福建省自然科学基金(2009J01283)

作品数：13被引量：11H指数：2
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基于随机游走的FISH细胞检出及HER2状态判别
《中国体视学与图像分析》2013年第4期318-325,共8页刘秉瀚 李月娇 王伟智 
福建省科技重点项目(2011Y0040);福建省自然科学基金(2009J01283)
目的针对肿瘤FISH图像细胞边缘模糊和粘连等问题,提出一种基于自动随机游走的细胞检出及HER2基因状态判别方法。方法首先,在RGB颜色空间中的分割细胞、信号点等区域;然后,改进极限腐蚀算法,自动获取细胞种子区域,并提取有效种子点进行...
关键词：FISH细胞 极限腐蚀 随机游走 HER2状态 
一种动态时间弯曲距离的时延调控基因相似度量聚类方法被引量：1
《福州大学学报（自然科学版）》2013年第2期158-163,共6页薛劼 郭红 
福建省自然科学基金资助项目(2009J01283)
针对传统的基于距离/相关系数的相似性度量方法无法有效度量基因间的时延表达特性,为了更加准确地刻画基因间的共调控关系,提出一种基于动态时间弯曲距离(DTW)的相似性度量方法,并结合可指定类数的仿射传播聚类算法进行聚类.将该算法用...
关键词：基因表达 动态时间弯曲距离(DTW) 时延 仿射传播聚类 
构建时延基因调控网络的多数据源融合算法被引量：1
《小型微型计算机系统》2013年第2期375-379,共5页徐赛娟 郭红 吕暾 
福建省自然科学基金项目(2009J01283)资助
为了进一步提高基因调控网络构建的精确度,提出一种基于多数据源融合的时延基因调控网络构建算法.该算法基于递归模糊神经网络模型,使用时序互信息估计基因间的转录时延,并限制每个基因的潜在调控基因,从而有效提高建网的效率.在网络结...
关键词：基因调控网络 递归模糊神经网络 多数据源融合 时延 时序互信息 
基于递归模糊神经网络的多时延基因调控网络构建方法被引量：1
《福州大学学报（自然科学版）》2012年第2期165-171,共7页徐赛娟 郭红 
福建省自然科学基金资助项目(2009J01283)
为了处理连续的时序基因表达数据,提出了一个基于递归模糊神经网络的多时延基因调控网络构建算法.该算法能直接用于分析连续的时序基因表达数据,避免离散化数据造成的信息损失.使用时序互信息估计基因间的转录时延,并限制每个基因的潜...
关键词：基因调控网络 递归模糊神经网络 时延 时序互信息 
基于Haar特征和级联结构的CISH细胞检出
《中国体视学与图像分析》2012年第1期20-26,共7页王晖 刘秉瀚 
福建省自然科学基金(2009J01283);福建省科技重点项目(2011Y0040)
目的提出一种基于Haar特征和Gentle Adaboost级联结构的CISH细胞自动检出方法。方法根据乳腺癌CISH图像染色导致的细胞边缘模糊,不利于细胞的检出的问题。首先,对待检测图像进行光照补偿,减小光照对细胞检测造成的影响;然后,利用针对CIS...
关键词：CISH细胞 细胞检测 HAAR特征 级联结构 
一种采用自适应免疫遗传算法的分子对接构象搜索方法
《信息系统工程》2011年第10期116-118,共3页傅兵 郭红 
福建省自然科学基金资助项目(2009J01283);福建省科技计划重点资助项目(2008H0026))
分子对接是计算机辅助药物分子优化设计中的重要组成部分。搜索算法和评分函数是当前分子对接研究的难点与热点。本文提出了一个基于自适应免疫遗传算法的分子对接构象搜索方法AutoDockAIGA。设计了基于自适应免疫遗传算法的构象搜索方...
关键词：免疫遗传算法 分子对接 构象搜索 autodock3.05 
一种采用新的相似性度量方法的共调控基因动态模糊聚类算法被引量：1
《福州大学学报（自然科学版）》2011年第2期198-205,共8页李小梅 郭红 吕暾 
福建省自然科学基金资助项目(2009J01283);福建省科技计划重点资助项目(2008H0026)
针对基因间共调控关系的特点和现有共调控基因聚类分析方法的不足,提出一种基于广义信息论中二次互信息的广义相似性度量标准QMISM,并利用免疫遗传算法将高维样本映射到二维空间,进而实现动态模糊聚类和聚类结果可视化.对人工合成数据...
关键词：共调控基因 相似性度量 免疫遗传算法 动态模糊聚类 
一种改进的虹膜内边缘定位算法
《莆田学院学报》2011年第2期46-49,共4页傅明建 
福建省自然科学基金资助项目(2009J01283)
首先利用小尺度高斯低通滤波器对虹膜图像进行预处理,去除可能存在的眼睑和睫毛干扰;然后用Canny边缘检测算子得到虹膜的内边缘,通过自适应选取非极大值抑制的高阈值,并对不连续边缘进行修整,得到比较理想的虹膜内边缘;最后利用圆周上...
关键词：虹膜定位 虹膜识别 CANNY算子 自适应阈值 
自适应模糊增强的乳腺癌CISH细胞边缘检出被引量：2
《中国体视学与图像分析》2010年第4期399-404,共6页刘秉瀚 王伟智 
福建省自然科学基金项目(2009J01283);福建省科技计划重点项目(2008H0026)
目的提出一种自适应设定可调参数的双线性广义模糊增强的细胞Canny边缘检出方法。方法根据乳腺癌CISH病理图像组织灰度分布特征,自动选取阈值设置双线性广义模糊增强的可调参数,并用自适应模糊增强算法代替Canny算法中的高斯滤波器,在...
关键词：CISH乳腺癌 细胞边缘 模糊增强 自适应 CANNY算子 
基因表达数据的模糊聚类技术研究被引量：2
《信息系统工程》2010年第11期104-107,共4页李小梅 郭红 
福建省自然科学基金资助项目(2009J01283);福建省科技计划重点资助项目(2008H0026)
利用聚类分析工具可以从海量的、日益增长的基因表达数据中解析出其中可能的编码基因及其生理功能,这是生物信息学中一项很有意义的工作。模糊聚类算法是一种常用的基因表达数据聚类分析工具,可以发现重叠的基因簇,它不强制将每个基因...
关键词：生物信息学 基因表达数据 模糊聚类 
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