国家自然科学基金(31260203)

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基于二十维组合特征的Naive Bayes Classifier预测金属离子配体的结合残基
《内蒙古工业大学学报（自然科学版）》2018年第5期325-331,共7页刘柳 张晓瑾 胡秀珍 王珊 
内蒙古自然科学基金项目(2016MS0378);国家自然科学基金项目(31260203)
蛋白质与金属离子配体的相互作用在生命进程中扮演着非常重要的角色.预测金属离子配体的结合残基对于理解细胞机制和设计分子药物有重要意义.文中使用Naive Bayes Classifier对十种金属离子配体Zn^(2+)、Fe^(2+)、Fe^(3+)、Cu^(2+)、Mn^...
关键词：NAIVE BAYES CLASSIFIER 金属离子配体 结合残基 特征参数 
两种酸根离子配体结合位点的识别被引量：1
《内蒙古工业大学学报（自然科学版）》2018年第4期246-254,共9页王珊 张晓瑾 胡秀珍 刘柳 
内蒙古自然科学基金项目(2016MS0378);国家自然科学基金项目(31260203)
在许多重要的生命活动中,蛋白质功能的执行依赖于蛋白质与配体的相互作用,酸根离子作为一种重要的蛋白质结合配体,其结合位点的识别对于蛋白质功能的研究有着重要意义.本文选取了两种酸根离子配体作为研究对象,提出了基于序列信息的Mult...
关键词：酸根离子配体 MultilayerPerceptron算法 结合位点 位点信息 
融合物化特征及结构信息的随机森林算法识别Ca^(2+),Mg^(2+)和Mn^(2+)结合残基被引量：1
《内蒙古工业大学学报（自然科学版）》2018年第1期22-27,共6页曹晓勇 胡秀珍 张晓瑾 
内蒙古自然科学基金(2016MS0378);国家自然科学基金(31260203)
Ca^(2+),Mg^(2+)和Mn^(2+)结合残基的识别是众多的金属离子配体中效果较差的,但这些金属离子配体与蛋白质的相互作用在生命进程中实现了不可替代的生物学功能,因此提高Ca^(2+),Mg^(2+)和Mn^(2+)结合残基的识别质量对药物设计特别重要。...
关键词：金属离子配体 随机森林算法 SVM算法 结合位点 
基于组合的矩阵打分算法识别Na^+和K^+配体结合残基
《内蒙古工业大学学报（自然科学版）》2016年第4期271-276,共6页贾怀乐 曹晓勇 田耀宇 胡秀珍 
内蒙古自然科学基金(2016MS0378);国家自然科学基金(31260203)
金属离子配体与蛋白质的相互作用,在诸多重要的生命进程中实现着不可替代的生物学功能,配体结合残基的预测对蛋白质生物功能的理解提供重要的依据,也有利于药物设计和开发。工作中选取了研究者已整理好的一价金属离子配体Na+和K+的结合...
关键词：矩阵打分算法 金属离子配体 结合位点 BioLip数据库 
基于序列信息的融合多种特征参数方法预测膜蛋白类型
《内蒙古工业大学学报（自然科学版）》2016年第2期103-110,共8页邢浩然 胡秀珍 
国家自然科学基金(31260203)
不同类型的膜蛋白执行不同的功能,因此膜蛋白的分类对蛋白质功能的研究相当重要。根据膜蛋白在磷脂双分子层的分布特点,将膜蛋白序列进行等分处理,以每一部分的氨基酸组分为特征参数,利用离散增量算法对8类膜蛋白分类,得到的预测总精度...
关键词：膜蛋白 离散增量算法 矩阵打分算法 支持向量机 
三种配体结合残基的识别
《内蒙古工业大学学报（自然科学版）》2015年第4期260-269,共10页格日勒图 胡秀珍 
国家自然科学基金(31260203)
配体结合残基的预测对蛋白质生物功能的理解提供重要的依据,也有助于药物设计和开发。ATP、GTP和NAD三种配体具有相似的化学结构,生物功能也有着紧密的联系,所以我们将ATP、GTP和NAD三种大分子配体作为一个系列,分别对蛋白质中ATP、GTP...
关键词：离散增量算法 矩阵打分算法 二级结构信息 表面可及性 支持向量机 
基于支持向量机的整体分类器算法 预测酶蛋白质中四类简单超二级结构被引量：4
《计算生物学》2014年第1期1-11,共11页高苏娟 胡秀珍 
国家自然科学基金资助项目(31260203, 30960090)。
酶是一种具有催化功能的蛋白质,研究酶蛋白质中的超二级结构对研究酶的结构及功能有重要作用。本文从酶蛋白质序列出发,首次对酶蛋白质中的四类简单超二级结构进行研究。以位点氨基酸及其紧邻关联为参数,选取五种序列片段截取方式,采用7...
关键词：酶蛋白质 超二级结构 矩阵打分 支持向量机 整体分类器 
蛋白质中四类简单超二级结构的分类被引量：2
《内蒙古工业大学学报（自然科学版）》2013年第1期21-26,共6页高苏娟 胡秀珍 
国家自然科学基金资助项目(30960090);国家自然科学基金项目(31260203)
蛋白质超二级结构预测是三级结构预测的一个非常重要的中间步骤。本文从蛋白质的一级序列出发,运用了一种改进的预测算法:以氨基酸组分和紧邻氨基酸分别作为参数,输入离散增量算法的单分类器中,通过加权融合单分类器的计算结果,对四类...
关键词：离散量 离散增量 蛋白质超二级结构 
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