叶绿体基因组

作品数:739被引量:1433H指数:32
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新型水果空心泡叶绿体基因组特征及其系统发育分析被引量:2
《生物工程学报》2023年第7期2939-2953,共15页吴永飞 杨雪莲 王霞 颜丽 张万萍 
国家自然科学基金(31860225);贵州省科技计划项目(黔科合平台人才[2018]5781号,黔科合基础[2019]1408号)。
为探究空心泡(Rubus rosaefolius)叶绿体基因组特征,本研究以空心泡为试验材料,采用Illumina NovaSeq平台进行高通量测序,获得空心泡完整的叶绿体基因组序列,并进行空心泡叶绿体基因序列特征和系统发育分析。结果表明:空心泡的完整叶绿...
关键词:空心泡 叶绿体基因组 重复序列 密码子偏好性 系统发育 
闭鞘姜叶绿体基因组特征及其系统发育分析被引量:7
《种子》2023年第4期10-17,24,F0002,共10页吴永飞 杨雪莲 颜丽 王霞 胡小京 
国家自然科学基金(31860225);贵州省科技计划项目(黔科合人才平台[2018]5781、黔科合基础[2019]1408号)。
以闭鞘姜为试材,利用高通量测序技术对其进行叶绿体基因组测序、组装和注释,获得完整的叶绿体基因组。结果显示,闭鞘姜叶绿体基因组(GenBank No. OK 641589)大小为167 158 bp,具有典型的四分体结构,包括一个大单拷贝区(LSC,91 239 bp)...
关键词:闭鞘姜 叶绿体基因组 密码子偏好性 重复序列 系统发育分析 
朱砂根叶绿体全基因组解析及系统发育分析被引量:4
《生物技术通报》2023年第1期232-242,共11页刘雄伟 刘畅 曾宪法 杨小英 俸婷婷 赵杰宏 周英 
国家重点研发计划项目(2018YFC1708100);贵州省科技计划项目(黔科合平台人才[2019]5407);贵州省“十四五”中医药、民族医药重点学科[QZYYZDXK(JS)-2021-03];贵州省中医药管理局中医药、民族医药科学技术研究课题(QZYY-2021-098);贵州中医药大学2021年度科研创新和探索专项(2018YFC170810201,2018YFC170810101);贵州中医药大学博士启动基金(贵中医博士启动([2019]04号)。
基于Illumina平台对朱砂根和红凉伞叶绿体全基因组进行测序,利用生物信息学比较叶绿体基因组结构特征与变异程度,旨在明确朱砂根(Ardisia crenata)及红凉伞(Ardisia crenata var.bicolor)叶绿体基因组特征及差异,并与同科其他物种叶绿...
关键词:紫金牛科 朱砂根 红凉伞 叶绿体基因组 系统发育 
厚壳红瘤果茶叶绿体基因组特征及密码子偏好性分析被引量:2
《种子》2022年第12期19-26,共8页肖旭 赵紫涵 陆江桃 杨国园 李志 
贵州省科技计划项目(黔科合基础-ZK[2022]一般072);贵州大学引进人才项目(贵大人基合字[2019]59号)。
为探究厚壳红瘤果茶的叶绿体基因组功能结构及密码子使用偏好性,利用CodonW、CUSP和CHIP等软件筛选出了57条蛋白编码序列,进行中性绘图分析、ENC-plot和PR 2-plot分析。结果表明,厚壳红瘤果茶叶绿体基因组全长157044 bp,呈四段式结构,...
关键词:厚壳红瘤果茶 叶绿体基因组 密码子偏好性 最优密码子 
八角枫及其亚种叶绿体基因组序列结构及系统发育分析被引量:6
《药学学报》2022年第10期3229-3239,共11页杨小英 刘畅 曾宪法 刘雄伟 赵杰宏 俸婷婷 周英 
国家重点研发计划项目(2018YFC1708100);贵州省科技计划项目(黔科合平台人才[2019]5407);贵州省“十四五”中医药、民族医药重点学科[QZYYZDXK(JS)-2021-03];贵州省中医药管理局中医药、民族医药科学技术研究课题(QZYY-2021-098);贵州中医药大学2021年度科研创新和探索专项(2018YFC170810101,2018YFC170810201)。
八角枫为八角枫科Alangiaceae八角枫属Alangium常用药用植物,是贵州特色苗药之一,该属植物分化强烈、形态变异复杂,各药材活性成分和药效存在显著差异。本文利用Illumina高通量测序技术对八角枫亚种(稀花八角枫、伏毛八角枫)和毛八角枫...
