全基因组序列测定

作品数：93被引量：290H指数：7
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百合斑驳病毒靖宇分离物全基因组序列测定与进化分析被引量：1
《北方园艺》2023年第24期59-64,共6页张春雨 李小宇 王晨 黄瑞贤 黄淑敏 王永志 
吉林省农业科技创新工程资助项目(CXGC2021ZY022)。
以采自吉林省白山市靖宇县的野生百合感病叶片为试材,采用小RNA深度测序法检测到1株百合斑驳病毒(Lily mottle virus,LMoV),采用分段克隆方法,对LMoV靖宇分离物(LMoV-JY)的全基因组进行测定并分析,以期对吉林省百合病毒病的检测和防控...
关键词：百合斑驳病毒 基因组 
A型塞内卡病毒HBWH/1/2018株的分离鉴定及全基因组序列测定被引量：5
《中国动物传染病学报》2023年第1期146-152,共7页马雪青 祁光宇 李平花 付元芳 白兴文 包慧芳 孙普 卢曾军 刘在新 
甘肃省自然科学基金项目(20JR10RA019);甘肃省猪鸡产业体系猪病防治与健康养猪课题;2020年度所级统筹基本科研业务费项目(1610312020007);生猪健康养殖疫病防控及生物安全技术集成试验示范项目(20201007-2)
为了鉴定湖北省某猪场水疱性疾病的病原,本研究采用RT-PCR、细胞分离培养、间接免疫荧光检测、电镜观察、病毒基因序列测定及分子进化分析的方法对湖北省某猪场采集的具有水疱样病变的猪水疱皮样品进行了病毒的分离和鉴定及全基因组序...
关键词：塞内卡病毒 分离鉴定 进化分析 
狂犬病毒GSQY-Dog-China-2013株全基因组序列测定和遗传进化分析
《中国兽医杂志》2023年第1期8-13,共6页邢广旭 姜中毅 焦文强 王方雨 张改平 
河南省农业科学院优秀青年科技基金(2020YQ25);河南省科技攻关项目(212102110376)。
为了全面分析我国狂犬病病毒遗传进化情况,本试验使用反转录PCR(RT-PCR)方法将狂犬病病毒GSQY-Dog-China-2013分为10个片段进行扩增,回收目的片段并与pMD20-T simple载体连接,转化JM109感受态细胞,挑取阳性克隆进行测序;使用DNASTAR软...
关键词：狂犬病病毒 GSQY-Dog-China-2013 全基因组序列测定 遗传进化分析 
关中奶山羊源D型产气荚膜梭菌全基因组序列测定及其分子特征分析被引量：3
《畜牧兽医学报》2022年第11期3967-3974,共8页吴克 冯航 王娟 杨增岐 
财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系资助(CARS-39)。
本研究自陕西省富平县某规模化关中奶山羊养殖场腹泻奶山羊肛门拭子中分离到5株产气荚膜梭菌,命名为21-D-1~21-D-5。毒素基因检测表明,其均为携带etx的D型产气荚膜梭菌,且21-D-5携带食源性致病毒素基因cpe。全基因组序列测定显示,5株D...
关键词：关中奶山羊 D型产气荚膜梭菌 全基因组序列测定分析 
两株盖塔病毒全基因组序列测定与分子遗传进化被引量：1
《中国热带医学》2022年第10期916-922,共7页李彬 付士红 查冰 范娜 李元元 徐学平 应思超 聂凯 许松涛 李兴洲 王环宇 梁国栋 
传染病预防控制国家重点实验室重点项目(No.2015SKLID505)。
目的对2011年和2017年分别在我国甘肃省和海南省分离的两株盖塔病毒(GS11-155和HNDZ1712-1)进行全基因组核苷酸序列测定,分析其与我国1964年首次分离的盖塔病毒(M1)的分子差异及分子遗传进化特征。方法使用病毒基因扩增技术测定新分离...
