基因簇

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早期描述物种的模式标定及基因组解析:以中国第一个被描述的真菌新种五棱散尾鬼笔为例
《菌物学报》2025年第4期14-28,共15页梁俊敏 王科 杜卓 赵明君 蔡磊 戴玉成 
中华人民共和国科学技术部基础资源调查专项(2021FY100900)。
五棱散尾鬼笔Lysurus mokusin(L.f.)Fr.,又名中华散尾鬼笔,于1774年由法国传教士西博特(Cibot PM)描述与发表,是首个被科学描述的中国真菌新物种,为稳定该名称的准确使用,本研究依照现用命名法规对该物种开展了模式标定和分类学研究,指...
关键词:附加模式 DNA条形码 HiFi测序 双速基因组 生物合成基因簇 
miR-191/425基因簇及其靶基因ADM2、DTNA、SMIM11B与食管癌预后风险的相关性分析
《新疆医科大学学报》2025年第4期432-437,446,共7页李子沐 封敏 吴怡娴 哈晓丹 朱辉 董娟娟 李秀梅 
新疆维吾尔自治区自然科学基金重点项目(2024D01D21)。
目的探讨miR-191/425基因簇及其靶基因肾上腺髓质素2(Recombinant adrenomedullin 2,ADM2)、异连蛋白α(Dystrobrevin alpha,DTNA)、小整合膜蛋白11B(Homo sapiens small integral membrane protein 11B,SMIM11B)在食管癌组织中的表达,...
关键词:miR-191 miR-425 食管癌 生存分析 
产细菌素乳酸菌Lpe59的选育及其细菌素基因簇的挖掘
《生物学杂志》2025年第2期33-39,共7页张宗源 岳丹丹 周留柱 王雪妍 陈登辉 潘梦诗 徐宏光 李冠杰 尹文兵 
河南省科技攻关项目(232102110100);河南省科学院杰出青年人才培养项目(210405010);河南省科学院基本科研业务费项目(240605014);河南省科学院省级特聘研究员项目(230505002)。
为了筛选一株产细菌素乳酸菌,并对其进行细菌素基因簇的挖掘,以大肠杆菌、金黄色葡萄球菌为指示菌,通过常规方法初筛和复筛后筛选出1株抑菌能力较强的产细菌素的戊糖乳杆菌Lpe59。全基因组测序结果显示,菌株Lpe59基因组大小为3274558 bp...
关键词:戊糖乳杆菌 细菌素 抑菌 全基因组 合成基因簇 
花生疮痂病菌次生代谢基因簇特异性转录因子挖掘及EaPSTF1生物信息学分析
《中国油料作物学报》2025年第2期356-362,共7页张凌萱 朴静子 刘丹 郝婧文 李自博 周如军 
辽宁省自然科学基金(2022-MS-264);辽宁省教育厅面上项目(JYTMS20231291)。
痂囊腔菌素(Elsinchrome,ESC)是花生疮痂病菌产生的一种具有光敏活性的苝醌类真菌毒素,为病菌的毒力因子。为了进一步揭示ESC生物合成的调控网络,在全基因组测序分析基础上,开展了病菌次生代谢基因簇特异性转录因子的挖掘、EaPSTF1基因...
关键词:花生疮痂病菌 特异性转录因子 基因克隆 生物信息学分析 次生代谢基因簇 
红树林来源链霉菌中2-羟基苯基噻唑啉衍生物及其生物合成基因簇分析
《热带海洋学报》2025年第2期64-72,共9页刘思妮 白猛 朱义广 罗小卫 高程海 刘永宏 徐新亚 蒋晓东 
广西科技基地和人才专项(桂科AD22035167);广西自然科学基金项目(2023GXNSFBA026139、2023GXNSFAA026313);广东省海洋药物重点实验室开放基金课题项目(LMM2022-4);广西中医药大学博士科研启动基金项目(2021BS022);广西中医药大学《桂派中医药传承创新团队》项目(2022A007);广西中医药大学第三批“岐黄工程”高层次人才团队培育项目(202407);广西八桂学者专项基金项目(05019055)。
文章探讨和分析了海南红树林沉积物来源链霉菌Streptomyces ardesiacus GXIMD 03502的次级代谢产物及相应生物合成基因簇。通过比对16S rDNA序列信息对菌株进行初步鉴定。综合运用多种色谱分离技术分离其次级代谢产物,结合波谱数据分析...
