叶绿体基因组

作品数：739被引量：1433H指数：32
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独脚金叶绿体基因组密码子偏好性分析被引量：3
《分子植物育种》2023年第12期3889-3897,共9页杨秀玲 许春梅 耿晓珊 甘静梅 刘秦 胡小虎 
广西科技基地和人才专项(桂科AD20159013);广西自然科学基金青年科学基金项目(2019GXNSFBA245038);玉林师范学院博士科研启动项目(G2019ZK32)共同资助。
为明确独脚金叶绿体基因组密码子的使用模式及成因,本研究以筛选到的46条基因的CDS区为研究对象,利用CodonW 1.4.2、CUSP、SPSS 26.0等软件对独脚金叶绿体基因组密码子偏好性进行分析。结果表明:独脚金叶绿体基因组密码子3个位置的GC含...
关键词：独脚金 叶绿体基因组 密码子偏好性 最优密码子 
艾纳香叶绿体基因组密码子使用偏性分析被引量：2
《西部林业科学》2023年第3期55-62,77,共9页赵月梅 徐其碧 杨贵清 尹鑫 徐林 
国家自然科学基金项目(31900273);贵州师范学院博士科研启动项目(2022BS015);大学生创新创业训练计划项目(S202114223051)。
为了明确艾纳香叶绿体基因组密码子的使用偏性,以53条蛋白质编码序列为研究对象,利用Codon W 1.4.2和在线软件CUSP等对其密码子进行中性绘图、ENC-plot和PR2-plot分析。结果显示:(1)艾纳香叶绿体基因组密码子不同位置GC碱基含量为GC 1(4...
关键词：艾纳香 叶绿体基因组 最优密码子 密码子偏性 
朱砂根叶绿体全基因组解析及系统发育分析被引量：4
《生物技术通报》2023年第1期232-242,共11页刘雄伟 刘畅 曾宪法 杨小英 俸婷婷 赵杰宏 周英 
国家重点研发计划项目(2018YFC1708100);贵州省科技计划项目(黔科合平台人才[2019]5407);贵州省“十四五”中医药、民族医药重点学科[QZYYZDXK(JS)-2021-03];贵州省中医药管理局中医药、民族医药科学技术研究课题(QZYY-2021-098);贵州中医药大学2021年度科研创新和探索专项(2018YFC170810201,2018YFC170810101);贵州中医药大学博士启动基金(贵中医博士启动([2019]04号)。
基于Illumina平台对朱砂根和红凉伞叶绿体全基因组进行测序,利用生物信息学比较叶绿体基因组结构特征与变异程度,旨在明确朱砂根(Ardisia crenata)及红凉伞(Ardisia crenata var.bicolor)叶绿体基因组特征及差异,并与同科其他物种叶绿...
关键词：紫金牛科 朱砂根 红凉伞 叶绿体基因组 系统发育 
建始槭叶绿体基因组密码子使用偏性分析被引量：4
《福建农林大学学报（自然科学版）》2022年第6期792-799,共8页赵月梅 杨贵清 徐其碧 尹鑫 徐林 丁波 
国家自然科学基金项目(31900273);贵州师范学院博士科研启动项目(2019BS006);大学生创新创业训练计划项目(S202114223051);黔林科合[2017]01号。
利用CodonW1.4.2和CUSP在线程序,系统分析了50条建始槭叶绿体基因密码子的使用模式及其成因.结果表明:建始槭叶绿体基因组密码子的碱基组成呈GC_(3)
关键词：建始槭 叶绿体基因组 密码子偏好性 最优密码子 
南欧大戟叶绿体基因组特征及其系统发育分析被引量：4
《分子植物育种》2022年第6期1828-1837,共10页余涛 蒲芬 管芹 范敏 
大理州科技计划重大项目(D2019NA03);云南省地方高校联合专项(202001BA070001-104);大理大学博士科研启动项目(KY1819212210);云南省李剑专家工作站(202005AF150013)共同资助。
为探究南欧大戟(Euphorbia peplus L.)叶绿体基因组序列特征及系统进化位置关系。本研究以南欧大戟总DNA为研究对象,利用Illumina HiSeq 2500高通量测序仪测定南欧大戟的叶绿体基因组序列,采用GetOrganelle进行完整叶绿体基因组的组装,...
