CPSSR

作品数：38被引量：190H指数：8
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基于叶绿体基因组SSR分子标记开发鉴定5种生态型天麻
《中草药》2025年第5期1747-1754,共8页胡艺镨 李胜男 徐娇 周涛 江维克 欧小宏 
国家重点研发计划(2023YFC3503803);中央本级重大增减支项目(2060302);贵科合学术新苗[2023]-45。
目的建立不同生态型天麻Gastrodia elata叶绿体SSR(chloroplast SSR,cp SSR)分子标记鉴定方法,为天麻分子标记辅助育种提供理论依据。方法利用天麻叶绿体基因组序列获取cpSSR位点,分析比较位点特征并筛选多态性cpSSR,通过聚类分析、主...
关键词：天麻 生态型 CPSSR 遗传多样性 鉴定 
利用叶绿体微卫星标记分析东亚柳杉群体的谱系地理结构
《分子植物育种》2024年第18期6081-6089,共9页李鑫玉 戴旻峻 王敏求 袁美灵 武星彤 蔡梦颖 文亚峰 
国家重点研发计划项目(2016YFE0127200)资助。
柳杉(Cryptomeria japonica)是东亚特有孑遗植物,分为中国柳杉(C.japonica var.sinensis)和日本柳杉(C.japonica var.japonica)两个地理变种,但其谱系空间格局与形成机制仍不清楚。本研究利用叶绿体微卫星(cpSSR)标记,研究东亚柳杉群体...
关键词：谱系地理结构 叶绿体微卫星标记(cpSSR) 单倍型 柳杉 
甜菜及其近缘类群叶绿体基因组重复序列比较分析
《种子》2023年第9期36-44,共9页包国媛 王雅琼 李文辛 
青海民族大学2023年大学生创新创业训练计划项目:“甜”酒佳酿——做青海省红甜菜酿造酒拓荒者;青海民族大学研究生创新项目(54M2022005);2023年中央科研创新平台建设项目——青海省林业草原生态系统功能维护及可持续开发利用科研创新团队(30160101141)。
甜菜、菠菜及藜麦具有较高的食用、药用和饲用价值。通过MISA和REPuter软件对其叶绿体全基因组的简单重复序列(cpSSR)和散在重复序列(cpIRS)进行分析,研究甜菜及其近缘类群的叶绿体基因组重复序列差异。结果表明,甜菜及其近缘类群的全...
关键词：甜菜 叶绿体基因组 重复序列 CPSSR 
田葛缕子叶绿体基因组微卫星特征分析被引量：1
《北方园艺》2023年第16期96-100,共5页李昂 金亮 朱惠琴 沈宁东 
国家自然科学基金地区科学基金资助项目(32160092);青海省科技厅基础资助项目(2018-ZJ-752)。
以田葛缕子幼嫩叶片为试材,采用CTAB法提取叶绿体DNA,测定并分析田葛缕子叶绿体全基因组序列(153697 bp),旨在研究田葛缕子叶绿体基因组微卫星(cpSSR)特征,为田葛缕子资源分子鉴定及遗传多样性研究提供参考依据。结果表明:MISA软件在田...
关键词：田葛缕子 叶绿体基因组 微卫星 CPSSR 
蕨麻cpSSR序列特征分析被引量：2
《安徽农业科学》2023年第12期94-97,共4页田甜 李军乔 王鑫慈 曲俊儒 
青海省重点研发与转化计划项目(2022-NK-120);青海民族大学2021年研究生创新项目(954M2021005)。
基于NCBI数据库中收录的蕨麻叶绿体基因组序列,利用REPuter软件和MISA软件分析其微卫星分布规律。结果显示,在叶绿体基因组中共检测到34个散在重复序列,22个分布在LSC区,10个分布在IR区,2个分布在SSC区。使用MISA共注释到92个SSR位点,...
关键词：蕨麻 叶绿体基因组 微卫星 
紫花凤梨叶绿体基因组微卫星特征分析被引量：3
《分子植物育种》2022年第20期6811-6817,共7页金亮 葛亚英 李小白 詹书侠 史杰玮 曹群阳 
浙江省自然科学基金项目(LY17C150005);浙江省农业新品种重大专项花卉育种专项(2021C02071-5)共同资助。
紫花凤梨(Tillandsia cyanea)是一种空气凤梨,具有很高的观赏价值。由于其基因组信息缺乏,其分子生物学相关研究鲜有报道。为研究紫花凤梨叶绿体微卫星(cpSSR)特征,本研究分析了紫花凤梨叶绿体全基因组序列(157602 bp),使用MISA软件共...
关键词：紫花凤梨 叶绿体基因组 微卫星 CPSSR 
黄花瑞香狼毒cpSSR序列特征分析被引量：2
《分子植物育种》2022年第13期4434-4440,共7页梁程博 刘道鑫 陈前 谢久祥 闫京艳 
国家自然科学基金项目(31760622)资助。
黄花瑞香狼毒具备作为观赏植物和药用植物的开发价值。为获得黄花瑞香狼毒叶绿体微卫星序列特征,本研究对获得的黄花瑞香狼毒叶绿体基因组进行测序,通过软件MISA v1.0检测到315个SSR位点,平均每550 bp出现一个SSR位点。cpSSR主要分布于...
关键词：黄花瑞香狼毒 叶绿体基因组 CPSSR 
京山地区对节白蜡与“京翠”亲缘关系的cpSSR分析
《湖北农业科学》2022年第4期160-163,共4页金宇晨 柴隆龙 马倩 熊燕飞 张建坤 陈碧峰 
中央高校基本科研业务费专项基金(2020IB029)。
为研究对节白蜡(Fraxinus hupehensis)与“京翠”在分子水平的遗传距离和遗传一致性。利用叶绿体微卫星(Chloroplast microsatellite,cpSSR)分子标记技术,对京山地区采集到的对节白蜡和“京翠”进行亲缘关系研究,并与其他物种共同构建UP...
关键词：对节白蜡(Fraxinus hupehensis) “京翠” CPSSR 亲缘关系 UPGMA 
利用分子标记对14份枸橼种质进行多样性分析被引量：6
《分子植物育种》2021年第14期4726-4737,共12页徐静 谭李梅 符红艳 朱志媚 龙栎冰 胡哲 马先锋 邓子牛 
国家自然科学基金委国际(地区)合作重点项目(31720103915)资助。
目前枸橼C-05(Citrus medica L.)是已鉴定的抗溃疡病唯一柑橘属种质,但由于枸橼种质存在多样性,枸橼种质间对柑橘溃疡病的抗病性可能存在差异,且其抗病性与枸橼种质间的亲缘关系是否相关尚不清楚。通过分析枸橼C-05与其他枸橼种质的亲...
关键词：枸橼种质 SRAP SSR CPSSR 遗传多样性 
104个甘薯品种的cpSSR指纹图谱构建及遗传多样性分析被引量：5
《热带作物学报》2021年第6期1549-1556,共8页王崇 王连军 杨新笋 雷剑 柴沙沙 张文英 焦春海 田小海 
国家重点研发计划项目(No.2019YFD1001300,No.2019YFD1001304);国家现代甘薯产业技术体系建设项目(No.CARS-11-C-15)。
基于甘薯叶绿体基因组,利用cpSSR分子标记,对104份甘薯栽培品种和地方品种进行遗传多样性分析并构建指纹图谱,为甘薯资源的保护鉴定和遗传改良提供参考。使用了11对cpSSR引物,在104个甘薯材料中总共扩增得到58条条带,多态性条带为47条,...
关键词：甘薯 cpSSR分子标记 遗传多样性 指纹图谱 
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