韦朝春

作品数：5被引量：12H指数：1
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供职机构：上海生物信息技术研究中心更多>>
发文主题：基因组DNA提取基因组引物高灵敏度试剂盒更多>>
发文领域：农业科学医药卫生生物学更多>>
发文期刊：《现代生物医学进展》《中华病理学杂志》《科学通报》《华东理工大学学报（自然科学版）》更多>>
所获基金：国家高技术研究发展计划引进国际先进农业科技计划比尔和梅琳达·盖茨基金上海市科学技术委员会基础研究重点项目更多>>
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HUPAN助力人类基因组研究向人类泛基因组学跨越
《中华病理学杂志》2020年第2期105-107,共3页于颖彦 韦朝春 
国家重点研发项目(2017YFC0908300、2016YFC1303200);国家自然科学基金(81772505、J1210047);上海市科委西医临床重点项目(18411953100);上海交通大学医工交叉重点项目(YG2017ZD01);上海交通大学医学院转化医学创新基金(15ZH4001、TM201617、TM201702)。
近期上海交通大学科研人员成功构建人类泛基因组分析流程的报道受到学术界广泛关注,英文论著原文发表在国际基因组学研究权威刊物《Genome Biology》(基因组生物学)上。不少学者都想了解这是一项什么新技术,特别是从事基础医学研究的科...
关键词：上海交通大学 科研人员 人类基因组研究 硬件条件 人类疾病 分析流程 基础医学研究 参考序列 
水稻功能基因组育种数据库(RFGB)：3K水稻SNP与InDel子数据库被引量：11
《科学通报》2015年第4期367-371,共5页郑天清 余泓 张洪亮 吴志超 王文生 太帅帅 迟璐 阮珏 韦朝春 石建新 高用明 傅彬英 周永力 赵秀琴 张帆 McNally Kenneth L. 李自超 张耕耘 李家洋 张大兵 徐建龙 黎志康 
国家高技术研究发展计划(2012AA101101,2014AA10A601);引进国际先进农业科学技术计划(2011-G2B);国家国际合作专项(2012DFB32280);比尔盖茨基金(OPP51587,OPPGD1393);深圳市技术研究开发计划(JSGG20121026152117750)资助
水稻是全世界最重要的粮食作物之一.对全球水稻品种资源进行基因组研究,挖掘有利等位基因和指导基于全基因组信息的分子育种具有重大的理论和实践意义,是关系国家乃至全球粮食安全的重大战略问题.本研究通过全球3000份水稻资源(3K水稻)...
关键词：3K水稻 单核苷酸多态性 插入缺失 基因组育种 数据库 
基于GPU运算的宏基因组第二代测序模拟软件被引量：1
《华东理工大学学报（自然科学版）》2012年第4期472-476,共5页宣黎明 韦朝春 李亦学 
上海浦江项目(09PJ1407900)
提出一个新的宏基因组模拟系统NeSSM(Next-Generation Sequencing Simulator forMetagenomics)。通过结合目前数据库中所有的基因组信息和一些初步的宏基因组测序信息,该系统可以产生一个接近于实际情况的模拟宏基因组测序数据。为了加...
关键词：宏基因组 GPU 模拟系统 测序平台 
FIND:从下一代单端测序数据中快速查找Indel的方法
《现代生物医学进展》2010年第1期142-145,共4页宋琳琳 顾朝辉 韦朝春 
国家863计划(2009AA02Z310);上海市基础重点项目(08JC1416700)
目的:针对下一代测序数据,尤其是单端测序数据,研究快速、准确查找Indel的方法。方法:先与全基因组参考序列进行快速比对,筛选出包含Indel的序列;再对这些序列进行双向的二次比对,确定Indel长度;最后借助长度信息在锁定范围内查找Indel...
关键词：Indel查找 单端测序 下一代测序 滑动窗口算法 
Illumina-Solexa测序数据质量评估系统的构建
《现代生物医学进展》2009年第15期2899-2902,2912,共5页宋琳琳 顾朝辉 韦朝春 陈赛娟 
目的:针对下一代测序数据量大、序列长度短的特点,研究数据分析和质量评估方法。方法:选择已发布的Illumina-Solexa平台测序数据为研究对象,通过MAQ软件将测序数据与人类全基因组序列进行比对,并以外显子区域为例,在位点水平对测序数据...
关键词：下一代测序 Illumina-Solexa测序平台 MAQ比对软件 测序质量评估 
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