关键词：盖塔病毒 分子遗传进化 人畜共患病 
浙江省1株犬源狂犬病病毒全基因组序列测定及细胞分离鉴定被引量：1
《中国人兽共患病学报》2022年第10期849-853,共5页张冉昕 马岩 赵中飞 任江萍 凌锋 卢学新 朱武洋 
国家重点研发计划(No.2019YFC1200701)。
目的了解浙江地区狂犬病分子流行病学现状,为浙江地区狂犬病防控提供相关数据。方法使用RT-PCR扩增浙江狂犬病病毒街毒株核苷酸并进行全基因组序列测定,与32株中国狂犬病病毒街毒株基因序列进行比对分析;使用Neuro-2a细胞进行病毒分离,...
关键词：狂犬病病毒 全基因组 序列分析 细胞培养 
广西猫杯状病毒全基因组序列测定及其遗传进化分析被引量：2
《中国动物传染病学报》2022年第2期67-73,共7页丁仰保 何剑桥 刘林林 余良政 崔柏杨 周华波 韦祖樟 欧阳康 黄伟坚 陈樱 
广西自然科学基金青年基金项目(2016GXNSFBA380219);广西自然科学基金联合资助培育项目(2018GXNSFAA294048)。
为了掌握广西猫杯状病毒(FCV)的流行情况及其变异规律。本研究于2018年3月至2019年9月采集疑似FCV鼻拭子59份,其中阳性检出率49.2%(29/59)。将阳性病料接种CRFK细胞,成功分离获得一株FCV毒株,命名为NN01-19。为深入了解其遗传进化规律...
关键词：猫杯状病毒 全基因组 ORF2基因 遗传进化分析 
一株乙型流感病毒株全基因组序列测定及其分子特征分析被引量：2
《中国卫生检验杂志》2022年第7期821-823,827,共4页徐德顺 卢忠豪 陈莉萍 
目的了解1株乙型流感病毒株的全基因组序组进化特征,以及与疫苗株匹配情况。方法对湖州市分离的1株乙型流感病毒株进行全基因组测序,通过BioEdit软件对核苷酸序列整理及氨基酸序列分析,Mega 7.0软件邻接法构建进化树,并对该分离株的系...
关键词：乙型流感病毒 全基因组 进化特征分析 
一株侵染掌叶半夏的大豆花叶病毒的全基因组序列测定和vsiRNA特征分析
《南方农业学报》2021年第12期3392-3399,共8页胡逸超 卢晓静 李璞 廖咏梅 何新华 邹承武 陈琦 
广西创新驱动发展专项(科技重大专项)(桂科AA17204054);广西中烟科技项目(科技20190029)。
【目的】探究侵染掌叶半夏(Pinellia pedatisecta)的大豆花叶病毒(Soybean mosaicvirus,SMV)衍生的干扰小RNA(virus-derivedsmallinterferingRNA,vsiRNA)序列特征,为掌叶半夏抵御病毒的作用机制研究提供参考。【方法】以一株来自广西的...
关键词：掌叶半夏 病毒基因组 大豆花叶病毒 小RNA深度测序 vsiRNA 
1株屎肠球菌的全基因组序列测定及比较基因组分析被引量：6
《中国现代应用药学》2021年第21期2639-2646,共8页高雯雯 王莹 梁倩 孙玲莉 肖海龙 李宏 刘程智 
国家重点研发计划项目(2019YFF0216700,2019YFF0216704);浙江省基础公益研究计划项目(LGF18C200004)。
目的对益生菌产品中分离出的1株屎肠球菌进行功能评价和安全风险评估。方法采用功能基因组和比较基因组方法,分析屎肠球菌菌株的益生性和安全性特征,评估对人体健康的潜在风险。结果分离菌株具有抗菌活性、维生素代谢等益生性相关功能基...
关键词：屎肠球菌 比较基因组分析 功能评价 安全性评估 
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