微卫星序列

作品数：98被引量：587H指数：14
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伊犁郁金香叶绿体基因组微卫星序列特征分析被引量：1
《种子》2023年第12期9-16,共8页秦斗文 么玉龙 冯伊玲 刘伟强 田吉婷 巨秀婷 
中国科学院“西部之光”项目(中科人字[2022]4号);青海省“昆仑英才”科技领军人才培养项目(青人才字[2022]1号)。
为明确伊犁郁金香叶绿体微卫星特征,为后续伊犁郁金香及郁金香属的系统发育、比较基因组学及遗传改良研究提供参考,同时也为郁金香属的物种分类提供新的依据,以伊犁郁金香叶绿体基因组为研究对象,运用MISA、REPuter、SPSS相关软件,对其...
关键词：伊犁郁金香 叶绿体基因组 微卫星 序列特征 
原麝基因区和基因间隔区微卫星分布规律及其功能分析被引量：1
《四川动物》2023年第3期311-318,共8页张琪 刘凤燕 赵琪 罗雷 赵贵军 戚文华 
国家自然科学基金项目(31702032);重庆市自然科学基金项目(cstc2019jcyj-msxmX0410;cstc2019jcyj-msxmX0024)。
原麝Moschus moschiferus为国家一级重点野生保护动物,本文利用R脚本和TBtools提取原麝基因组中不同区域,包括5’端非翻译区(5’UTR)、3’端非翻译区(3’UTR)、外显子区、内含子区和基因间隔区的序列,统计和分析了微卫星(SSR)的分布规...
关键词：原麝 微卫星序列 生物信息学 功能分析 
鹿血鉴定技术研究现状
《药物资讯》2023年第3期202-208,共7页刘爽 王一凡 杨心怡 刘德芳 黄春华 张书环 楼迪栋 
鹿血是十分珍贵的中药材,具有促进新陈代谢、增强体质和抗衰老等作用,在我国作为药用已有一千多年的历史,由于鹿血来源稀少且药用价值珍贵,在经济利益驱使下,市场上出现假冒(猪、牛、羊等)或伪劣的鹿血制品,由于传统中药鉴定方法在鹿血...
关键词：鹿血 伪品 微卫星序列 鉴别技术 
‘京红久’忍冬叶绿体基因组微卫星序列特征分析被引量：1
《分子植物育种》2023年第6期1955-1966,共12页张加强 史小华 刘慧春 许雯婷 周江华 朱开元 
浙江省农科院新成果示范推广项目(tg2021009);浙江省农科院重大课题主持类项目(2020R25R08E03);萧山区重大科技计划项目(2020219)共同资助。
‘京红久’忍冬(Lonicera×heckrottii’Gold Flame’)是一种极具观赏价值的优良藤本,被誉为“最帅的攀援植物”。本研究利用前期测定的‘京红久’忍冬叶绿体基因组序列结果,应用生物信息学软件对其微卫星的分布特征进行了全面分析。结...
关键词：‘京红久’忍冬 叶绿体基因组 微卫星 分布特征 
濒危植物黑黄檀基因组微卫星序列特征分析被引量：1
《分子植物育种》2022年第20期6831-6837,共7页刘世男 王兵益 
国家重点研发计划项目子课题(2016YFD0600605);云南省省级林业科技推广项目([2018]ts06号)共同资助。
黑黄檀(Dalbergia fusca)是云南省濒危珍贵乡土树种,为分析其基因组中微卫星序列的特征,本研究通过Illumina高通量测序技术对黑黄檀全基因组进行测序,利用MISA软件进行分析。获得了12962个微卫星序列,共7种类型,其中以单核苷酸重复类型...
关键词：黑黄檀 基因组 微卫星 
基于SSR标记技术对3种国产绵羊肉的品种鉴别分析
《食品科学》2022年第4期346-354,共9页宋亚倩 杨波 罗瑞明 马小梅 
宁夏回族自治区创新平台专项(2019DPC05011);宁夏肉品加工及质量安全控制工程技术研究中心科研项目(2019DPC05011)。
提取纯种宁夏滩羊、纯种新疆细毛羊和纯种藏绵羊的肝脏DNA,并进行文库构建、扩增、纯化和质控。检测序列中的简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)位点,设计合成并筛选50对引物进行聚合酶链式反应扩增并使用毛细管电泳检测SSR分型...
关键词：基因组DNA 微卫星序列 特异性检测 绵羊肉品种鉴别 
微型月季抗逆性基因表达与微卫星序列连锁分析
《安徽农业科学》2021年第21期124-127,132,共5页王建婷 刘广达 吴归 安天琪 李娜 
自治区级大学生创新创业训练计划项目(201910127017)。
使用转录组学的方法研究水杨酸和茉莉酸甲酯处理微型月季的基因表达,发现2种处理的植物-病原菌相互关系通路均有数量较多的差异表达基因,并对该通路中差异表达基因连锁的微卫星序列进行了统计。该研究有助于进一步理解水杨酸和茉莉酸甲...
关键词：微型月季 微卫星序列 水杨酸 茉莉酸甲酯 
铁皮石斛转录组微卫星序列统计分析被引量：7
《浙江农业科学》2020年第11期2241-2244,共4页石汝杰 张元媛 蒋雪梅 戚文华 
国家自然科学基金(31702032);重庆市教委自然基金(KJ1401021)。
为揭示铁皮石斛全基因组SSRs序列分布规律,采用微卫星序列搜索和统计软件MSDB v2.4对铁皮石斛全基因组中完整型微卫星序列及其特征进行生物信息学分析。结果表明:铁皮石斛微卫星序列总数量为215661个位点,微卫星序列长度为4.07 Mb,占全...
关键词：铁皮石斛 基因组 微卫星 生物信息学 
基于甘蔗AP85-441和R570基因组参考序列的微卫星位点鉴定和SSR标记开发被引量：2
《热带作物学报》2020年第4期722-729,共8页徐志军 赵胜 胡小文 孔冉 苏俊波 刘洋 
国家重点研发计划项目子课题(No.2018YFD1000503);中国热带农业科学院科技创新团队专项资金项目(No.17CXTD-07)。
分子标记缺乏是制约甘蔗分子标记技术发展的重要因素。本研究利用甘蔗AP85-441和R570基因组参考序列,使用MISA软件分别鉴定出512835和97839个微卫星位点,分别占割手密基因组(AP85-441)和甘蔗基因组(R570)高质量参考序列的0.32%和0.35%。...
关键词：甘蔗 微卫星序列 同源基因 SSR标记 特异扩增 
黑鲷、真鲷及其杂交子代基因编码区微卫星序列及密码子偏好性分析被引量：5
《海洋与湖沼》2019年第5期1108-1115,共8页曹广勇 张志勇 张志伟 陈淑吟 祝斐 贾超峰 陈自强 曾海峰 汤晓建 
江苏省重点研发计划(现代农业)项目,BE2016326号;江苏省农业科技自主创新资金项目,CX(17)2021号;江苏省农业重大新品种创制项目,PZCZ201744号;江苏省自然科学基金项目,BK20181202号
本研究采用生物信息学方法分析比较了黑鲷、真鲷及其两种杂交子代基因编码区(Codingsequence,CDS)中微卫星序列(简单重复序列,SSR)的分布规律及密码子偏好性。结果表明:(1)黑鲷、真鲷及其两种杂交子代微卫星序列均以三碱基重复类型为主...
关键词：黑鲷 真鲷 CDS序列 微卫星 密码子偏好性 
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