关键词:八角枫 亚种 叶绿体基因组 重复序列 系统发育 
圆锥南芥叶绿体基因组特征及密码子偏好性分析被引量:3
《分子植物育种》2022年第7期2261-2270,共10页罗茜 方正 余婕 翁庆北 朱斌 
贵州省科技计划项目(黔科合平台人才[2019]5617号);贵州省优秀青年科技人才项目(黔科合平台人才[2019]5655号)共同资助。
为探究圆锥南芥(Arabis paniculata Franch)叶绿体基因组特征及密码子使用偏好性,本研究利用MISA、CUSP和CodonW等软件对圆锥南芥的叶绿体基因组的SSR位点、系统发育及密码子偏好性进行分析。研究结果表明,圆锥南芥的完整叶绿体基因组...
关键词:圆锥南芥 叶绿体基因组 密码子偏好性 
荨麻叶绿体基因组密码子偏好性分析被引量:4
《种子》2022年第2期51-58,共8页李魁印 张海玲 张鸿 从春雷 宋晓慧 陈薇薇 庞丽 常向彩 田山君 
贵州省科技计划项目(黔科合LH字[2017]7056号);贵州省教育厅青年科技人才成长项目(黔教合KY字[2017]284);贵州省教育厅青年科技人才成长项目(黔教合KY字[2018]324)。
以荨麻(Urtica fissa L.)叶绿体基因组为研究对象,筛选出56条CDS序列,通过中性绘图分析、ENC绘图分析和PR 2绘图分析,探究其密码子的使用模式。结果表明,荨麻叶绿体基因组中密码子第3位偏好以A/T碱基结尾,密码子使用模式主要受自然选择...
关键词:荨麻 叶绿体基因组 密码子偏好性 最优密码子 
黑喉石斛叶绿体基因组特征及比较分析被引量:8
《热带作物学报》2021年第11期3111-3119,共9页杜致辉 杨澜 张朝君 许红娟 陈之林 
贵州省科技重大专项(黔科合重大专项[2019]3001);贵州省科技计划项目(黔科合平台人才[2018] 5768-05);贵州省科技支撑计划项目(黔科合支撑[2020]1Y098)。
本研究结合Illumina高通量测序和Nanopore测序技术,对黑喉石斛(Dendrobiumochreatum)的叶绿体基因组(cpDNA)进行测序,组装得到其cpDNA全长序列并绘制结构图谱。黑喉石斛cpDNA全长154 935 bp,注释共得到125个基因,其中有unigenes 103种,...
关键词:黑喉石斛 叶绿体基因组 特征 比较分析 
桑科植物叶绿体基因组研究进展被引量:4
《北方园艺》2021年第8期124-130,共7页王继玥 白禹 石登红 刘燕 
国家级大学生创新创业训练资助项目(2018109760007,2018109760008);贵州省区域内一流培育建设学科生态学资助项目(黔教科研发[2017]85号);贵州省科技计划资助项目(黔科合基础[2017]1004);生态学省级重点学科资助项目(黔学位合字ZDXK[2013]08);贵州省大学生创新训练资助项目(2018520777,2018520778,2018520831,2018520861);贵阳市财政支持贵阳学院学科建设与研究生教育资助项目(SH-2020)。
叶绿体基因组具有半自主性和母性遗传特征,揭示其功能对于研究植物起源、系统进化及物种鉴定、分类具有十分重要的作用。桑科植物具有食用、药用、生态修复及作为工业原料等多种用途。其叶绿体基因组为双链环状结构,由4个部分组成,即1...
关键词:桑科植物 叶绿体基因组 系统进化 
地果光合响应研究进展
《贵阳学院学报(自然科学版)》2021年第1期42-46,共5页王继玥 刘政红 姜莲 石登红 白禹 张婷 刘燕 
国家留学基金委项目(项目编号:留金法[2017]50863号);国家级大学生创新创业训练项目(项目编号:2018109760007,2018109760008);贵州省区域内一流培育建设学科--生态学项目(项目编号:黔教科研发[2017]85号);贵州省科技计划项目(项目编号:黔科合基础[2017]1004);贵州省教育厅创新群体重大研究项目(项目编号:黔教合KY[2018]027);贵州省一流大学建设项目“一流师资团队--生物学教学团队”(项目编号:2017158322);生态学省级重点学科(项目编号:黔学位合字ZDXK[2013]08);贵州省大学生创新训练项目(项目编号:No.);贵阳市财政支持贵阳学院学科建设与研究生教育项目(项目编号:SH-2020)共同资助
地果(F.tikoua)属于桑科榕属,具有重要药用和生态恢复价值。本文对近年来在地果生境特点、光能利用特性、逆境胁迫下光合响应以及光合响应分子机制方面取得的研究进展进行了综述,为进一步研究地果的光合响应机制提供参考。
关键词:地果 光合响应 光能利用特性 叶绿体基因组 
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