江苏理工学院电气信息工程学院生物信息与医药工程研究所

作品数:29被引量:111H指数:6
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发文领域:医药卫生自动化与计算机技术农业科学理学更多>>
发文主题:猪苓蛋白质分子对接基因克隆药用真菌更多>>
发文期刊:《中国医药生物技术》《药学学报》《农药学学报》《中国药学杂志》更多>>
所获基金:国家自然科学基金江苏省自然科学基金NSFC-广东联合基金江苏省“六大人才高峰”高层次人才项目更多>>
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苏拉明与HIV-1衣壳蛋白六聚体中NTD/CTD界面互作调节CA蛋白装配
《药学学报》2025年第3期817-824,共8页许晓双 张大为 
国家自然科学基金资助项目(31700297)。
HIV-1衣壳蛋白(HIV-1 capsid protein,CA)是寻找抗病毒药物的有效靶点。靶向HIV-1 CA C端结构域(C-terminal domain of HIV-1 CA,CA CTD)中的CAI(capsid assembly inhibitor peptide)结合口袋可用来筛选CA蛋白抑制剂。本研究基于均相时...
关键词:苏拉明 衣壳装配 生物膜干涉 人类免疫缺陷病毒1型 均相时间分辨荧光技术 
基于机器学习的支原体肺炎诊断中临床表现与生化指标的关键特征分析
《现代计算机》2024年第14期9-17,共9页茅荣智 陆小花 裴佳璐 鲍国明 张春 许晓军 谢良旭 
江苏省研究生科研与实践创新计划项目(SJCX22_1480)。
支原体肺炎病例的诊断过程中涉及大量的临床指标和生物化学指标,由于没有统一的单一确诊指标,医生常常面临如何正确诊断的困扰。为获得支原体肺炎诊断和评估中的关键临床表现指标和生物化学指标,采用多种机器学习分类模型进行定量分析...
关键词:支原体肺炎 机器学习 特征评估 特征筛选 特征分析 
计算模型在化合物毒性预测方面的应用及展望被引量:1
《现代计算机》2024年第7期81-85,共5页许志旺 何王秋 孔韧 
毒性研究是一项重要且复杂的科学工作,涉及到评估化学物质及其他物质对人类健康的潜在危害,也对环境保护和可持续发展起着重要作用。传统的基于分子、细胞与动物模型的毒理学实验,除了成本高昂且耗时的问题,还存在对动物不友好的局限性...
关键词:计算毒理学 机器学习 毒性预测 
基于改进U⁃Net的视盘视杯联合分割方法
《现代计算机》2024年第3期48-53,60,共7页周利涛 王志超 施璜浩 常珊 
国家自然科学基金青年项目(81603152);常州市科技支撑计划(社会发展)(CE20205033)。
青光眼是一种不可逆的致盲性眼疾,疾病早期症状不明显使得许多患者错失治疗的最佳时机。眼底照相作为最常见的青光眼筛查手段,眼底杯盘比值是诊断青光眼的重要指标之一。针对图像中视盘视杯分割精度不高的问题,构建了一种改进U⁃Net的视...
关键词:青光眼 视盘 视杯 眼底图像分割 深度学习 
蛋白质分子机器结构的特性分析及去折叠研究被引量:1
《数据采集与处理》2022年第5期1126-1133,共8页张莉莉 蒋益锋 谢良旭 孔韧 常珊 
国家自然科学基金(22003020);江苏省自然科学基金(BK20191032);常州市重点研发项目(CJ20200045);常州市社会发展科技支撑项目(CE20200503)。
分子机器是指由分子尺度的物质构成且能行使某种加工功能的机器,主要构件是蛋白质等生物分子。三维空间结构决定了蛋白质的相关特性和功能,理解蛋白质的氨基酸(残基)序列如何折叠成特定的三维空间结构,即蛋白质结构的折叠机制及其特性...
