大连理工大学计算生物学和生物信息学研究所

作品数：11被引量：30H指数：4
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发文作者：唐焕文张伟伟潘丽丽武振华更多>>
发文领域：生物学医药卫生电子电信理学更多>>
发文主题：功能磁共振成像盲源分离系统发育盲分离FMRI更多>>
发文期刊：《生物物理学报》《中国生物工程杂志》《计算机与应用化学》《大连理工大学学报》更多>>
所获基金：国家自然科学基金国际科技合作与交流专项项目国家重点基础研究发展计划国家教育部博士点基金更多>>
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新的ICA算法实现成组fMRI信号盲分离被引量：4
《大连理工大学学报》2007年第5期773-776,共4页唐焕文 张伟伟 史振威 潘丽丽 唐一源 
国家科技部国际合作资助项目(DF2003);国家自然科学基金资助项目(10571018)
独立成分分析(ICA)方法已被成功地用于处理功能磁共振成像(fMRI)信号,但主要是用于处理单个被试的fMRI信号,对于多个被试的情况却很少考虑.为此利用一种扩展的ICA方法——Group ICA来处理多个被试的fMRI信号,结果表明这种方法在保证结...
关键词：独立成分分析 盲源分离 功能磁共振成像 
新的独立成分分析算法结合主成分分析实现fMRI信号的盲分离被引量：3
《生物医学工程学杂志》2007年第2期430-433,共4页张伟伟 史振威 唐焕文 唐一源 
国家自然科学基金资助项目(90103033;10571018;60472017);博士点基金资助项目(021010)
用ICA算法来实现fMRI信号的盲源分离,可以提取出产生fMRI信号的多种源信号。但是在处理过程中存在两个困难:(1)fMRI数据的规模比较大,计算耗时;(2)计算量太大难免产生误差,给结果的分析带来不便。所以我们考虑对数据进行降维,但是如何...
关键词：独立成分分析 盲源分离 主成分分析 功能磁共振成像 
一种新的结构正割法在时间序列图像配准中应用被引量：2
《大连理工大学学报》2007年第2期301-304,共4页孙少燕 唐焕文 唐一源 
国家科技部"九七三"前期专项资助项目(2001CCA00700);国家自然科学基金资助项目(10571018)
脑功能成像是进行神经科学研究的一项重要技术.在脑功能图像的数据分析中,时间序列图像的配准精度是对脑功能图像进行统计分析成功与否的关键.针对一种典型的非线性最小二乘形式的配准测度,引进一种新的结构正割法来计算其极小值.该方...
关键词：图像配准 测度 结构正割法 拟牛顿方程 BFGS校正 FMRI 
ROC分析及其在fMRI信号中的一个应用被引量：2
《生物医学工程学杂志》2007年第1期19-22,共4页武振华 唐焕文 唐一 
国家自然科学基金资助项目(90103033;10571018;60472017);博士点基金资助项目(021010)
详细阐述了受试者工作特征(Receiver operating characteristic,ROC)分析的基本原理,分析了它与其它的诊断评价性标准相比存在的优点,并给出了ROC曲线的绘制方法,最后采用ROC对独立成分分析(Independent component analysis,ICA)和统计...
关键词：受试工作特征 功能磁共振成像 独立成分分析 统计参数图 
基于全蛋白质组的微生物系统发育树构建被引量：1
《大连理工大学学报》2005年第6期925-930,共6页张文 唐焕文 方伟武 蔡旭 张伟伟 
国家自然科学基金资助项目(9010303320176005)
新近出现的信息离散性度量方法(简称FDOD方法)已在多个领域获得成功的应用,是一种非比对距离方法.随着越来越多的微生物全基因组测序任务的完成,人们开始在整个基因组水平上探讨物种的系统发育关系.因此,将FDOD方法应用于微生物系统发...
关键词：微生物 原核生物 古细菌 系统发育 信息离散性度量 
基于线粒体全基因组的非比对方法比较被引量：1
《计算机与应用化学》2005年第10期837-844,共8页蔡旭 方伟武 张文 
国家自然科学基金资助项目(901003033)973项目(2004CB318000)
在系统发育分析等分子生物学的研究问题中,传统上要用到基于多序列比对的方法,然而这类方法有一定的局限性. 本文介绍了一类新的研究系统发育问题的方法——非比对方法,该类方法可以克服基于比对距离方法在计算规模和主观因素等方面的...
关键词：哺乳动物 线粒体全基因组 细胞色素B 非比对方法 FDOD 系统发育 
fMRI信号盲分离的一种独立成分分析算法被引量：6
《大连理工大学学报》2005年第4期607-611,共5页潘丽丽 史振威 唐焕文 唐一源 张伟伟 
科技部国际合作资助项目(DF2003);教育部重大项目(KP0302);国家自然科学基金资助项目(60472017)
建立了独立成分分析(independentcomponentanalysis,ICA)的一个优化模型,在此基础上,给出了一个新的梯度算法,称之为Orth-ExtBS算法.该算法结合了ExtBS算法和FastICA算法,兼顾两者的优点,形式简单,易于应用,能有效地盲分离具有超高斯和...
关键词：独立成分分析 盲源分离 梯度算法 功能磁共振成像 
利用独立成分分析实现成组的fMRI信号的盲分离被引量：4
《中国医学影像技术》2005年第3期333-335,共3页张伟伟 史振威 阎芬 唐焕文 唐一源 
科技部国际合作(DF2003);教育部(KP0302);国家自然科学基金(60472017)支持
独立成分分析(ICA)作为盲源分离的一种有效方法已经被成功的用于处理功能磁共振成像(fMRI)数据,但是通常人们只是考虑处理单个被试的数据,对于多个被试的情况却很少有人考虑,本文中分析了目前国际上比较流行的三种用 ICA来处理多个被试...
关键词：盲源分离 独立成分分析 功能磁共振成像 
新的独立成分分析算法实现功能磁共振成像信号的盲分离被引量：7
《生物物理学报》2004年第3期188-192,共5页武振华 史振威 唐焕文 唐一源 
国家自然科学基金项目(9010303330170321);国家科技部973前期专项(2001CCA00700)
采用独立成分分析(independentcomponentanalysis,ICA)的一种新的牛顿型算法来提取功能磁共振成像(functionalmagneticreasonanceimaging,fMRI)信号中的各种独立成分(包括与实验设计相关的成分以及各种噪声)。与fastICA相比,该算法减少...
关键词：牛顿型算法 独立成分分析 功能磁共振成像 盲源分离 信号 
信息离散性度量方法在SARS病毒研究中的应用被引量：4
《计算机与应用化学》2003年第6期719-723,共5页张文 唐焕文 方伟武 修志龙 
国家自然科学基金(90103033;20176005)
多序列比较是分子生物学中的一个基本问题,本文利用一种新型信息离散性度量方法——FDOD方法,将其应用于SARS病毒研究中,对SARS病毒与已知的三类冠状病毒的复制酶、M蛋白、N蛋白和S蛋白进行了进化分析,得出的系统发育树与现有的生物分...
关键词：信息离散性度量方法 SARS 病毒研究 应用 非典型肺炎 序列比较 信息熵 系统发育 
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