张家军

作品数：10被引量：29H指数：2
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供职机构：中山大学数学与计算科学学院更多>>
发文主题：基因调控噪声基因网络模块反馈回路更多>>
发文领域：生物学理学自动化与计算机技术文化科学更多>>
发文期刊：《动力学与控制学报》《生物物理学报》《中山大学学报（自然科学版）（中英文）》《电子科技大学学报》更多>>
所获基金：国家自然科学基金广东省教育科学规划项目广东省自然科学基金更多>>
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四维细胞核体调控基因表达的数学理论
《中山大学学报（自然科学版）（中英文）》2024年第6期254-264,共11页王子豪 张圳泉 张家军 
国家自然科学基金(12171494)。
多尺度三维基因组结构驱动基因表达和细胞命运决定.尽管在一维线性基因组层面上的研究取得了显著进展,但三维空间基因组动态结构如何在功能上影响时空基因表达的变化仍不清楚.近年来,测序技术和影像技术的发展,使得四维核体基因组学的...
关键词：三维基因组 基因表达 染色质构象 表观修饰 基因调控 
多层网络中谣言传播的动态控制策略分析被引量：5
《电子科技大学学报》2020年第4期511-518,554,共9页杨喜艳 吴亚豪 张家军 
国家自然科学基金(11601094,11631005);广东省自然科学基金(2018A0303130120);广东省教育科学规划课题(2018GXJK119)。
该文基于微观马尔科夫链方法建立双层网络的谣言传播模型,并提出一种动态控制策略。本文发现:1)强有力的控制能够导致谣言的同步爆发,即两个子网络层中受谣言影响的人数同时达到最大;2)发现谣言的控制效应取决于网络拓扑度、目标层和初...
关键词：马尔科夫链 多层网络 谣言传播 动态控制策略 
分子记忆对基因表达过程中的能量消耗影响
《江西师范大学学报（自然科学版）》2020年第2期215-220,共6页杨喜艳 张家军 
国家自然科学基金(11601094,11631005,11475273,11775314);广州市科技基金(201707010117);广东省自然科学基金(2018A0303130120);广东省教育科学规划课题(2018GXJK119)资助项目。
一方面,分子记忆广泛存在于基因表达过程中;另一方面,由热动力学的观点,基因表达过程必然消耗能量.这引起一个未探索的问题:分子记忆如何影响基因表达的能量消耗.由此,通过分析一个代表性的、带记忆的基因表达模型,结果发现:分子记忆越...
关键词：分子记忆 基因表达 能量消耗 极小势 
基因自调控环路的功能被引量：2
《生物物理学报》2010年第6期457-471,共15页苑占江 张家军 周天寿 
国家自然科学基金重点项目(60736028)和面上项目(30973980)~~
作为最简单且最典型的网络模块,基因自调控环路(其构成的反馈调控可以抑制或激活基因自身的表达)广泛存在于生物调控网络中,且是许多生物学功能的产生基础。虽然基因自调控环路很早以前便引起理论生物学家和实验生物学家的广泛关注,但...
关键词：网络模块 自调控环路 刺激-响应关系 振动性 双稳性 
分数阶Rucklidge混沌系统的同步研究被引量：20
《动力学与控制学报》2010年第3期234-238,共5页陈保颖 张家军 苑占江 
广东工业大学校青年基金(072041)~~
主要讨论了分数阶混沌系统的同步问题.采用线性以及自适应控制两种不同的方案实现了分数阶Rucklidge系统的混沌同步.这两种方案均具有结构简单、易于实现的特点.而且,基于分数阶微分方程稳定性理论,可以保证同步是全局渐近稳定的.最后,...
关键词：混沌同步 分数阶混沌系统 线性反馈 自适应控制 
基因调控系统中反馈压制的噪声:慢转录情形
《中国科学（C辑）》2010年第1期78-87,共10页苑占江 张家军 周天寿 
国家自然科学基金重点和面上项目(批准号:60736028;30973980)资助
对于基因调控系统,噪声与反馈之间的关系一直是令人关注的话题.本文以基本的正负反馈环路为模型,同时考虑了一个重要但被以往研究忽视的因素:非平衡基因状态波动或慢转录过程(如在真核细胞中),研究了反馈对噪声的效果,导出了修正的波动...
关键词：噪声 正反馈 负反馈 慢转录 波动-耗散关系 
松弛型基因随机振子的同步和聚类
《力学季刊》2009年第1期82-87,共6页张家军 苑占江 周天寿 
国家自然科学重点项目(60736028)
松弛型基因随机振子是三类基因振子(光滑振子、松弛振子和随机振子)中的一种.具有相抑制耦合细胞通信的这种类基因振子的同步与聚类是一个有趣且令人关注的问题。这里,数值模拟显示出振子之间的相差分布能够展示出单峰、双峰或多峰分布...
关键词：基因调控网 随机振子 同步 聚类 
典型生化网络构建子块中噪声传播的机制
《物理学报》2009年第4期2804-2811,共8页陈爱敏 张家军 苑占江 周天寿 
国家自然科学基金重点项目(批准号:60736028)资助的课题~~
活性细胞的内部过程是一个内在的随机过程,而细胞内分子丰度的波动对细胞的生长和发育会产生重大影响.对生化网络(包括信号转导网络和代谢网络)的典型构建子块,采用统一的生化反应模式,应用线性噪声逼近理论刻画出噪声传播的一般机制:...
关键词：噪声传播 线性噪声逼近 信号转导网络 代谢网络 
噪声诱导多细胞系统的同步切换被引量：1
《生物化学与生物物理进展》2008年第8期929-939,共11页张家军 王军威 苑占江 周天寿 
国家自然科学重点基金(60736028);全国优秀博士学位论文(200521)资助项目~~
在以往的工作中讨论了对单细胞的基因开关系统噪声如何诱导连贯切换.在此,对多细胞的基因开关网络系统研究各种噪声(包括细胞内噪声和细胞环境噪声)对同步切换的影响.发现:细胞内基因调控过程中的合成率和降解率的随机涨落以及细胞内的...
关键词：噪声 同步切换 基因开关系统 群体感应机制 合成基因网 
噪声诱导的连贯切换被引量：2
《中国科学（B辑）》2007年第5期446-452,共7页苑占江 张家军 周天寿 
全国优秀博士学位论文(200521);国家自然科学重点基金(批准号:60736028)资助项目
以著名的基因开关系统为例,数值地调查了噪声对其双稳性的影响.发现基因调控过程中的合成率或降解率的涨落所导致的噪声以及环境涨落引起的噪声均能够诱导连贯切换,而且发现存在一个最合适的噪声强度,它不仅能实现这种切换,而且能使弱...
关键词：噪声 连贯切换 基因开关系统 基因调控 人造基因网 
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