关键词:红树林放线菌 链霉菌 2-羟基苯基噻唑啉 生物合成基因簇 
基于CRISPR/Cas9技术的植物乳植杆菌YZH81胞外多糖合成基因簇功能鉴定
《食品科学》2025年第6期133-141,共9页黄淑婷 孙娅西 宦海琳 贾思思 赵芳 吕广萍 杨瑶 
江苏省自然科学基金面上项目(BK20231280);江苏省农业科技自主创新资金项目(CX(22)2019)。
胞外多糖(exopolysaccharides,EPS)合成基因簇是揭示乳酸菌EPS构效关系的基础。本研究前期发现一株高产EPS的植物乳植杆菌Lactiplantibacillus plantarum YZH81菌株含有可能的2个EPS合成基因簇cps1和cps2,构建的YZH81?cps1菌株EPS产量...
关键词:植物乳植杆菌 胞外多糖 cps基因簇 蛋白功能 
红曲莫纳克林K基因合成及其与发酵关系的研究进展
《中国酿造》2025年第3期21-28,共8页陈若楠 冯睿 周恒 胡青 季申 王少敏 
上海市科委研发平台专项(21DZ2290200)。
红曲是一种由红曲霉(Monascus)和大米通过发酵而成的具有降脂作用的发酵产品,其最具代表性的降脂成分为莫纳克林K,其生物合成依赖于9个基因(mokA至mokI)的协同作用,其中mokA基因和mokB基因是其合成途径的关键基因。发酵工艺对莫纳克林K...
关键词:红曲 红曲霉 莫纳克林K 基因簇 合成途径 发酵 
抗猪链球菌植物乳杆菌细菌素生物学特性及其编码基因簇分析
《饲料工业》2025年第6期101-108,共8页邹鸣晓 王云飞 苏惠 李涵诺 许诺 李国江 董文龙 
吉林省科技创新平台补助项目[YDZJ202302CXJD038]。
研究基于猪链球菌(Streptococcus suis,S.suis)耐药性加剧现状,分析植物乳杆菌细菌素抗菌生物学特性及其编码基因簇,旨在探究植物乳杆菌细菌素作为猪链球菌替抗产品的潜力。通过16S rRNA基因测序方法对分离获得的乳酸菌菌株进行鉴定,建...
关键词:细菌素 猪链球菌 全基因组测序 基因簇 植物乳杆菌 
海洋真菌A.sclerotiorum LZDX 33-4中吲哚二酮哌嗪类生物碱基因簇异源表达研究
《中国海洋药物》2025年第1期65-70,共6页窦敏 刘婕 范爱丽 钟声平 
目的运用分子生物学的方法,对提高深海来源真菌Aspergillus sclerotiorum LZDX 33-4中吲哚二酮哌嗪类生物碱的产率进行研究。方法利用生物信息学方法从A.sclerotiorum LZDX 33-4中钓取到负责吲哚二酮哌嗪类生物碱合成的基因簇stm;利用...
关键词:海洋真菌 Aspergillus sclerotiorum 二酮哌嗪类生物碱 异源表达 
泉州湾红树林根际土壤放线菌的分离鉴定及链霉菌W444次级代谢产物的鉴定
《微生物学报》2025年第2期597-613,共17页张文州 陈琳琳 林水森 林阳君 庄月娥 谢志新 江红 连云阳 骆祝华 彭飞 
泉州市科技计划(2023NS082);泉州医学高等专科学校校级课题重点科技项目(XJK2210A);泉州医学高等专科学校研究型教学项目(XJJK2308);自然资源部第三海洋研究所开放基金(HY202304)。
【目的】从泉州湾2种红树林的根际土壤中分离并鉴定放线菌,进行抗真菌活性初筛以获取目标菌株,并对链霉菌属(Streptomyces)W444的次级代谢产物进行分离与鉴定。【方法】从泉州湾洛阳江采集2种不同红树林植物的根际土壤样品,采用稀释涂...
关键词:泉州湾红树林 放线菌 吲哚类化合物 生物合成基因簇 
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