浙江大学农业与生物技术学院生物信息学研究所

作品数：7被引量：23H指数：3
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发文作者：徐飞余世洲蒋蓓蓓更多>>
发文领域：农业科学生物学更多>>
发文主题：英文SNORNA非编码RNA甲基化家蚕基因组更多>>
发文期刊：《中国农业科学》《科学通报》《浙江大学学报（农业与生命科学版）》《Journal of Genetics and Genomics》更多>>
所获基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划福建省自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
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全基因组关联分析研究进展被引量：14
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》2015年第4期385-393,共9页段忠取 朱军 
国家自然科学基金面上项目"作物育种群体基因定位及分子选择育种新方法的研究"(31371250)
全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来兴起的遗传分析方法,在人类和动植物复杂性状遗传研究中已取得初步成果。本文论述了GWAS研究的基本原理、主要分析方法及常用软件,在人类和动植物复杂性状研究中的应用;...
关键词：全基因组关联分析 复杂性状 单核苷酸多态性 关联位点 
烟草核心种质库构建及遗传多样性研究(英文)被引量：1
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》2014年第4期440-450,共11页周佳萍 杨春元 吴春 王仁刚 史跃伟 谢升东 王志红 徐海明 任学良 
Supported by the National Natural Science Foundation of China(No.31271608)
为有效地研究烟草遗传多样性和筛选潜在的繁殖材料,以贵州省烟草科学研究院805份烟草种质为实验材料,分别在贵州省金沙和福泉2个试验点进行多点田间试验,并采用混合线性模型预测12个农艺性状的基因型效应值,以构建烟草的核心种质库并研...
关键词：烟草 遗传多样性 核心种质 基因与环境互作 
基于四交群体的连锁图谱构建(英文)
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》2014年第4期387-396,共10页蒋蓓蓓 余世洲 肖炳光 楼向阳 徐海明 
Supported by the National Natural Science Foundation of China(No.31271608);the Yunnan Provincial Tobacco Company Project(No.08A05);the CNTC Science and Technology Project(No.110200701023);the National Institutes of Health(No.DA025095)
目前,遗传连锁图谱构建主要基于两纯系亲本交配的衍生群体,存在遗传多样性不足等局限,不适合于烟草等基因组多样性较低的物种,因为往往没有足够的多态性标记可用于图谱的构图,稀疏的标记图谱很难有效用于标记辅助选择及基因定位.本研究...
关键词：四交群体 遗传距离 遗传图谱 连锁分析 蒙特卡洛模拟 
通过多基因组比较的方法在5种绿球蓝细菌中识别基因组岛(英文)
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》2010年第5期473-484,共12页刘海岚 朱军 
Project supported by the National High Technology Research and Development Program of China(No.2006AA10A102);U.S.National Science Foundation(No.DBI-0516378)
为探索水平基因转移在绿球蓝细菌基因组多样性中的作用,5个高光适应性绿球蓝细菌基因组被比较.先用BLASTP两两最佳匹配搜索和基因位置保守性的方法预测直系同源基因,并进一步计算每个基因组中所有基因在其他4种绿球蓝细菌基因组中直系...
关键词：绿球蓝细菌 基因组岛 水平基因转移 外源基因 
Influence of Epistasis and QTL×Environment Interaction on Heading Date of Rice(Oryza sativa L.)被引量：3
《Journal of Genetics and Genomics》2007年第7期608-615,共8页刘桂富 杨剑 徐海明 朱军 
QTLs for heading date of rice （Oryza sativa L.） with additive, epistatic, and QTL × environment （QE） interaction effects were studied using a mixed-model-based composite interval mapping （MCIM） method and a dou...
关键词：quantitative trait locus （QTL） EPISTASIS QTL ×environment interaction heading date rice （Oryza sativa L.） 
家蚕基因组中SnoRNA(Box C/D)的生物信息学分析与研究
《中国农业科学》2007年第1期196-203,共8页余东亮 汪旭升 徐飞 傅衍 
国家重点基础研究发展计划"973"项目(2004CB117500)
【目的】探索生物信息方法在家蚕基因组snoRNA预测中的应用,了解snoRNA在家蚕基因组的分布和结构特征。【方法】利用已有和自行设计的生物信息工具对家蚕基因组中BoxC/DsnoRNA进行预测和手工校正。【结果】获到家蚕基因组中的70个snoRNA...
关键词：家蚕(Bombyx mori) BOX C/D SNORNA 甲基化 计算机预测 非编码RNA 
水稻全基因组R基因鉴定及候选RGA标记开发被引量：5
《科学通报》2005年第11期1085-1089,共5页汪旭升 吴为人 金谷雷 朱军 
国家高技术研究发展计划(批准号:2003AA207160,2002AA234031);福建省自然科学基金(批准号:B9910011)资助项目
用45个已知功能的植物抗病(R)基因序列对粳稻全基因组序列进行搜索, 共找出2119个R基因同源序列或类似物(RGA), 表明RGA在水稻基因组中成簇存在, 呈非随机分布. 采用隐马尔柯夫模型(HMM), 将这些RGA按其功能域分成了21类. 将粳稻的RGA...
关键词：RGA 标记 基因鉴定 开发 隐马尔柯夫模型 全基因组序列 水稻基因组 非随机分布 index 亚种间 植物抗病 同源序列 非编码区 行搜索 序列对 类似物 R基因 功能域 多态性 PCR 共显性 粳稻 长度 行比 籼稻 
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