EST-SSR标记

作品数:238被引量:1583H指数:22
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菜豆EST-SSR分子标记开发及部分种质分子身份证构建被引量:1
《西南大学学报(自然科学版)》2024年第6期63-73,共11页付阳云 文晓鹏 
贵州2023年省级财政种业发展项目(黔科合中引地〔2023〕009).
为开发菜豆高效新型分子标记,从分子水平解析菜豆重要种质的遗传多样性及亲缘关系,基于菜豆转录组数据,设计EST-SSR引物,建立EST-SSR标记系统.利用PCR筛选出多态性引物,结合毛细管电泳,分析81份菜豆种质的亲缘关系,并构建分子身份证.通...
关键词:菜豆 转录组 分子标记开发 EST-SSR标记 分子身份证 
EST-SSR标记在竹亚科植物纤维资源评价中的应用
《造纸科学与技术》2024年第5期1-6,共6页王炳智 田英姿 
开发一批用于竹亚科(Bambusoideae)植物的EST-SSR分子标记,利用其判定样本亲缘关系,结合已有的纤维原料竹种的开发研究数据,给出竹亚科植物纤维资源评价方法与筛选建议。从纤维原料竹种毛竹(Phyllostachys edulis)和早竹(Phyllostachys ...
关键词:竹亚科植物 纤维原料 竹纤维 EST-SSR 亲缘关系 
基于EST-SSR标记的沙棘品种鉴定及指纹图谱构建被引量:3
《生态与农村环境学报》2024年第3期374-385,共12页赵雨欣 张哲文 考惠霞 孙永江 辛智鸣 赵喆 董树斌 程瑾 
国家重点研发计划政府间国际科技创新合作专项(2019YFE0116500);国家林业和草原局林业行业标准制修订项目(2020-LY-062);高等学校学科创新引智计划111项目(B13007)。
以沙棘(Hippophae rhamnoides)优良品种“实优1号”为材料,对其叶片进行转录组测序,利用微卫星识别软件(microsatellite identification tool,MISA)和Primer 3(version 2.3.4)对获得的序列进行简单重复序列(simple sequence repeat,SSR...
关键词:沙棘 表达序列标签微卫星 指纹图谱 遗传多样性 
利用EST-SSR标记分析绿豆农家种及育成品种的遗传多样性
《作物杂志》2024年第1期73-79,共7页王月影 范保杰 曹志敏 王彦 苏秋竹 张志肖 王珅 时会影 沈颖超 程须珍 刘长友 田静 
国家重点研发计划(2019YFD1000700,2019YFD1000702);国家现代农业产业技术体系(CARS-08-G03);河北省青年拔尖人才(2018);河北省重点研发计划(19226353D);河北省现代农业产业技术体系(HBCT2018070203);河北省农林科学院创新工程项目(2022KJCXZX-LYS-17)。
利用覆盖绿豆11条染色体的16个EST-SSR标记,对来自我国15个不同省市的156份绿豆农家种和53份育成品种进行遗传多样性分析。结果表明,16个标记总共检测出57个等位变异位点,平均等位变异数3.56,有效等位变异数(Ne)1.89,Shannon信息指数(PI...
关键词:绿豆 EST-SSR标记 种质资源 遗传多样性 
基于EST-SSR标记的朱顶红种质资源鉴定被引量:1
《分子植物育种》2024年第4期1123-1132,共10页吕文涛 娄文睿 娄晓鸣 宣继萍 
江苏省特色花卉工程中心项目(苏发改高技发[2020]1460号);江苏省省级作物种质资源库(球宿根花卉)项目(2022-SJ-010);苏州农业职业技术学院标志性成果培育项目(CGPY2001,CG2103)共同资助。
以历年引进的朱顶红种质资源为试验材料,将其按照近似花品种和同名品种进行分组,其中近似花品种包括12个组合45个品种,同名品种包括12个组合31个品种,从已开发的EST-SSR标记中筛选多态性引物,对这些引进的朱顶红种质资源进行鉴定。结果...
