国家高技术研究发展计划(2006AA02Z334)

作品数:13被引量:30H指数:3
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相关作者:王健曹顺良刘杰袁一王超更多>>
相关机构:上海立信会计学院上海大学复旦大学哈尔滨工业大学更多>>
相关期刊:《中国农学通报》《Science China(Life Sciences)》《计算机工程与设计》《Science Bulletin》更多>>
相关主题:计算网格生物信息学产业集群产业集聚度服务业产业更多>>
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BDCGrid:基于Globus的生物信息高性能计算网格系统
《生物信息学》2011年第1期65-67,71,共4页刘小川 赵树起 孔雷 刘小桥 王珺 李哲 顾孝诚 高歌 
国家高技术研究发展计划(批准号:2006AA02Z334;2006AA02Z314;2006AA02A312)
随着分子生物信息数据量高速增长,生物信息学面临着大规模、高通量、密集型计算的巨大挑战。为有效利用计算机资源,缩短高通量生物信息计算程序执行时间,我们基于Globus Toolkit网格中间件,实现了一个支持高通量生物数据计算的网格系统(...
关键词:生物信息学 网格计算 高通量生物数据 
TSdb:A database of transporter substrates linking metabolic pathways and transporter systems on a genome scale via their shared substrates被引量:6
《Science China(Life Sciences)》2011年第1期60-64,共5页ZHAO Min CHEN YanMing QU DaCheng QU Hong 
supported by the National High Technology Research and Development Program of China (Grant Nos. 2006AA02Z334, 2006AA02Z314, 2006AA02A312 and 2007AA02Z165);the National Basic Research Program of China (Grant Nos. 2006CB910404 and 2007CB946904);support of the K. C. Wong Education Foundation, Hong Kong
TSdb (http://tsdb.cbi.pku.edu.cn) is the first manually curated central repository that stores formatted information on the substrates of transporters. In total, 37608 transporters with 15075 substrates from 884 organ...
关键词:transporter substrate biological database compound classification compound metabolic network 
基因表达谱芯片数据挖掘系统被引量:2
《计算机应用研究》2009年第8期2938-2941,共4页李荣 
国家"863"计划资助项目(2006AA02Z334);上海市市本级财政部门预算项目(1138IA0005)
基因芯片是基因组研究的重要工具,其数据分析极大依赖于数据挖掘技术。结合数据挖掘技术和生物信息学研究,设计并实现了若干基因表达谱芯片数据挖掘分析模型及相应的数据挖掘系统,具有良好的收缩性和实体独立性,底层复杂的数据挖掘算法...
关键词:数据挖掘 生物信息学 基因芯片 基因表达 分析模型 
生物实验流程管理系统模型及其在水稻基因组测序中的应用被引量:1
《中国农学通报》2009年第17期52-56,共5页杨亮 赵晓飞 袁一 杨德光 王健 
国家高技术研究发展计划(863计划)(2006AA02Z334)
生物实验流程管理是生物实验室信息管理系统的核心,针对生物实验室实验流程灵活,数据流网络复杂等特点,设计了一套生物实验流程管理模型(Biological experiments flow management model,简称BioEFM),为生物实验室信息管理系统软件(Biolo...
关键词:生物实验流程管理 生物实验室信息管理 水稻基因组测序 
DICE:电压门控离子通道电生理实验数据库
《生物信息学》2009年第1期68-71,共4页郭景康 梁茜 王超 李泽 张国庆 李亦学 孙晓明 王健 
863计划(2006AA02Z334)资助
针对现有相关文献中离子通道电生理数据繁多且分散的特点,开发了一套电压门控离子通道电生理实验数据库。数据库中目前主要包括钠离子通道序列数据、调制剂分子结构和序列数据,并收集整理了文献中调制剂和通道相互作用时的电生理学数据...
关键词:电压门控离子通道 神经毒素 离子通道调制剂 电生理 
基于UML的生物实验室信息管理系统建模研究被引量:4
《计算机工程与设计》2009年第3期689-692,共4页罗磊 曹顺良 王超 吴坚 袁一 郭景康 王健 
国家863高技术研究发展计划基金项目(2006AA02Z334)
生命科学研究中的实验流程复杂、实验数据类型繁多。在系统分析生物实验室运作流程的基础上,用数据流图(DFD)描述了一个典型生物实验室的业务流程与数据流,给出了生物实验室信息管理系统的基本功能模块以及需要管理的数据流。以资源管...
关键词:统一建模语言 数据流图 需求分析 建模 实验室信息管理系统 
上海市信息服务业产业集群分析被引量:13
《软科学》2008年第11期31-34,42,共5页曹顺良 刘杰 李宁 张爱清 王建会 
国家高技术研究发展计划(863计划)资助项目(2006AA02Z334);上海市科技发展基金软科学研究项目(076921004);上海市市本级财政部门预算智能信息管理学科建设项目(1138IA0005)
采用定性与定量相结合的方法,对上海市信息服务业产业集群进行了深入分析。研究发现,上海市信息服务业产业集群目前存在企业集聚度较低、缺乏行业龙头企业、未形成高效的区域创新网络等主要问题。提出了完善上海市信息服务业产业集群、...
关键词:信息服务 产业集群 产业集聚度 企业集聚 区域集聚 
Renewal and preliminary study of expressed sequence tags database on human fetal liver aged 22 wk of gestation
《Chinese Science Bulletin》2008年第20期3204-3210,共7页CHEN TingGui WU SongFeng ZHOU GangQiao ZHU YunPing HE FuChu 
the National High Technology Research and Development Program of China (Grant Nos. 2006AA02A312, 2006AA02Z334);National Basic Research Program of China (Grant No. 2006CB910803, 2006CB910706);National Natural Science Foundation of China (Grant No. 30621063);Beijing Municipal Key Project (Grant No. H030330280590)
With the developments of international human transcriptome data and our ESTs of human fetal liver aged 22 weeks (wk) of gestation (HFL22w), the former research must be renewed. In this work, the EST data were firstly ...
关键词:怀孕期 胎儿 肝脏 表达序列 基因存在论 分级聚类 
RE-OEM:一种半结构化生物数据的信息抽取模型被引量:2
《计算机应用研究》2008年第9期2647-2650,2654,共5页曹顺良 刘杰 王健 刘念祖 李亦学 
国家"863"计划资助项目(2006AA02Z334)
在分析半结构化生物数据特点的基础上,提出了一种新的半结构化数据抽取模型RE-OEM。它将OEM数据模型和正则表达式有机地结合起来,不但能够灵活方便地表示各种数据结构,而且能够非常方便地进行模式匹配和数据的定位,为半结构化生物数据...
关键词:半结构化 生物数据 抽取模型 OEM数据模型 正则表达式 
22周孕龄人胎肝表达序列标签数据更新与初步分析
《科学通报》2008年第18期2223-2228,共6页陈廷贵 吴松锋 周钢桥 朱云平 贺福初 
国家高技术研究发展计划(批准号:2006AA02A312,2006AA02Z334);国家重点基础研究发展计划(批准号:2006CB910803,2006CB910706);国家自然科学基金(批准号:30621063);北京市科技计划(批准号:H030330280590)资助项目
随着国际上转录组数据及本室22周孕龄人胎肝表达序列标签数据的不断增加,先前该组织表达谱的研究有必要进行更新与完善.本研究首先将22周孕龄人胎肝每一表达序列标签与自身数据库,UniGene,DoTS,MGC以及Twinscan预测的人类转录组数据库...
关键词:人胎肝 表达序列标签 归类与拼接 基因本体论 层次聚类 
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