超二级结构

作品数：19被引量：41H指数：3
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蛋白质中两种Strand-Loop-Strand模体的判断
《包头医学院学报》2023年第1期1-3,17,共4页李彩艳 丁海麦 乌兰 何海燕 闻昊坤 
内蒙古大学生创新创业训练计划项目(S202119127006);内蒙古大学生创新创业训练计划项目(S202119127007);内蒙古自然科学基金项目(2020MS08015)。
目的:蛋白质的结构决定其功能,为了解蛋白质功能,需要了解蛋白质结构。随着基因测序的发展,大量蛋白质一级结构被测出,但直接从蛋白质的序列出发来预测高级结构,仍很困难,尤其是三级结构的预测。然而由超二级结构获得的结构信息可用于...
关键词：蛋白质 超二级结构 Strand-Loop-Strand模体 Fisher判别法 
蛋白质空间结构中的“超二级结构”“模体”和“结构域”概念浅析被引量：1
《生命的化学》2022年第8期1604-1608,共5页张海涛 
广东省本科高校教学质量与教学改革工程建设项目(粤教高函[2021]29号)。
生物化学教材中关于蛋白质结构中的“超二级结构”“模体”和“结构域”的概念存在着一些模糊区域。不同的教材对这些概念解释不一,甚至是相互矛盾的,导致学生理解这些概念相对困难,是教学的难点。作者根据蛋白质空间结构定义和教学经验...
关键词：二级结构 超二级结构 模体 结构域 三级结构 
基于组合的序列特征识别蛋白质复杂超二级结构βαβ模体
《内蒙古工业大学学报（自然科学版）》2015年第3期177-183,共7页孙利霞 胡秀珍 李少波 李昆 
国家自然科学基金(30960090;31260203)
从已知蛋白质结构的氨基酸序列出发,利用DSSP和PROMTIF构建了蛋白质复杂超二级结构strand-loop-helix-loop-strand模体数据集。数据集含1458条蛋白质链,其中βαβ模体数为3632个,非βαβ模体数为3148个。将亲疏水组分、优化的位点氨...
关键词：βαβ模体 SVM算法 位点氨基酸 亲疏水组分 超二级结构 
基于支持向量机的整体分类器算法 预测酶蛋白质中四类简单超二级结构被引量：4
《计算生物学》2014年第1期1-11,共11页高苏娟 胡秀珍 
国家自然科学基金资助项目(31260203, 30960090)。
酶是一种具有催化功能的蛋白质,研究酶蛋白质中的超二级结构对研究酶的结构及功能有重要作用。本文从酶蛋白质序列出发,首次对酶蛋白质中的四类简单超二级结构进行研究。以位点氨基酸及其紧邻关联为参数,选取五种序列片段截取方式,采用7...
关键词：酶蛋白质 超二级结构 矩阵打分 支持向量机 整体分类器 
基于离散增量的支持向量机算法预测蛋白质中四类简单超二级结构
《生物技术世界》2014年第2期173-174,共2页高苏娟 
蛋白质超二级结构预测是三级结构预测的一个非常重要的中间步骤。本文从蛋白质的一级序列出发,对5793个蛋白质中的四类简单超二级结构进行预测,以位点氨基酸为参数,采用3种片段截取方式,分别用离散增量算法预测的结果不理想,将组合的离...
关键词：蛋白质超二级结构 离散增量 支持向量机 
蛋白质中四类简单超二级结构的分类被引量：2
《内蒙古工业大学学报（自然科学版）》2013年第1期21-26,共6页高苏娟 胡秀珍 
国家自然科学基金资助项目(30960090);国家自然科学基金项目(31260203)
蛋白质超二级结构预测是三级结构预测的一个非常重要的中间步骤。本文从蛋白质的一级序列出发,运用了一种改进的预测算法:以氨基酸组分和紧邻氨基酸分别作为参数,输入离散增量算法的单分类器中,通过加权融合单分类器的计算结果,对四类...
关键词：离散量 离散增量 蛋白质超二级结构 
蛋白质中五类超二级结构模体的统计分析
《安徽农业科学》2012年第26期12772-12772,12854,共2页李彩艳 丁海麦 
[目的]对蛋白质中的5类超二级结构模体进行统计分析。[方法]选取5类超二级结构模体序列片段为分析材料,对它们Loop位置上的20种氨基酸出现频率进行统计分析。[结果]5类模体在左1、右1、-3、-2、-1、1、2、3 6个位置上N、G、D、S、Q的含...
关键词：蛋白质 超二级结构 统计分析 
基于二级结构预测蛋白质复合体亚基相互作用
《内蒙古科技大学学报》2010年第1期76-79,共4页裴智勇 任松叶 蔡禄 
国家自然科学基金资助项目(60761001)
蛋白质相互作用在生命活动中起着核心作用,蛋白质复合体亚基的结合是蛋白质相互作用的一种重要形式.由于实验方法耗时耗力,因此从理论上预测蛋白质相互作用有着特殊的意义.首先对蛋白质复合体的结合区统计其二级结构、超二级结构和二级...
关键词：二级结构 超二级结构 蛋白质相互作用 支持向量机 
蛋白质超二级结构序列片段的统计分析
《医学信息》2010年第3期667-668,共2页李彩艳 丁海麦 马勇 乌兰 
从蛋白质的氨基酸序列出发，用统计分析的方法，对序列相似性小于40％、分辨率低于2．57的4729个蛋白质中的超二级结构序列片断进行了统计分析，统计结果得到区分四类超二级结构的有用信息，这些统计结果对蛋白质超二级预测是非常有益的。
关键词：蛋白质 超二级结构 统计分析 
蛋白质超二级结构的分类及LOOP序列的统计分析
《内蒙古工业大学学报（自然科学版）》2008年第1期18-24,共7页李彩艳 胡秀珍 
内蒙古自然科学基金资助项目200508010509
本文对6819个相似性小于40%的7个结构类的蛋白质序列进行分析、整理,给出五类超二级结构序列模式α-α、α-β、β-α、β-β hairpin和β-β link共61824个;并根据Loop的长度进一步分类,建立了相应的蛋白质超二级结构数据库,最后对五...
关键词：蛋白质 超二级结构 统计分析 
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