生物信息学

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白菜型油菜CCDs家族全基因组鉴定及表达分析
《生物技术通报》2025年第3期161-170,共10页王琛 刘国梅 陈畅 张晋龙 姚琳 孙璇 杜春芳 
山西省科技重大专项计划(202201140601025-5);山西省基础研究计划项目(202203021211276);山西农业大学生物育种工程项目(YZGC010)。
【目的】鉴定白菜型油菜(Brassia rapa L.)类胡萝卜素裂解双加氧酶(carotenoid cleavage dioxygenases, CCDs)基因家族成员,深入了解BrCCD家族基因功能及组织表达特性。【方法】利用生物信息学方法,对白菜型油菜CCDs基因家族进行鉴定,...
关键词：白菜型油菜 生物信息学分析 CCDs基因家族 表达分析 组织特异性 
甜瓜β-淀粉酶基因家族的鉴定及对非生物胁迫的响应
《生物技术通报》2025年第3期171-180,共10页韩江涛 张帅博 秦雅蕊 韩硕洋 张雅康 王吉庆 杜清洁 肖怀娟 李猛 
国家自然科学基金项目(32202578);中国博士后科学基金项目(2022M711063);河南省大宗蔬菜产业技术体系岗位专家项目(HARS-22-07-G4)。
【目的】β-淀粉酶(β-amylase,BAM)能水解淀粉,在植物生长和响应非生物胁迫中起重要作用。从全基因组水平对甜瓜BAM基因家族成员进行鉴定,为甜瓜BAM基因功能研究及抗性育种提供基因资源。【方法】分析BAM家族蛋白理化性质、系统进化、...
关键词：甜瓜 Β-淀粉酶 基因家族 生物信息学 非生物胁迫 
‘红阳’猕猴桃TCP基因家族鉴定及其在果实中的表达分析
《生物技术通报》2025年第3期190-201,共12页宋姝熠 蒋开秀 刘欢艳 黄亚成 刘林娅 
六盘水师范学院科研培育项目(LPSSY2023KJZDPY07);国家自然科学基金项目(32360740);贵州省教育厅自然科学研究项目(黔教技[2022]054号);六盘水市科技计划项目(52020-2022-PT-03,52020-2023-0-2-15);大学生创新训练计划项目(202310977011)。
【目的】基于全基因组鉴定‘红阳’猕猴桃TCP基因(AcTCPs)家族成员,分析各成员的分类进化关系,研究其组织、果实发育过程和激素处理的表达特性,为深入揭示猕猴桃果实中TCP基因的功能奠定基础。【方法】利用生物信息学方法分析‘红阳’...
关键词：‘红阳’猕猴桃 TCP转录因子 全基因组鉴定 生物信息学 组织差异 表达模式分析 激素处理 
葡萄HCT基因家族鉴定及其对低温胁迫的响应
《生物技术通报》2025年第2期175-186,共12页颜伟 陈慧婷 叶青 刘广超 刘新 侯丽霞 
山东省自然科学基金面上项目(ZR2023MC074);青岛市自然科学基金原创探索项目(23-2-1-178-zyyd-jch);山东省重点研发计划项目(2022LZGC0Y019)。
【目的】羟基肉桂酰转移酶(hydroxycinnamoyl-CoA:shikimate hydroxycinnamoyl transferase,HCT)是双子叶植物中催化绿原酸合成的关键酶,广泛参与植物非生物胁迫应答。在葡萄全基因组中鉴定VvHCT基因家族成员,分析相关基因低温胁迫下表...
关键词：葡萄 VvHCT基因家族 生物信息学 低温 
紫金龙异紫堇定生物合成相关6-OMT基因克隆与功能表征
《生物技术通报》2025年第2期309-320,共12页李明 刘祥宇 王益娜 和四梅 沙本才 
国家自然科学基金项目(82160727);云南特色植物提取实验室自主研究项目基金(2022YKZY001)。
【目的】(S)-去甲乌药碱O-甲基转移酶(6-OMT)是异紫堇定生物合成的关键限速酶,通过克隆与体外酶活验证紫金龙6-OMT基因功能,为解析紫金龙异紫堇定生物合成途径奠定基础。【方法】从紫金龙转录组数据中挖掘DsOMT基因,通过PCR扩增获得全长...