关键词:朱顶红 EST-SSR标记 聚类分析 资源鉴定 
基于转录组数据的芦笋EST-SSR标记的开发及通用性分析
《中国农业科学》2023年第22期4490-4505,共16页仪泽会 赵婧 毛丽萍 
山西省高等学校科技创新项目(2022L104);山西农业大学农业科技创新研究课题(YCX2020YQ07);山西农业大学园艺学院“双一流”学科建设科研补助项目。
【目的】明确芦笋转录组中SSR位点的分布规律,开发高信息量的EST-SSR标记并分析通用性,为天门冬属植物系统进化分析、功能基因挖掘及分子标记辅助育种提供工具。【方法】以笔者课题组前期获得的15个芦笋根系RNA-seq数据为基础,采用MISA...
关键词:转录组 芦笋 EST-SSR 染色体密度分布图 功能注释 
紫丁香EST-SSR标记在木犀科植物中通用性及亲缘关系分析被引量:1
《分子植物育种》2023年第18期6053-6064,共12页赵梦南 何芮庆 周宁 蔡长福 胡增辉 吴静 冷平生 
国家自然科学基金项目(31800602);北京市教育委员会科技计划一般项目(KM201810020011);北京市优秀人才培养资助青年骨干个人项目(2017000020124G120);北京市教委生态修复工程学高精尖学科建设项目共同资助。
木犀科植物作为广泛应用的树种,利用分子标记技术探讨其植物之间的亲缘关系,可以为木犀科植物资源的有效利用提供理论基础。本研究基于70对紫丁香EST-SSR多态性引物在29种木犀科植物中进行通用性分析并探究其亲缘关系。结果表明,70对引...
关键词:木犀科 EST-SSR 通用性 亲缘关系 
基于EST-SSR标记的金线莲叶色突变体分子身份分析被引量:1
《东南园艺》2023年第4期281-285,共5页樊荣辉 陈艺荃 钟淮钦 叶秀仙 
福建省自然科学基金项目(2020J011370);福建省农业科学院科技创新团队建设项目(CXTD2021010-2);福建省人民政府与中国农业科学院高质量发展超越“5511”协同创新工程项目(XTCXGC2021003)。
【目的】为金线莲(Anoectochilus roxburghii)从DNA分子水平上探索叶色突变体的遗传差异。【方法】采用EST-SSR分子标记技术对金线莲及其2个叶色突变体进行分子鉴定。【结果】20对SSR引物共扩增出78条谱带,其中3对引物(JXL-6、JXL-14和J...
关键词:金线莲 自然突变 分子标记鉴定 SSR 
基于EST-SSR标记的60份苇状羊茅遗传多样性分析被引量:5
《草地学报》2023年第7期2041-2048,共8页伊然 王子玥 刘凌云 常智慧 
十四五雄安科技专项:雄安新区科技创新专项——北方特色抗逆高生态效益花卉(草)新品种选育及示范(2022XAGG0100)资助。
苇状羊茅(Festuca arundinacea Schred)是多年生冷季型禾草,作为草坪草、牧草、生态修复草种在温带有着广泛的应用。本研究以60份不同来源的苇状羊茅种质为材料,利用表达序列标签-简单序列重复(EST-SSR)引物对其进行遗传多样性分析,对...
关键词:苇状羊茅 EST-SSR 遗传多样性 聚类分析 
基于EST-SSR标记的花楸树和少叶花楸杂交F_(1)代群体的杂种鉴定及遗传关系分析被引量:7
《植物资源与环境学报》2022年第4期65-73,共9页谷艳鹏 张泽人 孙涛 韩庆军 栗宁宁 鲁仪增 窦德泉 郑健 
国家自然科学基金资助项目(31770369);北京农学院学位与研究生教育改革与发展项目(2021YJS040);山东省重点研发计划(重大科技创新工程)项目(2021LZGC023)。
以花楸树〔Sorbus pohuashanensis(Hance)Hedl.〕为母本、少叶花楸〔S.hupehensis var.paucijuga(D.K.Zang et P.C.Huang)L.T.Lu〕为父本进行种间杂交,利用筛选出的9对扩增结果稳定且具多态性的EST-SSR引物,对杂交F_(1)代群体进行杂种鉴...
关键词:花楸树 少叶花楸 EST-SSR标记 杂种鉴定 遗传多样性 遗传关系 
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