,重点综述雷帕霉素生物合成代谢的研究进展。
关键词:雷帕霉素 生物合成基因 基因簇 
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