关键词:蛋白质 弹性网络模型 结构特性 去折叠 GB1 
基于深度学习的癫痫脑电信号分类被引量:1
《数据采集与处理》2022年第4期787-797,共11页徐晴 葛成 蔡标 陆翼 常珊 
有效地分析处理癫痫脑电信号并对其准确分类可以进一步完善癫痫检测问题。因此,各种深度学习方法逐渐应用到该问题中,如使用BiLSTM模型对癫痫脑电的一维时间序列数据进行处理。为进一步提高癫痫脑电分类的准确率,本文将癫痫脑电的一维...
关键词:癫痫 脑电信号 EfficientNetV2 BiLSTM 梯度加权类激活映射 
自适应噪声完备经验模态分解排列熵结合支持向量机的心音分类方法研究被引量:8
《生物医学工程学杂志》2022年第2期311-319,共9页刘美君 吴全玉 丁胜 潘玲佼 刘晓杰 
国家自然科学基金青年项目(62001196);江苏省重点研发计划项目(BE2019317,BE2020648)。
针对心音信号非平稳性、非线性的特征,为了更直观地把心音信号的特征显示出来,提高分类识别的高效性,提出了一种自适应噪声完备经验模态分解(CEEMDAN)排列熵作为心音信号的特征向量,通过支持向量机(SVM)进行心音分类识别的方法。首先,...
关键词:心音分类 自适应噪声完备经验模态分解 排列熵 支持向量机 
基于融合神经网络模型的药物分子性质预测被引量:12
《计算机科学》2021年第9期251-256,共6页谢良旭 李峰 谢建平 许晓军 
国家自然科学基金(12074151,22003020);江苏省自然科学基金(BK20191032);常州市重点研发项目(CJ20200045);江苏省中以产业技术研究院开放课题(JSIITRI202009)。
在生物信息学领域,人工智能方法在预测药物分子的物理化学性质和生物活性中获得了重大成功,特别是神经网络已被广泛应用到药物研发中。但是浅层神经网络的预测精度低,深度神经网络又容易出现过拟合的问题,而模型融合策略有望提升机器学...
关键词:计算机辅助药物设计 生物信息学 模型融合 深度学习 机器学习 
基于双边随机投影算法的光学相干层析成像降噪被引量:1
《数据采集与处理》2021年第4期713-721,共9页潘玲佼 范伟伟 吴全玉 
国家自然科学基金(62001196)资助项目;江苏省高校面上项目(17KJB510015)资助项目;江苏省重点研发计划(BE2020648)资助项目。
为了解决光学相干层析成像(Optical coherence tomography,OCT)系统中的散斑噪声问题,提出了一种基于双边随机投影的光学相干层析成像去噪算法。基于三维OCT图像相邻帧的生物组织结构之间的高度相似性及图像高分辨率的特性,将原始OCT图...
关键词:散斑噪声 光学相干层析成像 双边随机投影 图像处理 
基于分子对接的新型复合物Ⅲ抑制剂的虚拟筛选
《农药学学报》2020年第6期942-950,共9页杜士杰 覃兆海 许磊 
中国博士后科学基金资助项目(2019M653843XB);贵州省科学技术基金(黔科合基础[2020]1Y053);贵州省科技厅科技创新人才团队资助项目(黔科合平台人才[2020]5009);贵州省教育厅普通高等学校工程研究中心建设项目(黔教合KY字[2017]024);铜仁市中药民族药现代化研究与开发利用重点实验室(铜市科研[2019]03号)。
为了发现更卓越的复合物Ⅲ抑制剂,采用多级递进式筛选法,从Specs数据库中筛选出14个化合物,采用菌丝生长速率法进行了离体抑菌活性测定。结果表明:14个化合物在50μg/mL下对油菜菌核病菌、立枯丝核菌、番茄晚疫病菌、棉花枯萎病菌和番...
关键词:分子对接 分子动力学模拟 复合物Ⅲ 嘧菌酯 抑菌活性 虚拟筛选 
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