RRNA基因

作品数:990被引量:5951H指数:27
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基于高通量测序的稀释平板计数细菌群落变化研究被引量:5
《微生物学报》2022年第11期4447-4464,共18页李凯凯 曹伟伟 文昌丽 周晓丽 徐修远 邱旭 赵悦蓓 贾仲君 孟磊 
国家自然科学基金(32072688,318723623);江苏省农业科技自主创新资金[CX(19)1006]。
[目的]明确平板计数法中不同稀释梯度对土壤细菌数量和组成的影响规律,比较稀释平板计数法和高通量测序研究土地利用方式变化下土壤细菌群落的差异。[方法]针对不同土地利用方式下的4种土壤(次生林、健康蕉园、发病蕉园和水稻土),设置5...
关键词:高通量测序 稀释平板法 可培养细菌 16S RRNA基因 
基于16S rRNA基因序列分析法比较苏尼特双峰驼和阿拉善双峰驼自然发酵酸驼乳的微生物多样性被引量:14
《微生物学报》2019年第10期1948-1959,共12页卓娜 伊丽 浩斯娜 吉日木图 
双一流学科创新团队建设(NDSC2018-14);内蒙古自治区科技创新引导项目(KCMS2018048);内蒙古自治区科技重大项目;内蒙古自然科学基金(2018BS03017);高层次人才引进科研启动项目(NDY2017-28)~~
【目的】传统发酵乳制品是一类未经任何处理自然发酵而成的,其微生态环境未遭破坏,从而乳酸菌的生物学特性和基因多样性得到了很好的保留,具有开发和利用价值。自然发酵酸驼乳常用来治疗多种疾病且效果良好,与其中丰富的乳酸菌资源有着...
关键词:骆驼乳 微生物多样性 16S rRNA基因序列分析法 
牛源多杀性巴氏杆菌的分离与初步鉴定被引量:12
《微生物学报》2018年第12期2240-2248,共9页林立山 黄秦 才灵杰 马家乐 姚火春 潘子豪 
南京农业大学校级大学生科研训练计划(1717A26)~~
【目的】本研究旨在对引起犊牛呼吸道综合征的多杀性巴氏杆菌进行分离鉴定,分析其亲缘关系和毒力基因的分布情况。【方法】收集2017年8月至2018年4月疑似患有犊牛呼吸道综合征的病牛鼻拭子进行细菌分离培养,对菌落形态和染色疑似巴氏杆...
关键词:多杀性巴氏杆菌 血清型鉴定 毒力基因 16S RRNA基因 
原核生物全基因组中16S rRNA基因的识别
《微生物学报》2017年第10期1493-1503,共11页闫文凯 许明敏 张广乐 乔宁 徐炜娜 陈园园 张良云 
国家自然科学基金(11571173);江苏省自然科学基金(BK20141358)~~
【目的】识别原核生物全基因组中的16S rRNA基因。【方法】本文依据基因序列的GC碱基含量、碱基3-周期性和马尔可夫链3个方面的特性,构建了识别原核生物全基因组中16S rRNA基因的三层过滤模型。【结果】经检验,模型的特异性、敏感性和...
关键词:16S RRNA基因 GC碱基含量 碱基3-周期性 马尔可夫链 
青藏高原阿里、那曲和海西地区土壤可培养放线菌的多样性被引量:12
《微生物学报》2017年第9期1342-1351,共10页黄娇 闫兵法 黄英 
科技基础性工作专项(2015FY110100)~~
【目的】为了研究青藏高原北部地区土壤可培养放线菌的多样性,并比较不同选择性分离培养基对高原土壤放线菌的分离效果。【方法】使用9种分离培养基,并尝试添加藤黄微球菌发酵液,对采集自阿里、那曲和海西地区的14份土壤样品中的放线菌...
关键词:青藏高原 可培养放线菌 多样性 分离 16S RRNA基因 
基于16S rRNA和RubisCO基因对嗜酸硫杆菌的系统发育及多样性被引量:5
《微生物学报》2016年第4期664-679,共16页刘敏瑞 蔺朋武 齐兴娥 倪永清 
国家自然基金(31260001;C010101)~~
【目的】明确不同地理来源的Acidithiobacillus spp.种群是否表现出显著的地域性和异域物种形成;为了解微生物谱系地理、多样性维持机制和微生物分子地理学提供基础数据。【方法】采用16S r RNA基因、核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(Ru...
关键词:ACIDITHIOBACILLUS spp. 16S RRNA基因 RUBISCO基因 系统发育 遗传多样性 
湛江海水虾池免培养蛭弧菌类生物的多样性被引量:3
《微生物学报》2015年第10期1314-1326,共13页温崇庆 薛明 梁华芳 周世宁 
国家自然科学基金(31372536);广东海洋大学引进人才启动项目(E10046)~~
【目的】揭示湛江地区海水虾池蛭弧菌类生物(Bdellovibrio-and-like organisms,BALOs)多样性特点,为了解BALOs在虾池生态系统中的作用与合理应用其防治养殖对虾细菌病害提供基础。【方法】从8个热带海水虾池采集水样,提取总DNA,利用BALO...
关键词:海水虾池 蛭弧菌类生物 嗜盐噬菌弧菌 吞菌弧菌 16S RRNA基因 多样性 
巴丹吉林沙漠盐湖微生物多样性被引量:16
《微生物学报》2015年第4期412-424,共13页李璐 郝春博 王丽华 裴理鑫 
中央高校基本科研业务费专项资金(2652012028;2652013100)~~
【目的】研究内蒙古巴丹吉林沙漠碱性盐湖中的原核生物多样性及其与环境因子之间的关系。【方法】利用分子生物学方法构建16S rRNA基因克隆文库,对盐湖中的嗜盐碱微生物进行系统发育分析;利用R语言绘图,对不同盐湖的微生物群落结构进行...
关键词:碱性盐湖 16S RRNA基因 群落结构 嗜盐碱菌 
硇洲岛褐蓝子鱼肠道抗菌活性菌株的分离及多样性被引量:5
《微生物学报》2014年第5期582-588,共7页刘颖 时威 安俊莹 赵鸭美 叶日英 徐春厚 
广东省科学技术厅项目(2010B020313002;S2011010000328;粤科规划字[2009]198号)~~
【目的】了解广东湛江硇洲岛褐蓝子鱼(Siganus fuscescen)肠道抗菌物质产生菌的多样性。【方法】采用传统的分离方法与牛津杯扩散法对褐蓝子鱼肠道菌进行分离纯化与抗菌活性测定,运用16S rRNA基因序列的系统发育分析对抗菌活性菌株进行...
关键词:褐蓝子鱼 抗菌活性 16S RRNA基因 多样性 
食品污染克罗诺杆菌(阪崎肠杆菌)的分离及鉴定被引量:25
《微生物学报》2013年第5期429-436,共8页董晓晖 李程思 吴清平 张菊梅 莫树平 郭伟鹏 杨小鹃 徐晓可 
广东省科技计划项目(2010B020316003);广州市科技计划项目(2010U1-E00611)~~
【目的】对300份奶粉样品和50份非奶粉类食品中克罗诺杆菌的污染情况做定量检测,并对分离得到的克罗诺杆菌进行鉴定。【方法】通过分子方法和9管法对奶粉和其他食品中克罗诺杆菌的污染情况做定量检测;通过吲哚产生、丙二酸盐利用、卫矛...
关键词:克罗诺杆菌(阪崎肠杆菌) 生化谱 16S RRNA基因 系统发育树 
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