关键词：紫金龙 O-甲基转移酶 生物信息学分析 原核表达 功能表征 
激素和非生物胁迫下荷花GH3基因家族的表达分析
《生物技术通报》2025年第2期221-233,共13页匡健华 程志鹏 赵永晶 杨洁 陈润乔 陈龙清 胡慧贞 
国家自然科学基金地区科学基金项目(32360070);云南省重大科技专项计划(202202AE090028);云南省高层次人才引进计划高端外国专家专项(YNQR-GDWG-2020-001);云南省“兴滇英才计划”青年人才专项(YNQR-QNRC-2018-122);云南省农业基础联合面上项目(202101BD070001-124)。
【目的】探究荷花(Nelumbo nucifera)NnGH3家族成员的特征及其在非生物胁迫响应中的作用,为荷花抗逆新品种的选育提供新的关键候选基因资源。【方法】采用生物信息学方法从荷花全基因组中鉴定酰基酰胺合成酶(GH3)家族成员,对GH3基因编...
关键词：荷花 GH3基因家族 生物信息学 植物激素 非生物胁迫 表达模式 
山新杨谷胱甘肽转移酶基因的生物信息学与表达模式分析
《生物技术通报》2025年第2期248-256,共9页黄颖 遇文婧 刘雪峰 刁桂萍 
中央高校基本科研业务费专项资金(2572022DS07);黑龙江省省属科研院所科研业务费(LKSB2024-2)。
【目的】分析山新杨谷胱甘肽转移酶(GST)基因的表达模式,为深入研究木本植物GST基因的功能提供基础。【方法】克隆山新杨GST基因并进行生物信息学分析,通过荧光定量PCR技术分析GST基因在植物激素及非生物胁迫下的表达模式。【结果】克隆...
关键词：谷胱甘肽转移酶 生物信息学分析 基因表达模式 山新杨 
高粱CPP基因家族鉴定及表达分析
《生物技术通报》2025年第1期132-142,共11页杜品廷 吴国江 王振国 李岩 周伟 周亚星 
内蒙古自治区自然科学基金项目(2023LHMS03018);科尔沁沙地生态农业国家民委重点实验室开放基金项目(MDK2023091);内蒙古自治区直属高校基本科研业务费项目(GXKY22245);内蒙古自治区高等学校青年科技英才项目(NJYT22052);内蒙古自治区科技计划项目(2020GG0102)。
【目的】CPP基因家族在真核生物中广泛存在,对植物的生长发育起到重要的作用。从高粱基因组中鉴定CPP基因家族成员并分析其表达特征,为高粱CPP基因家族功能研究及遗传改良提供理论依据。【方法】通过生物信息学技术的方法对高粱CPP基因...
关键词：高粱 CPP基因 生物信息学 RT-QPCR 表达模式分析 
青稞HvnJAZ4的生物信息学和表达模式分析
《生物技术通报》2025年第1期173-185,共13页王子傲 田瑞 崔永梅 白羿雄 姚晓华 安立昆 吴昆仑 
国家自然科学基金地区科学基金项目(32060423,32060480);国家大麦(青稞)产业技术体系(CARS-05-01A-05);青海省自然科学基金计划-创新团队(2022-ZJ-902)。
【目的】茉莉酸(JA)信号途径抑制因子JAZs家族是植物JA信号调控途径中的重要组成部分,探索青稞JA信号抑制因子HvnJAZ4基因和蛋白结构、分子动力学以及表达模式特点,为青稞HvnJAZs基因家族调控机制研究提供参考。【方法】采用多种生物信...
关键词：青稞 HvnJAZ4蛋白 生物信息学分析 分子动力学模拟 
中国南瓜bHLH转录因子家族的鉴定与生物信息学分析
《生物技术通报》2025年第1期186-197,共12页李彩霞 李艺 穆宏秀 林俊轩 白龙强 孙美华 苗妍秀 
山西省重点研发计划项目(202102140601013);山西省基础研究计划青年科学研究项目(20210302124242)。
【目的】基于中国南瓜全基因组数据,鉴定中国南瓜bHLH转录因子家族成员并分析其理化性质和结构等,为中国南瓜bHLH转录因子家族的生物学功能研究提供理论支撑。【方法】利用NCBI和中国南瓜基因组数据库等对中国南瓜bHLH基因家族进行鉴定...
关键词：中国南瓜 BHLH 理化性质 系统进化树 组织表达模式 盐胁迫表达模式 
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