关键词：南欧大戟 叶绿体基因组 序列特征 系统发育分析 
紫花苜蓿叶绿体基因组密码子偏好性分析被引量：32
《广西植物》2021年第12期2069-2076,共8页喻凤 韩明 
贵州师范大学2017年博士科研启动项目(GZNUD[2017]16)。
为分析紫花苜蓿叶绿体基因组密码子偏好性的使用模式,该文以紫花苜蓿叶绿体基因组中筛选到的49条蛋白质编码序列为研究对象,利用CodonW、CUSP、CHIPS、SPSS等软件对其密码子的使用模式和偏好性进行研究。结果表明:(1)紫花苜蓿叶绿体基...
关键词：紫花苜蓿 叶绿体基因组 密码子偏好性 最优密码子 
烟草叶绿体基因组RNA编辑位点的鉴定与分析被引量：4
《分子植物育种》2020年第20期6649-6656,共8页王淮 杨健康 
大理大学博士科研启动基金(KYBS201603)资助。
为了更好地了解烟草叶绿体基因组中RNA编辑位点的数量及它们发挥的功能,本研究借助烟草3种器官(叶,花,根)的基因组测序数据及RNA测序数据,对烟草叶绿体基因组里胞嘧啶(C)转换为尿嘧啶(U)的RNA编辑位点进行了鉴定。在烟草叶绿体基因组中...
关键词：烟草(Nicotiana tabacum) 叶绿体 RNA编辑 二代测序 
酸枣叶绿体基因组密码子使用偏性分析被引量：51
《森林与环境学报》2019年第6期621-628,共8页胡晓艳 许艳秋 韩有志 杜淑辉 
山西省高等学校科技创新项目(2019L0369);山西农业大学博士科研启动项目(2017YJ22);山西省优秀博士来晋工作奖励项目(SXYBKY201742)
通过分析枣属植物酸枣叶绿体基因组密码子使用偏性,探讨影响其密码子使用偏性形成的主要因素。结果表明:酸枣叶绿体基因组有效密码子数(N ec)为47.72,密码子使用偏性较弱;中性绘图分析和使用的有效密码子数绘图分析(N ec-plot绘图分析)...
关键词：酸枣 叶绿体基因组 密码子 使用偏性 
黄芩叶绿体基因组重复序列及密码子偏好性分析被引量：23
《分子植物育种》2018年第8期2445-2452,共8页王文斌 于欢 邱相坡 
山西省回国留学人员科研资助项目(2015066);人力资源和社会保障部留学回国人员科技活动择优资助项目;山西农业大学博士科研启动基金(XB2009002);山西省卫生厅中药现代化科技产业基地建设项目共同资助
本研究应用REPuter、MISA和Codon W软件对黄芩叶绿体全基因组进行重复序列及密码子偏好性分析,统计了重复序列的数量及分布情况并计算了RSCU、氨基酸使用频率、ENC、GC3s以及GC总含量等一系列数值,确定了最优密码子。结果显示,黄芩叶绿...
关键词：黄芩 叶绿体基因组 重复序列 SSR 密码子偏好性 
十字花科植物叶绿体基因组结构及变异分析被引量：16
《西北植物学报》2017年第6期1090-1101,共12页李岩 吕光辉 张雪妮 何学敏 
国家自然科学基金(31500309);新疆大学博士科研启动基金(BS150259)
该研究比较了十字花科22个属22个物种的叶绿体基因组,以揭示十字花科叶绿体基因组的一般特征和变异特征。结果发现:(1)基因组大小为150kb左右,不同植物的叶绿体基因组之间存在1~5kb的差异,基因组大小的差异主要是大单拷贝(LSC)长度的差...
关键词：十字花科 叶绿体基因组 结构 变异 系统发育 
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